63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12346 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12346  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  619  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1288  amidinotransferase  68.31 
 
 
290 aa  386  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.254269  normal  0.122965 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5070  amidinotransferase  69.89 
 
 
281 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0993  amidinotransferase  68.4 
 
 
272 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1021  amidinotransferase  68.4 
 
 
272 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.585434  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1011  amidinotransferase  68.4 
 
 
272 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34213  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  62.08 
 
 
680 aa  333  3e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0887  amidinotransferase  57.85 
 
 
272 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.766224  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7970  amidinotransferase  55.39 
 
 
280 aa  300  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3676  amidinotransferase  55.98 
 
 
271 aa  298  9e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324715  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4052  amidinotransferase  55 
 
 
269 aa  297  1e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.043057 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0453  amidinotransferase  58.65 
 
 
279 aa  295  4e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166592  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2012  amidinotransferase  54.32 
 
 
318 aa  292  4e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3814  amidinotransferase  56.77 
 
 
285 aa  292  5e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2147  amidinotransferase  56.81 
 
 
278 aa  291  8e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0780  amidinotransferase  55.89 
 
 
275 aa  287  1e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30700  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  54.85 
 
 
279 aa  288  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4529  amidinotransferase  54.89 
 
 
269 aa  281  8.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2664  amidinotransferase  54.17 
 
 
273 aa  279  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6044  amidinotransferase  54.89 
 
 
271 aa  279  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.227436  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1316  amidinotransferase  55.11 
 
 
302 aa  278  8e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1169  amidinotransferase  52.26 
 
 
278 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.730709  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6661  amidinotransferase  53.64 
 
 
292 aa  273  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0754101  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2331  amidinotransferase  54.02 
 
 
264 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5039  amidinotransferase  54.24 
 
 
277 aa  267  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03350  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  54.14 
 
 
270 aa  262  4.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2244  amidinotransferase  51.55 
 
 
276 aa  248  8e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.510972 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3304  amidinotransferase  47.42 
 
 
356 aa  245  4.9999999999999997e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0130  amidinotransferase  47.08 
 
 
268 aa  235  6e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3360  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  37.74 
 
 
705 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0297131  normal  0.880976 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2742  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  37.74 
 
 
705 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3854  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  37.36 
 
 
704 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3232  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  37.45 
 
 
705 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1802  amidinotransferase  41.24 
 
 
296 aa  159  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4659  hypothetical protein  35.58 
 
 
703 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0175942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2273  hypothetical protein  36.23 
 
 
703 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4047  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain-containing protein  34.72 
 
 
703 aa  151  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0382  amidinotransferase family protein  34.07 
 
 
275 aa  151  1e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0222666  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1814  amidinotransferase family protein  34.07 
 
 
275 aa  151  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3467  amidinotransferase  34.89 
 
 
294 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.501017  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2672  amidinotransferase  33.95 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0585  amidinotransferase  33.58 
 
 
292 aa  129  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1775  amidinotransferase  23.05 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00023093  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5166  amidinotransferase  29.37 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3188  amidinotransferase  26.3 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0329  amidinotransferase family protein  22.62 
 
 
265 aa  59.3  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0124  dimethylargininase  24.79 
 
 
258 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1759  amidinotransferase  28 
 
 
320 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.414025  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2706  amidinotransferase  25.45 
 
 
286 aa  58.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3241  Dimethylargininase  29.17 
 
 
258 aa  57  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0575879  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1658  Dimethylargininase  25.1 
 
 
262 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63661  normal  0.0320201 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2100  Dimethylargininase  27.86 
 
 
257 aa  53.5  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2396  dimethylargininase  27.08 
 
 
253 aa  48.9  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0020  amidinotransferase  27.09 
 
 
293 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289153 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48840  hypothetical protein  24.57 
 
 
254 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.397949  decreased coverage  0.000000000411492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4521  amidinotransferase  25.57 
 
 
287 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0127  Dimethylargininase  23.97 
 
 
256 aa  48.1  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0428  amidinotransferase  22.55 
 
 
271 aa  46.2  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1816  Dimethylargininase  22.78 
 
 
257 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000313544  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4183  hypothetical protein  24.14 
 
 
254 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201687  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22890  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  23.38 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4094  amidinotransferase  22.27 
 
 
261 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1192  endoribonuclease L-PSP  22.98 
 
 
387 aa  43.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>