39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4635 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4635  amidinotransferase  100 
 
 		 264 aa  535  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.640839  normal  0.370008 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4183  hypothetical protein  40.94 
 
 		 254 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48840  hypothetical protein  40.94 
 
 		 254 aa  185  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.397949  decreased coverage  0.000000000411492 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2905  Dimethylargininase  39.53 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1622  hypothetical protein  37.25 
 
 		 255 aa  179  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22890  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  37.93 
 
 		 263 aa  178  8e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1628  hypothetical protein  37.25 
 
 		 255 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13990  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  38.4 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4424  dimethylargininase  38.98 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.991286  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3943  dimethylargininase  38.98 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.444932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3585  dimethylargininase  38.98 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.849367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2143  dimethylargininase  38.58 
 
 		 256 aa  164  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434845  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3320  dimethylargininase  38.19 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4094  amidinotransferase  36.68 
 
 		 261 aa  160  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3837  dimethylargininase  37.8 
 
 		 252 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.456176  normal  0.996067 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2396  dimethylargininase  35.18 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0127  Dimethylargininase  34.88 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4639  amidinotransferase  37.01 
 
 		 252 aa  152  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1816  Dimethylargininase  36.11 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000313544  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0124  dimethylargininase  29.86 
 
 		 258 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1658  Dimethylargininase  30.68 
 
 		 262 aa  99.4  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63661  normal  0.0320201 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2100  Dimethylargininase  33.33 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1192  endoribonuclease L-PSP  28.51 
 
 		 387 aa  93.2  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0428  amidinotransferase  29.91 
 
 		 271 aa  87  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4521  amidinotransferase  28.41 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3241  Dimethylargininase  29.74 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0575879  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0020  amidinotransferase  25.83 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289153 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4475  endoribonuclease L-PSP  25 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0329  amidinotransferase family protein  21.93 
 
 		 265 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2842  arginine deiminase  25 
 
 		 407 aa  53.1  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03644  arginine deiminase  25.88 
 
 		 406 aa  48.9  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002421  arginine deiminase  25.49 
 
 		 406 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1775  amidinotransferase  20.52 
 
 		 279 aa  46.6  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00023093  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2672  amidinotransferase  26.05 
 
 		 296 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0565  Arginine deiminase  27.91 
 
 		 453 aa  45.4  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1759  amidinotransferase  29.25 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.414025  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3188  amidinotransferase  23.4 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1802  amidinotransferase  26.92 
 
 		 296 aa  43.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2706  amidinotransferase  24.87 
 
 		 286 aa  42.7  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>