113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1693 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1693  arginine deiminase  100 
 
 		 325 aa  666    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.309435 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0483  arginine deiminase  23.27 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000467571  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0902  arginine deiminase  29.13 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0089  arginine deiminase  23.72 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0058  arginine deiminase  22.73 
 
 		 407 aa  75.9  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0020  amidinotransferase  22.51 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4521  amidinotransferase  23.43 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3188  amidinotransferase  24.08 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4537  arginine deiminase  23.64 
 
 		 418 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.130916  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0348  arginine deiminase  24.57 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1775  amidinotransferase  25.22 
 
 		 279 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00023093  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4646  arginine deiminase  22.3 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0420  arginine deiminase  25 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4898  arginine deiminase  25 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0341  arginine deiminase  25.6 
 
 		 410 aa  62.8  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0407  arginine deiminase  25.6 
 
 		 410 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.751468 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2706  amidinotransferase  20.72 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0472  arginine deiminase  24.66 
 
 		 410 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.861863  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2115  amidinotransferase  24.86 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0161  arginine deiminase  27.59 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf873  arginine deiminase  22.5 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1483  arginine deiminase  39.44 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1038  arginine deiminase  24.48 
 
 		 417 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1000  arginine deiminase  23.39 
 
 		 419 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2684  arginine deiminase  21.88 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4223  arginine deiminase  24.23 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0258  Arginine deiminase  23.37 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0871  arginine deiminase  21.94 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0203728  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06650  arginine deiminase  22.03 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000122198  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1923  arginine deiminase  39.73 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.849208  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0565  Arginine deiminase  27.46 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4276  arginine deiminase  42.86 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4362  arginine deiminase  42.86 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0268184 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4655  arginine deiminase  42.86 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1145  arginine deiminase  22.34 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2128  arginine deiminase  22.34 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68330  arginine deiminase  22.29 
 
 		 418 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0305167  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1585  arginine deiminase  22.34 
 
 		 425 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0244  arginine deiminase  22.34 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.177329  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1968  arginine deiminase  22.34 
 
 		 425 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1987  arginine deiminase  22.34 
 
 		 425 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223306  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0915  arginine deiminase  22.34 
 
 		 425 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.199485  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5911  arginine deiminase  22.61 
 
 		 418 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6443  arginine deiminase  22.55 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  0.422069 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1001  arginine deiminase  23.97 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4386  arginine deiminase  22.6 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252294  normal  0.182376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2800  Arginine deiminase  24.09 
 
 		 414 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4814  arginine deiminase  23.96 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.514213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4721  arginine deiminase  24.28 
 
 		 406 aa  55.8  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.160752 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11020  arginine deiminase  39.19 
 
 		 402 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00481648  normal  0.252626 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1975  arginine deiminase  21.5 
 
 		 413 aa  55.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4869  arginine deiminase  23.96 
 
 		 406 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.99557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4751  arginine deiminase  24.28 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4850  arginine deiminase  23.96 
 
 		 406 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3978  Arginine deiminase  28.36 
 
 		 419 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1391  arginine deiminase  23.1 
 
 		 417 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00832109  normal  0.639371 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1090  arginine deiminase  23.21 
 
 		 419 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.787817 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4517  arginine deiminase  36.62 
 
 		 419 aa  53.1  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2384  arginine deiminase  21.25 
 
 		 418 aa  52.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427105  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0451  arginine deiminase  40.91 
 
 		 410 aa  52.8  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0131772  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2659  arginine deiminase  24.09 
 
 		 411 aa  52.8  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2715  arginine deiminase  24.09 
 
 		 411 aa  52.8  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0157  arginine deiminase  25.78 
 
 		 413 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3194  amidinotransferase  24.89 
 
 		 304 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06020  arginine deiminase  35.82 
 
 		 409 aa  52  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2250  arginine deiminase  23.38 
 
 		 411 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6447  Arginine deiminase  42.11 
 
 		 401 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0096  Arginine deiminase  23.43 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5027  arginine deiminase  35.21 
 
 		 436 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0721497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0083  arginine deiminase  41.94 
 
 		 415 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0181  Arginine deiminase  42.03 
 
 		 405 aa  50.8  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3384  amidinotransferase  24.22 
 
 		 410 aa  50.8  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1118  arginine deiminase  21.89 
 
 		 414 aa  50.4  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00592031  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00980  arginine deiminase  40.32 
 
 		 418 aa  50.4  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5730  Arginine deiminase  24.62 
 
 		 434 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0166  arginine deiminase  37.31 
 
 		 407 aa  50.1  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4810  arginine deiminase  42.86 
 
 		 402 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03644  arginine deiminase  21.51 
 
 		 406 aa  49.7  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2163  arginine deiminase  23.74 
 
 		 410 aa  49.3  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2241  arginine deiminase  23.37 
 
 		 408 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.420551  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0452  arginine deiminase  23.66 
 
 		 406 aa  48.9  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0154087 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1089  amidinotransferase  20.22 
 
 		 415 aa  48.9  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.108871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1457  arginine deiminase  37.88 
 
 		 410 aa  48.5  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00237571  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0245  Arginine deiminase  33.78 
 
 		 407 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12360  arginine deiminase  22.01 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.440764  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002421  arginine deiminase  22.51 
 
 		 406 aa  48.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2742  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  23.28 
 
 		 705 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3360  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  23.28 
 
 		 705 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0297131  normal  0.880976 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0146  Arginine deiminase  23.08 
 
 		 418 aa  47.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.152156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2273  hypothetical protein  22.98 
 
 		 703 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02360  arginine deiminase  32.63 
 
 		 417 aa  47  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0263165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0153  arginine deiminase  36.49 
 
 		 405 aa  47.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1993  arginine deiminase  22.22 
 
 		 409 aa  46.6  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2490  Arginine deiminase  20.9 
 
 		 420 aa  47  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1108  arginine deiminase  24 
 
 		 416 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01620  arginine deiminase  35.06 
 
 		 407 aa  46.6  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000811385 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06540  arginine deiminase  35.06 
 
 		 407 aa  46.6  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00222308  normal  0.406316 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2424  arginine deiminase  22.47 
 
 		 431 aa  46.6  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1949  arginine deiminase  21.61 
 
 		 405 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000474348  normal  0.297072 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5166  amidinotransferase  21.24 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>