47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6526 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6526  putative amidinotransferase family protein  100 
 
 
333 aa  666    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2108  amidinotransferase  60.31 
 
 
323 aa  386  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0821  arginine deiminase  25.95 
 
 
319 aa  85.5  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.208764  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05885  DdaH family protein  22.94 
 
 
304 aa  77  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.542101  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0873  amidinotransferase family protein  23.4 
 
 
366 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0977  non-specific serine/threonine protein kinase  25.78 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3760  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.44 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.408219  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3649  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.44 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0815674 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1964  non-specific serine/threonine protein kinase  24.14 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3451  non-specific serine/threonine protein kinase  25.09 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.103765 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1775  amidinotransferase  23.15 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00023093  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2021  Scyllo-inosamine-4-phosphate amidinotransferase  23.86 
 
 
361 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962087  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7150  amidinotransferase  25.09 
 
 
395 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2321  amidinotransferase  22.89 
 
 
386 aa  63.2  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187783  normal  0.819339 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0366  amidinotransferase  20.06 
 
 
304 aa  62.4  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.95225  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6335  non-specific serine/threonine protein kinase  25.09 
 
 
409 aa  62  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00816839 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1455  amidinotransferase  20.76 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.652533  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2706  amidinotransferase  27.27 
 
 
286 aa  56.2  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2444  Scyllo-inosamine-4-phosphate amidinotransferase  23.64 
 
 
375 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.128556 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2905  Dimethylargininase  28.08 
 
 
258 aa  55.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0228  DdaH family protein  25.88 
 
 
308 aa  55.1  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1816  Dimethylargininase  33.11 
 
 
257 aa  53.5  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000313544  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4094  amidinotransferase  30.2 
 
 
261 aa  53.1  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3009  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.29 
 
 
364 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169976  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2924  scyllo-inosamine-4-phosphate amidinotransferase  22.44 
 
 
384 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3188  amidinotransferase  28.21 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1716  scyllo-inosamine-4-phosphate amidinotransferase  21.37 
 
 
384 aa  50.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.528511  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0124  dimethylargininase  27.21 
 
 
258 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13990  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  28.28 
 
 
263 aa  50.4  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3837  dimethylargininase  30.41 
 
 
252 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.456176  normal  0.996067 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0016  glycine amidinotransferase  22.34 
 
 
369 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2143  dimethylargininase  30.41 
 
 
256 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434845  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3320  dimethylargininase  29.73 
 
 
256 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0329  amidinotransferase family protein  25.45 
 
 
265 aa  46.6  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3943  dimethylargininase  29.73 
 
 
256 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.444932  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3585  dimethylargininase  29.73 
 
 
256 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.849367  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4424  dimethylargininase  29.73 
 
 
256 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.991286  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2396  dimethylargininase  26.21 
 
 
253 aa  46.2  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4183  hypothetical protein  28.28 
 
 
254 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201687  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4639  amidinotransferase  27.59 
 
 
252 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266629  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0765  amidinotransferase  26.51 
 
 
294 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4475  endoribonuclease L-PSP  27.7 
 
 
368 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0127  Dimethylargininase  29.66 
 
 
256 aa  44.3  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1628  hypothetical protein  24.83 
 
 
255 aa  43.5  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3194  amidinotransferase  25.45 
 
 
304 aa  43.5  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48840  hypothetical protein  27.59 
 
 
254 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.397949  decreased coverage  0.000000000411492 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22890  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  25.52 
 
 
263 aa  42.7  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>