160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3188 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3188  amidinotransferase  100 
 
 
283 aa  593  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2706  amidinotransferase  46.98 
 
 
286 aa  291  1e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0765  amidinotransferase  33.8 
 
 
294 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1775  amidinotransferase  27.3 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00023093  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3194  amidinotransferase  30.77 
 
 
304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0020  amidinotransferase  31.45 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4521  amidinotransferase  32.26 
 
 
287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0453  amidinotransferase  26.84 
 
 
279 aa  90.1  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166592  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0428  amidinotransferase  25.64 
 
 
271 aa  86.7  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0130  amidinotransferase  27.54 
 
 
268 aa  80.1  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1802  amidinotransferase  28.83 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  27.53 
 
 
680 aa  77  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0472  arginine deiminase  24.14 
 
 
410 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.861863  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3814  amidinotransferase  27.21 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4898  arginine deiminase  24.14 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0420  arginine deiminase  24.14 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0348  arginine deiminase  24.52 
 
 
410 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0341  arginine deiminase  24.14 
 
 
410 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0407  arginine deiminase  24.14 
 
 
410 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.751468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1288  amidinotransferase  25.46 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.254269  normal  0.122965 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5166  amidinotransferase  26.72 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4183  hypothetical protein  24.45 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201687  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06650  arginine deiminase  27.03 
 
 
410 aa  70.5  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000122198  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1693  arginine deiminase  24.08 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.309435 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1759  amidinotransferase  27.8 
 
 
320 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.414025  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0329  amidinotransferase family protein  25.46 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6044  amidinotransferase  26.57 
 
 
271 aa  69.3  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.227436  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4276  arginine deiminase  26.07 
 
 
399 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4362  arginine deiminase  26.07 
 
 
399 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0268184 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4655  arginine deiminase  26.07 
 
 
399 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48840  hypothetical protein  24.02 
 
 
254 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.397949  decreased coverage  0.000000000411492 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12360  arginine deiminase  24.43 
 
 
410 aa  68.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.440764  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1316  amidinotransferase  25.18 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2147  amidinotransferase  24.71 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0083  arginine deiminase  27.27 
 
 
415 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0993  amidinotransferase  24.35 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1011  amidinotransferase  24.35 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34213  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1021  amidinotransferase  24.35 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.585434  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12346  hypothetical protein  26.14 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4052  amidinotransferase  24.37 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.043057 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1483  arginine deiminase  25.58 
 
 
417 aa  68.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4810  arginine deiminase  26.3 
 
 
402 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3676  amidinotransferase  24.91 
 
 
271 aa  67  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324715  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5027  arginine deiminase  27.99 
 
 
436 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0721497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2800  Arginine deiminase  24.91 
 
 
414 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5070  amidinotransferase  24.72 
 
 
281 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4517  arginine deiminase  27.99 
 
 
419 aa  67  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0887  amidinotransferase  26.09 
 
 
272 aa  65.5  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.766224  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6661  amidinotransferase  22.93 
 
 
292 aa  65.5  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0754101  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1457  arginine deiminase  25.09 
 
 
410 aa  65.1  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00237571  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0874  arginine deiminase  23.55 
 
 
377 aa  64.7  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00980  arginine deiminase  26.51 
 
 
418 aa  65.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0483  arginine deiminase  24.3 
 
 
408 aa  65.1  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000467571  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1993  arginine deiminase  25.39 
 
 
409 aa  64.7  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0096  Arginine deiminase  26.37 
 
 
397 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4529  amidinotransferase  24.44 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0366  amidinotransferase  26.37 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.95225  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0058  arginine deiminase  23.9 
 
 
407 aa  64.3  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2331  amidinotransferase  29.96 
 
 
264 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0585  amidinotransferase  23.26 
 
 
292 aa  63.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1923  arginine deiminase  25.61 
 
 
402 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.849208  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7970  amidinotransferase  26.57 
 
 
280 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3304  amidinotransferase  24.64 
 
 
356 aa  63.5  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6447  Arginine deiminase  26.59 
 
 
401 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4047  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain-containing protein  22.55 
 
 
703 aa  62.4  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0245  Arginine deiminase  24.02 
 
 
407 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4094  amidinotransferase  23.86 
 
 
261 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0166  arginine deiminase  26.44 
 
 
407 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0780  amidinotransferase  22.97 
 
 
275 aa  60.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2012  amidinotransferase  26.55 
 
 
318 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1816  Dimethylargininase  24.17 
 
 
257 aa  60.1  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000313544  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2664  amidinotransferase  26.26 
 
 
273 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1169  amidinotransferase  25.46 
 
 
278 aa  60.1  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.730709  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5039  amidinotransferase  24.81 
 
 
277 aa  60.1  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2273  hypothetical protein  22.86 
 
 
703 aa  59.7  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2396  dimethylargininase  22.9 
 
 
253 aa  59.3  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3232  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  22.99 
 
 
705 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2659  arginine deiminase  23.28 
 
 
411 aa  58.9  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2715  arginine deiminase  23.28 
 
 
411 aa  58.9  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2672  amidinotransferase  23.77 
 
 
296 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05885  DdaH family protein  23.73 
 
 
304 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.542101  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03350  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  24.2 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_002950  PG0228  DdaH family protein  23.61 
 
 
308 aa  57.4  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1118  arginine deiminase  22.43 
 
 
414 aa  57  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00592031  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22360  arginine deiminase  24.03 
 
 
406 aa  56.6  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2241  arginine deiminase  24.82 
 
 
408 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.420551  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2115  amidinotransferase  25.82 
 
 
342 aa  56.6  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0157  arginine deiminase  23.97 
 
 
413 aa  56.2  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30700  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  25.18 
 
 
279 aa  56.2  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0445  arginine deiminase  22.31 
 
 
410 aa  56.2  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000529267  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2250  arginine deiminase  22.9 
 
 
411 aa  55.8  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4646  arginine deiminase  23.74 
 
 
408 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1455  amidinotransferase  22.26 
 
 
306 aa  55.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.652533  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0871  arginine deiminase  20.75 
 
 
410 aa  54.7  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0203728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0161  arginine deiminase  24.72 
 
 
413 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0902  arginine deiminase  22.92 
 
 
406 aa  54.3  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2163  arginine deiminase  24.52 
 
 
410 aa  53.9  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02360  arginine deiminase  24.72 
 
 
417 aa  52.8  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0263165  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1814  amidinotransferase family protein  21.38 
 
 
275 aa  52.4  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13990  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  23.61 
 
 
263 aa  52.4  0.000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>