90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0246 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0246  amidinotransferase  100 
 
 
432 aa  872    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1089  amidinotransferase  39.58 
 
 
415 aa  300  4e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.108871  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2115  amidinotransferase  34.04 
 
 
342 aa  224  3e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0258  Arginine deiminase  26.07 
 
 
401 aa  67.4  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0445  arginine deiminase  22.38 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000529267  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2250  arginine deiminase  24.41 
 
 
411 aa  66.6  0.0000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3384  amidinotransferase  23.11 
 
 
410 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2715  arginine deiminase  23.88 
 
 
411 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2659  arginine deiminase  23.88 
 
 
411 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06540  arginine deiminase  26.87 
 
 
407 aa  63.9  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00222308  normal  0.406316 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01620  arginine deiminase  26.87 
 
 
407 aa  64.3  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000811385 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1993  arginine deiminase  25.11 
 
 
409 aa  61.6  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0902  arginine deiminase  23.48 
 
 
406 aa  61.6  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02360  arginine deiminase  24.41 
 
 
417 aa  61.2  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0263165  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2175  arginine deiminase  25 
 
 
407 aa  60.1  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0874  arginine deiminase  24.87 
 
 
377 aa  59.3  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2684  arginine deiminase  25.16 
 
 
418 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1118  arginine deiminase  22.17 
 
 
414 aa  58.9  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00592031  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0439  Arginine deiminase  26.61 
 
 
428 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0089  arginine deiminase  23.8 
 
 
403 aa  57  0.0000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4537  arginine deiminase  24.2 
 
 
418 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.130916  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0096  Arginine deiminase  27.13 
 
 
397 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1759  amidinotransferase  42.27 
 
 
320 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.414025  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4646  arginine deiminase  26.81 
 
 
408 aa  56.2  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6447  Arginine deiminase  26.76 
 
 
401 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2706  amidinotransferase  22.18 
 
 
286 aa  55.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1585  arginine deiminase  25.05 
 
 
425 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593064  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1968  arginine deiminase  25.05 
 
 
425 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1987  arginine deiminase  25.05 
 
 
425 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223306  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0915  arginine deiminase  25.05 
 
 
425 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.199485  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0157  arginine deiminase  27.46 
 
 
413 aa  55.1  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2128  arginine deiminase  25.05 
 
 
418 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853233  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0161  arginine deiminase  27.87 
 
 
413 aa  55.1  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1145  arginine deiminase  25.05 
 
 
418 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0244  arginine deiminase  25.05 
 
 
418 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.177329  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6443  arginine deiminase  23.94 
 
 
417 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  0.422069 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2384  arginine deiminase  25.05 
 
 
418 aa  54.3  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0058  arginine deiminase  23.5 
 
 
407 aa  53.9  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2163  arginine deiminase  26.94 
 
 
410 aa  53.9  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0428  amidinotransferase  23.68 
 
 
271 aa  53.5  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5202  arginine deiminase  24.95 
 
 
409 aa  53.1  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0432  arginine deiminase  25.26 
 
 
409 aa  53.1  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.277961  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06650  arginine deiminase  24.91 
 
 
410 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000122198  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0181  Arginine deiminase  23.97 
 
 
405 aa  52.4  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0083  arginine deiminase  25.71 
 
 
415 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf873  arginine deiminase  25.53 
 
 
409 aa  52.4  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4362  arginine deiminase  25.38 
 
 
399 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0268184 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0483  arginine deiminase  21.15 
 
 
408 aa  51.6  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000467571  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4655  arginine deiminase  25.38 
 
 
399 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0746  arginine deiminase  29.05 
 
 
407 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0880775 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0521  arginine deiminase  22.41 
 
 
406 aa  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4276  arginine deiminase  25.38 
 
 
399 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4517  arginine deiminase  25.33 
 
 
419 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5575  arginine deiminase  26.89 
 
 
405 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2490  Arginine deiminase  26.71 
 
 
420 aa  50.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1457  arginine deiminase  26.76 
 
 
410 aa  50.1  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00237571  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07960  arginine deiminase  26.12 
 
 
403 aa  50.1  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000386602 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1923  arginine deiminase  24.19 
 
 
402 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.849208  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5911  arginine deiminase  23.67 
 
 
418 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4183  hypothetical protein  31.63 
 
 
254 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201687  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2241  arginine deiminase  28.15 
 
 
408 aa  49.3  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.420551  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1975  arginine deiminase  24.68 
 
 
413 aa  49.3  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4751  arginine deiminase  23.68 
 
 
406 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3188  amidinotransferase  22.71 
 
 
283 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68330  arginine deiminase  23.45 
 
 
418 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0305167  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48840  hypothetical protein  30.61 
 
 
254 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.397949  decreased coverage  0.000000000411492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4386  arginine deiminase  24.95 
 
 
418 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252294  normal  0.182376 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1000  arginine deiminase  27.42 
 
 
419 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4850  arginine deiminase  23.68 
 
 
406 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4869  arginine deiminase  23.68 
 
 
406 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.99557  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4721  arginine deiminase  23.47 
 
 
406 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.160752 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1877  arginine deiminase  25.9 
 
 
405 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2905  Dimethylargininase  25.52 
 
 
258 aa  47  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2100  Dimethylargininase  35.37 
 
 
257 aa  47.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4814  arginine deiminase  23.68 
 
 
406 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.514213  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1108  arginine deiminase  22.88 
 
 
416 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0452  arginine deiminase  23.47 
 
 
406 aa  47  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0154087 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22890  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  31.48 
 
 
263 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1090  arginine deiminase  22.98 
 
 
419 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.787817 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00980  arginine deiminase  28.77 
 
 
418 aa  45.8  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4223  arginine deiminase  27.24 
 
 
417 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0020  amidinotransferase  25.84 
 
 
293 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289153 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1816  Dimethylargininase  31.63 
 
 
257 aa  45.1  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000313544  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2800  Arginine deiminase  23.74 
 
 
414 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0146  Arginine deiminase  26.06 
 
 
418 aa  44.3  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.152156  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1483  arginine deiminase  23.75 
 
 
417 aa  44.3  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0565  Arginine deiminase  27.03 
 
 
453 aa  44.3  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4094  amidinotransferase  30.38 
 
 
261 aa  43.1  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1001  arginine deiminase  26.77 
 
 
417 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0765  amidinotransferase  25.89 
 
 
294 aa  43.1  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>