141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0329 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0329  amidinotransferase family protein  100 
 
 
265 aa  527  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1775  amidinotransferase  33.09 
 
 
279 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00023093  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1455  amidinotransferase  28.35 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.652533  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0366  amidinotransferase  29.18 
 
 
304 aa  82.4  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.95225  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0130  amidinotransferase  23.31 
 
 
268 aa  82  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4639  amidinotransferase  24.45 
 
 
252 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266629  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0228  DdaH family protein  25.1 
 
 
308 aa  79  0.00000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0821  arginine deiminase  25.83 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.208764  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0765  amidinotransferase  22.74 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1118  arginine deiminase  25.72 
 
 
414 aa  76.3  0.0000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00592031  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4424  dimethylargininase  23.58 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.991286  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3943  dimethylargininase  23.58 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.444932  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3585  dimethylargininase  23.58 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.849367  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05885  DdaH family protein  26.67 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.542101  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3188  amidinotransferase  26.2 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2100  Dimethylargininase  22.55 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2147  amidinotransferase  22.69 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0993  amidinotransferase  23.85 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1011  amidinotransferase  23.85 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34213  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1021  amidinotransferase  23.85 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.585434  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1622  hypothetical protein  24.14 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3320  dimethylargininase  23.14 
 
 
256 aa  72  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1628  hypothetical protein  24.71 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0124  dimethylargininase  21.6 
 
 
258 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1816  Dimethylargininase  22.27 
 
 
257 aa  72  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000313544  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2331  amidinotransferase  24.88 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0887  amidinotransferase  22.01 
 
 
272 aa  71.6  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.766224  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3676  amidinotransferase  20.85 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324715  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3837  dimethylargininase  22.71 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.456176  normal  0.996067 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1658  Dimethylargininase  23.93 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63661  normal  0.0320201 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  24.71 
 
 
680 aa  70.1  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2664  amidinotransferase  23.72 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3814  amidinotransferase  23.32 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2143  dimethylargininase  22.71 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434845  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4052  amidinotransferase  21.76 
 
 
269 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.043057 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2905  Dimethylargininase  25.09 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22890  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  25.42 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0428  amidinotransferase  25.97 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1169  amidinotransferase  26.72 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.730709  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0058  arginine deiminase  28.57 
 
 
407 aa  67  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0445  arginine deiminase  34.78 
 
 
410 aa  66.2  0.0000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000529267  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3360  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  25.53 
 
 
705 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0297131  normal  0.880976 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2742  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  25.53 
 
 
705 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2396  dimethylargininase  24.23 
 
 
253 aa  65.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12346  hypothetical protein  21.6 
 
 
302 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4183  hypothetical protein  23.81 
 
 
254 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201687  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6661  amidinotransferase  20.38 
 
 
292 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0754101  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5070  amidinotransferase  23.15 
 
 
281 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2706  amidinotransferase  23.81 
 
 
286 aa  62.8  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1288  amidinotransferase  22.94 
 
 
290 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.254269  normal  0.122965 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4094  amidinotransferase  20.68 
 
 
261 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0483  arginine deiminase  27.57 
 
 
408 aa  61.6  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000467571  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0089  arginine deiminase  24.02 
 
 
403 aa  60.8  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48840  hypothetical protein  22.52 
 
 
254 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.397949  decreased coverage  0.000000000411492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7970  amidinotransferase  23.37 
 
 
280 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0127  Dimethylargininase  22.59 
 
 
256 aa  60.1  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1316  amidinotransferase  21.35 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2490  Arginine deiminase  26.36 
 
 
420 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3232  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  22.13 
 
 
705 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2115  amidinotransferase  21.98 
 
 
342 aa  57.4  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4047  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain-containing protein  23.4 
 
 
703 aa  56.6  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0420  arginine deiminase  24.22 
 
 
410 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4898  arginine deiminase  24.22 
 
 
410 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3854  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  22.98 
 
 
704 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0472  arginine deiminase  24.22 
 
 
410 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.861863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0341  arginine deiminase  24.22 
 
 
410 aa  56.2  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0407  arginine deiminase  24.22 
 
 
410 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.751468 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1993  arginine deiminase  25.13 
 
 
409 aa  55.5  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13990  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  21.8 
 
 
263 aa  55.5  0.0000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6044  amidinotransferase  20.08 
 
 
271 aa  55.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.227436  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1975  arginine deiminase  20.7 
 
 
413 aa  55.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0258  Arginine deiminase  27.89 
 
 
401 aa  55.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03350  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  22.1 
 
 
270 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2273  hypothetical protein  22.98 
 
 
703 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12360  arginine deiminase  21.12 
 
 
410 aa  55.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.440764  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4635  amidinotransferase  21.93 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.640839  normal  0.370008 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3649  Non-specific serine/threonine protein kinase  21.72 
 
 
393 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0815674 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30700  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  19.56 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0348  arginine deiminase  23.83 
 
 
410 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2244  amidinotransferase  20.23 
 
 
276 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.510972 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0565  Arginine deiminase  26.06 
 
 
453 aa  53.9  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3384  amidinotransferase  25.29 
 
 
410 aa  53.5  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6447  Arginine deiminase  25.74 
 
 
401 aa  52.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1814  amidinotransferase family protein  23.3 
 
 
275 aa  52  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4659  hypothetical protein  22.13 
 
 
703 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0175942 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0902  arginine deiminase  23.23 
 
 
406 aa  50.8  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0382  amidinotransferase family protein  23.3 
 
 
275 aa  51.2  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0222666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2800  Arginine deiminase  23.9 
 
 
414 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1457  arginine deiminase  26.95 
 
 
410 aa  50.8  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00237571  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0521  arginine deiminase  24.15 
 
 
406 aa  51.2  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00980  arginine deiminase  23.19 
 
 
418 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2108  amidinotransferase  24.2 
 
 
323 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0166  arginine deiminase  22.22 
 
 
407 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2163  arginine deiminase  24.7 
 
 
410 aa  50.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3304  amidinotransferase  20.22 
 
 
356 aa  49.7  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2842  arginine deiminase  25.76 
 
 
407 aa  50.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5575  arginine deiminase  21.48 
 
 
405 aa  48.9  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6526  putative amidinotransferase family protein  25.34 
 
 
333 aa  48.9  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4517  arginine deiminase  25.38 
 
 
419 aa  48.9  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6443  arginine deiminase  23.74 
 
 
417 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  0.422069 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>