45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1759 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1759  amidinotransferase  100 
 
 		 320 aa  630  1e-180  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.414025  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0020  amidinotransferase  34.88 
 
 		 293 aa  126  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4521  amidinotransferase  34.15 
 
 		 287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3194  amidinotransferase  27.27 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3188  amidinotransferase  27.96 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48840  hypothetical protein  26.62 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.397949  decreased coverage  0.000000000411492 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0993  amidinotransferase  28.25 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1021  amidinotransferase  28.25 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.585434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1011  amidinotransferase  28.25 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22890  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  25.86 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4183  hypothetical protein  26.62 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201687  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0124  dimethylargininase  25.96 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4094  amidinotransferase  25.12 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12346  hypothetical protein  27.82 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2905  Dimethylargininase  25.09 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0765  amidinotransferase  26.21 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1816  Dimethylargininase  28.78 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000313544  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13990  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  25.56 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1802  amidinotransferase  29.71 
 
 		 296 aa  57  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0246  amidinotransferase  42.27 
 
 		 432 aa  56.2  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3943  dimethylargininase  27.2 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.444932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4424  dimethylargininase  27.2 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.991286  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3585  dimethylargininase  27.2 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.849367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2143  dimethylargininase  27.62 
 
 		 256 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434845  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3320  dimethylargininase  27.2 
 
 		 256 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0127  Dimethylargininase  27.42 
 
 		 256 aa  53.5  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3837  dimethylargininase  27.2 
 
 		 252 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.456176  normal  0.996067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1288  amidinotransferase  28.12 
 
 		 290 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.254269  normal  0.122965 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0453  amidinotransferase  28.2 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166592  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1622  hypothetical protein  25.12 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4639  amidinotransferase  27.18 
 
 		 252 aa  49.3  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1316  amidinotransferase  31.48 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2490  Arginine deiminase  37.63 
 
 		 420 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0428  amidinotransferase  23.53 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2100  Dimethylargininase  30.82 
 
 		 257 aa  46.6  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1628  hypothetical protein  23.9 
 
 		 255 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6661  amidinotransferase  30.89 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0754101  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0887  amidinotransferase  27.61 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.766224  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5070  amidinotransferase  27.9 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1877  arginine deiminase  24.81 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2706  amidinotransferase  25.24 
 
 		 286 aa  44.3  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4635  amidinotransferase  29.25 
 
 		 264 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.640839  normal  0.370008 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2115  amidinotransferase  23.58 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  25.75 
 
 		 680 aa  43.1  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2273  hypothetical protein  23.51 
 
 		 703 aa  42.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>