More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0473 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0407  putative insecticidal toxin complex protein  94.17 
 
 
921 aa  1293    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0409  putative insecticial toxin complex protein  78.16 
 
 
958 aa  1493    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0406  putative insecticidal toxin complex protein  90.24 
 
 
929 aa  1363    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0578  YD repeat-containing protein  51.95 
 
 
962 aa  638    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2566  hypothetical protein  51.01 
 
 
980 aa  641    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00381829  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0610  YD repeat protein  53.05 
 
 
954 aa  672    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0603  YD repeat-containing protein  51.95 
 
 
962 aa  638    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1823  putative toxin protein  49.35 
 
 
994 aa  665    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0293647  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0579  YD repeat-containing protein  53.05 
 
 
954 aa  672    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0609  YD repeat protein  51.95 
 
 
958 aa  638    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1189  RHS repeat family protein  86.97 
 
 
952 aa  1628    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.667138  hitchhiker  0.0000780044 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0473  YD repeat-containing protein  100 
 
 
952 aa  1965    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0589964  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0604  YD repeat-containing protein  53.05 
 
 
954 aa  672    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0408  putative insecticidal toxin complex protein  96.53 
 
 
910 aa  1317    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0382  YD repeat-containing protein  50.27 
 
 
852 aa  629  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.835506  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0162  TccC3  45.61 
 
 
989 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0160  TccC4  46.55 
 
 
952 aa  579  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189077  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4038  YD repeat-containing protein  43.18 
 
 
881 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.23853 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4340  insecticidal toxin protein, putative  42.69 
 
 
940 aa  478  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  40.78 
 
 
956 aa  478  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4032  YD repeat-containing protein  41.9 
 
 
920 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0529613 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  42.75 
 
 
955 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  41.68 
 
 
2417 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  41.67 
 
 
2458 aa  479  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4033  YD repeat-containing protein  41.67 
 
 
939 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.195324 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4344  insecticidal toxin protein, putative  39.32 
 
 
886 aa  465  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  40.39 
 
 
927 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2412  YD repeat-containing protein  40.42 
 
 
923 aa  439  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394725  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1231  insecticidal toxin protein, putative  39.5 
 
 
922 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0948  insecticidal toxin protein, putative  37.76 
 
 
942 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.920867  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0947  insecticidal toxin protein, putative  37.67 
 
 
893 aa  378  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.81125  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4455  insecticidal toxin protein, putative  37.52 
 
 
944 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4456  insecticidal toxin protein, putative  37.59 
 
 
891 aa  372  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.859155  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  33.43 
 
 
2558 aa  348  3e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4454  insecticidal toxin protein, putative  35.36 
 
 
928 aa  346  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.543889  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  34.08 
 
 
2554 aa  333  8e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  32.7 
 
 
2698 aa  281  5e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  30.06 
 
 
2652 aa  266  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  30.61 
 
 
2534 aa  265  4e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  30.59 
 
 
2443 aa  253  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  32.86 
 
 
2510 aa  247  9e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2269  YD repeat protein  29.68 
 
 
2479 aa  239  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1870  Rhs family protein-like protein  37.96 
 
 
334 aa  138  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0949212  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  25.77 
 
 
3456 aa  120  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  25.7 
 
 
1976 aa  108  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1560  YD repeat-containing protein  23.88 
 
 
1126 aa  92.4  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  24.19 
 
 
3320 aa  91.3  8e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  31.95 
 
 
1935 aa  90.5  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  26.4 
 
 
2145 aa  86.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  26.77 
 
 
1338 aa  85.9  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  24.95 
 
 
2003 aa  85.9  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  25.19 
 
 
2076 aa  83.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  43.27 
 
 
1464 aa  82  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  24.62 
 
 
927 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  25.5 
 
 
1917 aa  77.8  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  27.13 
 
 
690 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  25.76 
 
 
2017 aa  76.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  26.46 
 
 
1140 aa  74.7  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  24.39 
 
 
1942 aa  74.3  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  23.71 
 
 
2096 aa  74.7  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.95 
 
 
482 aa  73.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2046  YD repeat-containing protein  32.54 
 
 
909 aa  73.6  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  29.29 
 
 
1600 aa  72  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  23.96 
 
 
1384 aa  70.5  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  28.65 
 
 
1381 aa  70.1  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  25.55 
 
 
1352 aa  70.1  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2022  YD repeat-containing protein  24.87 
 
 
1488 aa  69.7  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  28.28 
 
 
474 aa  69.3  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  25.74 
 
 
903 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  31.61 
 
 
2294 aa  68.9  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  25.27 
 
 
3193 aa  68.6  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  23.82 
 
 
1599 aa  68.2  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  24.49 
 
 
1409 aa  68.2  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  33.33 
 
 
1892 aa  67.8  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  24.33 
 
 
1959 aa  67.8  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2020  YD repeat-containing protein  24.61 
 
 
1140 aa  67.8  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  25.86 
 
 
1386 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  24.3 
 
 
1840 aa  67.4  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  23.66 
 
 
451 aa  67  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  24.85 
 
 
1147 aa  67  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3660  YD repeat-containing protein  25.51 
 
 
2007 aa  65.9  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2048  YD repeat-containing protein  30.77 
 
 
972 aa  65.5  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2045  YD repeat-containing protein  30.59 
 
 
740 aa  65.5  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8866  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  23.39 
 
 
1577 aa  65.1  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  22.28 
 
 
867 aa  64.7  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  25.95 
 
 
1673 aa  64.7  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  24.15 
 
 
480 aa  64.3  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01120  Rhs family protein  24.17 
 
 
1053 aa  63.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  26.5 
 
 
1834 aa  63.5  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1566  hypothetical protein  33.12 
 
 
360 aa  63.5  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0920602  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  25.53 
 
 
628 aa  63.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  21.84 
 
 
1560 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  23.62 
 
 
1466 aa  62.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  25.31 
 
 
1517 aa  62.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3712  YD repeat-containing protein  34.15 
 
 
1490 aa  62.8  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  23.77 
 
 
2290 aa  62.4  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  22.1 
 
 
2035 aa  62.4  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  25.58 
 
 
2138 aa  62.4  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  27.65 
 
 
1467 aa  62.4  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  23.82 
 
 
1669 aa  62  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>