240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0324 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0324  muramidase  100 
 
 		 436 aa  835    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.161977  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0326  muramidase  79.25 
 
 		 372 aa  187  4e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000174883  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3231  Peptidoglycan-binding LysM  38.73 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0309569 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  44.86 
 
 		 568 aa  73.9  0.000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  45.37 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  40.34 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  37.39 
 
 		 303 aa  69.3  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  40.58 
 
 		 466 aa  68.2  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1988  lytic transglycosylase, catalytic  38.18 
 
 		 519 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010206  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  27.33 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2988  lytic transglycosylase  36.27 
 
 		 503 aa  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0496  peptidoglycan-binding LysM  40.57 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0756826 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1153  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  40.21 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  39.62 
 
 		 511 aa  65.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  36.22 
 
 		 499 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1413  peptidoglycan-binding LysM  31.94 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00299984  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1945  lytic transglycosylase  38.24 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106918  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  35.16 
 
 		 517 aa  64.3  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  40.78 
 
 		 515 aa  63.5  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1754  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  39.18 
 
 		 448 aa  63.5  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0659855  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  27.68 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  36.28 
 
 		 554 aa  63.5  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.52 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  29.84 
 
 		 1556 aa  63.5  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  35.11 
 
 		 590 aa  62.8  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  36.79 
 
 		 307 aa  62.4  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  34.13 
 
 		 444 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  37.5 
 
 		 515 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  37.5 
 
 		 515 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  37.5 
 
 		 515 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  27.78 
 
 		 602 aa  61.6  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  37.5 
 
 		 519 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  26.79 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  26.79 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  26.79 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  26.79 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  26.79 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  38.83 
 
 		 515 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  38.83 
 
 		 515 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2407  lytic transglycosylase catalytic  36.97 
 
 		 519 aa  61.6  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000206679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  26.79 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  26.79 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  32.09 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  32.81 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  25.54 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  31.82 
 
 		 553 aa  60.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  31.76 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  32.81 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  32.58 
 
 		 515 aa  60.5  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  30.97 
 
 		 470 aa  60.1  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  30.09 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1555  peptidoglycan-binding LysM  31.75 
 
 		 399 aa  59.7  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1588  lytic transglycosylase, catalytic  34.78 
 
 		 550 aa  59.3  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  26.19 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1430  cell wall hydrolase  38.82 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  29.57 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3633  glycosyl hydrolase, family 18  26.19 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00032654  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  33.58 
 
 		 517 aa  58.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  37.38 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  33.33 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  35.51 
 
 		 527 aa  57.8  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  30.16 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.64 
 
 		 797 aa  57.4  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  37.74 
 
 		 532 aa  57.4  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  31.4 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  33.33 
 
 		 546 aa  57  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  35.25 
 
 		 509 aa  57  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2785  peptidoglycan-binding LysM  27.54 
 
 		 647 aa  57  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1867  aggregation promoting factor-like surface protein  49.3 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  36.89 
 
 		 514 aa  56.6  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  36.11 
 
 		 595 aa  56.2  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  30.66 
 
 		 495 aa  56.2  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  38.68 
 
 		 527 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2402  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  33.02 
 
 		 517 aa  55.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  32.48 
 
 		 335 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  33.33 
 
 		 617 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1174  peptidoglycan-binding LysM  32.14 
 
 		 522 aa  55.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.106358 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1839  peptidoglycan-binding LysM  34.91 
 
 		 314 aa  55.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.955288  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13890  Peptidoglycan-binding LysM  32.04 
 
 		 175 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.582346  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0538  muramidase (flagellum-specific)  36.61 
 
 		 361 aa  55.5  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000149562  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  33.61 
 
 		 285 aa  55.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  31.15 
 
 		 324 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  35.14 
 
 		 295 aa  54.7  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  37.25 
 
 		 250 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  30 
 
 		 465 aa  55.1  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  34.88 
 
 		 395 aa  54.7  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  35.45 
 
 		 301 aa  54.7  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  29.55 
 
 		 423 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35 
 
 		 289 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  36.11 
 
 		 289 aa  54.7  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.58 
 
 		 528 aa  54.3  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3244  glycoside hydrolase family 25  43.66 
 
 		 320 aa  53.5  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0027526  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1839  aggregation promoting factor-like surface protein  49.3 
 
 		 200 aa  53.9  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  37.25 
 
 		 347 aa  53.5  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  35 
 
 		 253 aa  53.5  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  28.26 
 
 		 620 aa  53.5  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1982  LysM domain-containing protein  44.87 
 
 		 184 aa  53.5  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  27.35 
 
 		 556 aa  53.1  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>