45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1455 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1455  amidinotransferase  100 
 
 
306 aa  638    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.652533  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0366  amidinotransferase  77.23 
 
 
304 aa  502  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.95225  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05885  DdaH family protein  64.69 
 
 
304 aa  421  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.542101  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0228  DdaH family protein  46.58 
 
 
308 aa  290  3e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1775  amidinotransferase  30.04 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00023093  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0821  arginine deiminase  25.97 
 
 
319 aa  85.9  7e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.208764  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0329  amidinotransferase family protein  27.59 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2108  amidinotransferase  25 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6526  putative amidinotransferase family protein  20.76 
 
 
333 aa  58.9  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0765  amidinotransferase  24.44 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3188  amidinotransferase  22.26 
 
 
283 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1949  arginine deiminase  24.88 
 
 
405 aa  53.1  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000474348  normal  0.297072 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06540  arginine deiminase  23.38 
 
 
407 aa  52  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00222308  normal  0.406316 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01620  arginine deiminase  23.38 
 
 
407 aa  52  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000811385 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5575  arginine deiminase  25.19 
 
 
405 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1877  arginine deiminase  24.15 
 
 
405 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0181  Arginine deiminase  28.02 
 
 
405 aa  50.8  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2490  Arginine deiminase  22.3 
 
 
420 aa  49.3  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1118  arginine deiminase  23.97 
 
 
414 aa  49.3  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00592031  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2706  amidinotransferase  22.98 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0089  arginine deiminase  26.7 
 
 
403 aa  47.4  0.0003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2800  Arginine deiminase  31.94 
 
 
414 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1975  arginine deiminase  26.37 
 
 
413 aa  46.6  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0432  arginine deiminase  24.64 
 
 
409 aa  46.6  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.277961  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0902  arginine deiminase  24.26 
 
 
406 aa  46.6  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1000  arginine deiminase  25.11 
 
 
419 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1001  arginine deiminase  26.2 
 
 
417 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0445  arginine deiminase  23.68 
 
 
410 aa  45.8  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000529267  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0428  amidinotransferase  24.11 
 
 
271 aa  45.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2684  arginine deiminase  24.64 
 
 
418 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22360  arginine deiminase  24.88 
 
 
406 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1038  arginine deiminase  26.21 
 
 
417 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4639  amidinotransferase  22.58 
 
 
252 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266629  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5911  arginine deiminase  26.75 
 
 
418 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2163  arginine deiminase  25.73 
 
 
410 aa  43.9  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0348  arginine deiminase  25.19 
 
 
410 aa  43.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf873  arginine deiminase  24.19 
 
 
409 aa  43.5  0.005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4386  arginine deiminase  25.62 
 
 
418 aa  43.5  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252294  normal  0.182376 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4850  arginine deiminase  23.88 
 
 
406 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4869  arginine deiminase  23.88 
 
 
406 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.99557  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4751  arginine deiminase  23.88 
 
 
406 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1457  arginine deiminase  23.15 
 
 
410 aa  43.1  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00237571  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0472  arginine deiminase  24.91 
 
 
410 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.861863  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0452  arginine deiminase  23.6 
 
 
406 aa  42.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0154087 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4721  arginine deiminase  23.51 
 
 
406 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.160752 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>