119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0565 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0565  Arginine deiminase  100 
 
 
453 aa  913    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2490  Arginine deiminase  35.96 
 
 
420 aa  246  4e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0348  arginine deiminase  33.41 
 
 
410 aa  231  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0341  arginine deiminase  33.7 
 
 
410 aa  230  4e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0420  arginine deiminase  33.62 
 
 
410 aa  230  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4898  arginine deiminase  33.62 
 
 
410 aa  230  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0407  arginine deiminase  33.7 
 
 
410 aa  230  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.751468 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0472  arginine deiminase  33.41 
 
 
410 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.861863  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0483  arginine deiminase  33.62 
 
 
408 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000467571  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0153  arginine deiminase  31.36 
 
 
405 aa  220  5e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22360  arginine deiminase  31.75 
 
 
406 aa  217  2.9999999999999998e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06650  arginine deiminase  31.02 
 
 
410 aa  216  7e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000122198  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02360  arginine deiminase  31.3 
 
 
417 aa  213  4.9999999999999996e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0263165  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01620  arginine deiminase  32.62 
 
 
407 aa  211  3e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000811385 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06540  arginine deiminase  32.62 
 
 
407 aa  210  4e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00222308  normal  0.406316 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1949  arginine deiminase  30.79 
 
 
405 aa  209  8e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000474348  normal  0.297072 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2659  arginine deiminase  30.94 
 
 
411 aa  209  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2715  arginine deiminase  30.94 
 
 
411 aa  209  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0058  arginine deiminase  31.43 
 
 
407 aa  208  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0902  arginine deiminase  31.37 
 
 
406 aa  207  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1118  arginine deiminase  30.95 
 
 
414 aa  207  4e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00592031  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0181  Arginine deiminase  30.47 
 
 
405 aa  205  1e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1457  arginine deiminase  32.4 
 
 
410 aa  204  3e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00237571  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2250  arginine deiminase  30.94 
 
 
411 aa  202  9.999999999999999e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5202  arginine deiminase  30.8 
 
 
409 aa  202  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0871  arginine deiminase  29.13 
 
 
410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0203728  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0451  arginine deiminase  30.08 
 
 
410 aa  201  3e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0131772  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2163  arginine deiminase  29.72 
 
 
410 aa  199  6e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0445  arginine deiminase  30.39 
 
 
410 aa  197  3e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000529267  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3384  amidinotransferase  29.39 
 
 
410 aa  192  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0258  Arginine deiminase  29.98 
 
 
401 aa  192  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0089  arginine deiminase  29.61 
 
 
403 aa  190  4e-47  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4537  arginine deiminase  31.75 
 
 
418 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.130916  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0245  Arginine deiminase  34.51 
 
 
407 aa  190  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5027  arginine deiminase  32.54 
 
 
436 aa  189  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0721497 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12360  arginine deiminase  33.33 
 
 
410 aa  188  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.440764  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2175  arginine deiminase  31.18 
 
 
407 aa  189  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6447  Arginine deiminase  32.82 
 
 
401 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2384  arginine deiminase  30.56 
 
 
418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427105  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1090  arginine deiminase  30.3 
 
 
419 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.787817 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0157  arginine deiminase  29.83 
 
 
413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0161  arginine deiminase  30.06 
 
 
413 aa  184  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4517  arginine deiminase  31.68 
 
 
419 aa  184  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1968  arginine deiminase  30.34 
 
 
425 aa  183  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1987  arginine deiminase  30.34 
 
 
425 aa  183  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223306  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0915  arginine deiminase  30.34 
 
 
425 aa  183  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.199485  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2800  Arginine deiminase  31.87 
 
 
414 aa  183  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0432  arginine deiminase  30.74 
 
 
409 aa  183  7e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.277961  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1145  arginine deiminase  30.34 
 
 
418 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2128  arginine deiminase  30.34 
 
 
418 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853233  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0244  arginine deiminase  30.34 
 
 
418 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.177329  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1585  arginine deiminase  30.13 
 
 
425 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593064  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2241  arginine deiminase  29.07 
 
 
408 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.420551  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0083  arginine deiminase  32.47 
 
 
415 aa  176  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0146  Arginine deiminase  29.85 
 
 
418 aa  176  7e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.152156  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5911  arginine deiminase  29.96 
 
 
418 aa  176  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68330  arginine deiminase  29.96 
 
 
418 aa  176  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0305167  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03644  arginine deiminase  29.78 
 
 
406 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0096  Arginine deiminase  31.49 
 
 
397 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1993  arginine deiminase  30.32 
 
 
409 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00980  arginine deiminase  32.68 
 
 
418 aa  175  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4276  arginine deiminase  32.19 
 
 
399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4362  arginine deiminase  32.19 
 
 
399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0268184 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4655  arginine deiminase  32.19 
 
 
399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06020  arginine deiminase  32.51 
 
 
409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002421  arginine deiminase  30 
 
 
406 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1391  arginine deiminase  33.5 
 
 
417 aa  172  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00832109  normal  0.639371 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0452  arginine deiminase  30.43 
 
 
406 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0154087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4223  arginine deiminase  31.04 
 
 
417 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0166  arginine deiminase  29.5 
 
 
407 aa  171  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0439  Arginine deiminase  30.24 
 
 
428 aa  170  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1108  arginine deiminase  30.06 
 
 
416 aa  170  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4646  arginine deiminase  27.25 
 
 
408 aa  169  8e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2684  arginine deiminase  29.4 
 
 
418 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1483  arginine deiminase  32.03 
 
 
417 aa  168  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11020  arginine deiminase  31.39 
 
 
402 aa  168  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00481648  normal  0.252626 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6443  arginine deiminase  28.02 
 
 
417 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  0.422069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1923  arginine deiminase  30.6 
 
 
402 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.849208  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4751  arginine deiminase  30.22 
 
 
406 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1001  arginine deiminase  30.53 
 
 
417 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4810  arginine deiminase  30.09 
 
 
402 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1975  arginine deiminase  28.45 
 
 
413 aa  164  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4869  arginine deiminase  30.22 
 
 
406 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.99557  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4721  arginine deiminase  29.35 
 
 
406 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.160752 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4850  arginine deiminase  30.22 
 
 
406 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1877  arginine deiminase  30.47 
 
 
405 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1038  arginine deiminase  30.28 
 
 
417 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4814  arginine deiminase  29.57 
 
 
406 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.514213  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4386  arginine deiminase  31.74 
 
 
418 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252294  normal  0.182376 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2424  arginine deiminase  29.54 
 
 
431 aa  159  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1000  arginine deiminase  30.38 
 
 
419 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07960  arginine deiminase  31.47 
 
 
403 aa  159  7e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000386602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5730  Arginine deiminase  27.52 
 
 
434 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5575  arginine deiminase  31.88 
 
 
405 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf873  arginine deiminase  29.93 
 
 
409 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0521  arginine deiminase  28.04 
 
 
406 aa  156  9e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3978  Arginine deiminase  29.45 
 
 
419 aa  154  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103807  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2842  arginine deiminase  28.23 
 
 
407 aa  153  5.9999999999999996e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0192  Arginine deiminase  25 
 
 
501 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172531  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0746  arginine deiminase  30.03 
 
 
407 aa  147  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0880775 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>