63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4183 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4183  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  523  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48840  hypothetical protein  96.46 
 
 		 254 aa  507  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.397949  decreased coverage  0.000000000411492 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2905  Dimethylargininase  60 
 
 		 258 aa  321  6e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13990  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  58.43 
 
 		 263 aa  317  2e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0127  Dimethylargininase  58.98 
 
 		 256 aa  310  1e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22890  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  56.47 
 
 		 263 aa  300  2e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1628  hypothetical protein  50.59 
 
 		 255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1622  hypothetical protein  49.41 
 
 		 255 aa  278  4e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1816  Dimethylargininase  46.85 
 
 		 257 aa  241  9e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000313544  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4094  amidinotransferase  41.02 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2143  dimethylargininase  43.75 
 
 		 256 aa  202  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434845  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4424  dimethylargininase  43.36 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.991286  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3943  dimethylargininase  43.36 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.444932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3585  dimethylargininase  43.36 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.849367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3320  dimethylargininase  42.58 
 
 		 256 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3837  dimethylargininase  42.19 
 
 		 252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.456176  normal  0.996067 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4639  amidinotransferase  41.41 
 
 		 252 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2396  dimethylargininase  37.94 
 
 		 253 aa  192  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4635  amidinotransferase  40.94 
 
 		 264 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.640839  normal  0.370008 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0124  dimethylargininase  32.16 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1658  Dimethylargininase  34.77 
 
 		 262 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63661  normal  0.0320201 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2100  Dimethylargininase  32.76 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0428  amidinotransferase  29.78 
 
 		 271 aa  105  7e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3241  Dimethylargininase  33.17 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0575879  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1192  endoribonuclease L-PSP  26.36 
 
 		 387 aa  95.1  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0020  amidinotransferase  25.56 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4521  amidinotransferase  26.2 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4475  endoribonuclease L-PSP  23.01 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1775  amidinotransferase  25.22 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00023093  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3188  amidinotransferase  24.45 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1759  amidinotransferase  26.62 
 
 		 320 aa  62  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.414025  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  26.36 
 
 		 680 aa  56.6  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2108  amidinotransferase  29.41 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0329  amidinotransferase family protein  23.81 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3194  amidinotransferase  24.38 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0765  amidinotransferase  22.04 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2672  amidinotransferase  25.2 
 
 		 296 aa  53.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1802  amidinotransferase  28.12 
 
 		 296 aa  52.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4047  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain-containing protein  21.88 
 
 		 703 aa  52  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3232  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  22.27 
 
 		 705 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0585  amidinotransferase  27.2 
 
 		 292 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1316  amidinotransferase  24.47 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3854  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  23.14 
 
 		 704 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0246  amidinotransferase  31.63 
 
 		 432 aa  49.3  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0453  amidinotransferase  24.83 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2424  arginine deiminase  24.7 
 
 		 431 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6044  amidinotransferase  23.53 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.227436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0130  amidinotransferase  23.08 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2273  hypothetical protein  22.05 
 
 		 703 aa  46.2  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4659  hypothetical protein  23.21 
 
 		 703 aa  46.2  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0175942 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5202  arginine deiminase  23.81 
 
 		 409 aa  46.2  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06020  arginine deiminase  26.09 
 
 		 409 aa  45.8  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6526  putative amidinotransferase family protein  28.28 
 
 		 333 aa  45.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12346  hypothetical protein  24.14 
 
 		 302 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1288  amidinotransferase  24.77 
 
 		 290 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.254269  normal  0.122965 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3676  amidinotransferase  25.34 
 
 		 271 aa  45.4  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0993  amidinotransferase  23.33 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1021  amidinotransferase  23.33 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.585434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1011  amidinotransferase  23.33 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3360  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  21.97 
 
 		 705 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0297131  normal  0.880976 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2742  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  21.97 
 
 		 705 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0902  arginine deiminase  28.22 
 
 		 406 aa  43.5  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4052  amidinotransferase  24.66 
 
 		 269 aa  42.4  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.043057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>