56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3194 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3194  amidinotransferase  100 
 
 
304 aa  631  1e-180  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0765  amidinotransferase  37.98 
 
 
294 aa  203  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3188  amidinotransferase  30.77 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2706  amidinotransferase  28.94 
 
 
286 aa  135  7.000000000000001e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0020  amidinotransferase  26.4 
 
 
293 aa  87  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4521  amidinotransferase  28.05 
 
 
287 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1759  amidinotransferase  27.27 
 
 
320 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.414025  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1775  amidinotransferase  22.49 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00023093  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4052  amidinotransferase  26.03 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.043057 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0428  amidinotransferase  21.99 
 
 
271 aa  65.5  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3676  amidinotransferase  25.62 
 
 
271 aa  63.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324715  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0993  amidinotransferase  25.53 
 
 
272 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1021  amidinotransferase  25.53 
 
 
272 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.585434  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1011  amidinotransferase  25.53 
 
 
272 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34213  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7970  amidinotransferase  26.64 
 
 
280 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5166  amidinotransferase  25.77 
 
 
305 aa  56.6  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48840  hypothetical protein  24.48 
 
 
254 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.397949  decreased coverage  0.000000000411492 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3304  amidinotransferase  25.81 
 
 
356 aa  54.7  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2800  Arginine deiminase  23.7 
 
 
414 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4183  hypothetical protein  24.38 
 
 
254 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201687  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1816  Dimethylargininase  29.01 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000313544  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2100  Dimethylargininase  26.64 
 
 
257 aa  53.5  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0127  Dimethylargininase  24.48 
 
 
256 aa  52.8  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1993  arginine deiminase  25.45 
 
 
409 aa  52.8  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4047  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain-containing protein  23.58 
 
 
703 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1802  amidinotransferase  24.8 
 
 
296 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2273  hypothetical protein  23.18 
 
 
703 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1693  arginine deiminase  24.89 
 
 
325 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.309435 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1658  Dimethylargininase  28.69 
 
 
262 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63661  normal  0.0320201 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4094  amidinotransferase  29.32 
 
 
261 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6661  amidinotransferase  22.22 
 
 
292 aa  50.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0754101  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4646  arginine deiminase  26.52 
 
 
408 aa  49.7  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2244  amidinotransferase  23.65 
 
 
276 aa  49.7  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.510972 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2905  Dimethylargininase  30.71 
 
 
258 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13990  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  31.82 
 
 
263 aa  47.4  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1877  arginine deiminase  26.39 
 
 
405 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2331  amidinotransferase  24.49 
 
 
264 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2672  amidinotransferase  22.98 
 
 
296 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1622  hypothetical protein  22.88 
 
 
255 aa  47  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2175  arginine deiminase  24.73 
 
 
407 aa  47  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0453  amidinotransferase  25.41 
 
 
279 aa  45.8  0.0009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166592  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2684  arginine deiminase  24 
 
 
418 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2115  amidinotransferase  24.18 
 
 
342 aa  45.4  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0585  amidinotransferase  22.98 
 
 
292 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22890  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  23.95 
 
 
263 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3232  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  21.23 
 
 
705 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2108  amidinotransferase  26.11 
 
 
323 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06020  arginine deiminase  23.75 
 
 
409 aa  44.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1628  hypothetical protein  22.46 
 
 
255 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0130  amidinotransferase  21.88 
 
 
268 aa  43.5  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6526  putative amidinotransferase family protein  25.45 
 
 
333 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0887  amidinotransferase  28.7 
 
 
272 aa  43.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.766224  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5575  arginine deiminase  25.67 
 
 
405 aa  43.5  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1483  arginine deiminase  24.61 
 
 
417 aa  42.7  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4537  arginine deiminase  24.44 
 
 
418 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.130916  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3467  amidinotransferase  22.71 
 
 
294 aa  42.7  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.501017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>