164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3853 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 		 1055 aa  1998    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  53.76 
 
 		 1741 aa  621  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  62.35 
 
 		 1357 aa  412  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  35.37 
 
 		 818 aa  240  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  34.22 
 
 		 1099 aa  237  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  32.45 
 
 		 1093 aa  226  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  32.45 
 
 		 1093 aa  226  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  36.13 
 
 		 825 aa  222  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  32.92 
 
 		 909 aa  220  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  36.13 
 
 		 819 aa  217  8e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  33.7 
 
 		 1115 aa  206  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.23 
 
 		 1009 aa  198  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  33.09 
 
 		 950 aa  196  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  31.28 
 
 		 1049 aa  186  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  33.6 
 
 		 1113 aa  177  7e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  30.06 
 
 		 3322 aa  160  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  31.38 
 
 		 927 aa  156  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  33.47 
 
 		 2906 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  33.47 
 
 		 2578 aa  152  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  33.47 
 
 		 1861 aa  151  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  40.39 
 
 		 861 aa  150  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  33.53 
 
 		 1040 aa  145  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  30.68 
 
 		 1571 aa  144  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  28.87 
 
 		 3420 aa  139  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  28.23 
 
 		 1594 aa  136  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  28.45 
 
 		 3415 aa  136  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  29.97 
 
 		 1753 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  29.82 
 
 		 1108 aa  128  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  29.9 
 
 		 1748 aa  128  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  30.81 
 
 		 1770 aa  127  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  29.63 
 
 		 1763 aa  125  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  28.57 
 
 		 2057 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  30.19 
 
 		 1770 aa  124  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  29.46 
 
 		 1762 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  29.46 
 
 		 1762 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  42.2 
 
 		 1593 aa  114  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  29.45 
 
 		 2926 aa  112  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  31.31 
 
 		 924 aa  109  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  25.68 
 
 		 1579 aa  106  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  27.26 
 
 		 1165 aa  102  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  27.26 
 
 		 1165 aa  102  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  31.26 
 
 		 1012 aa  100  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  25.52 
 
 		 1102 aa  98.2  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  32.36 
 
 		 1806 aa  95.9  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  26.06 
 
 		 1067 aa  95.1  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.87 
 
 		 868 aa  94.7  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  31.72 
 
 		 1626 aa  90.1  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25 
 
 		 1023 aa  88.6  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  39.89 
 
 		 914 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  37.43 
 
 		 1327 aa  85.9  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  26.46 
 
 		 1070 aa  85.1  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  44.62 
 
 		 1971 aa  83.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  42.86 
 
 		 1458 aa  83.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  26.19 
 
 		 947 aa  80.5  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  26.06 
 
 		 1070 aa  80.9  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  44.27 
 
 		 989 aa  80.5  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  38.36 
 
 		 1068 aa  80.5  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  24.85 
 
 		 773 aa  79.3  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  37.42 
 
 		 466 aa  78.2  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  24.31 
 
 		 4391 aa  73.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  53.41 
 
 		 1111 aa  72.8  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  24.31 
 
 		 4312 aa  70.1  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  51.14 
 
 		 1130 aa  70.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.3 
 
 		 806 aa  70.5  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2537  autotransporter beta-domain-containing protein  26.87 
 
 		 356 aa  69.7  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686468  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1258  beta strand repeat-containing protein  41.98 
 
 		 550 aa  69.3  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.305666  normal  0.49742 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  26.74 
 
 		 1327 aa  69.3  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3656  outer membrane autotransporter  25.62 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145714 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  36.21 
 
 		 1269 aa  68.6  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1818  outer membrane autotransporter  25.32 
 
 		 358 aa  68.2  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.694582  normal  0.431978 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  31.89 
 
 		 1259 aa  68.2  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  40.68 
 
 		 1234 aa  67.4  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  35.63 
 
 		 1268 aa  67.4  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  35.63 
 
 		 1285 aa  67.4  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1267  hypothetical protein  33.83 
 
 		 506 aa  67.8  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117469  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01153  hypothetical protein  33.83 
 
 		 506 aa  67.8  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  34.81 
 
 		 955 aa  66.6  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  35.63 
 
 		 1259 aa  67  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  36.21 
 
 		 1254 aa  66.2  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  44.74 
 
 		 1277 aa  65.5  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  36.84 
 
 		 955 aa  65.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1786  outer membrane autotransporter  24.05 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.682029  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4057  outer membrane autotransporter  25.63 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.679978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  49.41 
 
 		 1029 aa  64.3  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  46.59 
 
 		 1078 aa  63.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  46.39 
 
 		 3391 aa  60.8  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  28.35 
 
 		 729 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  25.1 
 
 		 732 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  27.62 
 
 		 709 aa  60.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0916  outer membrane autotransporter  31.23 
 
 		 1144 aa  60.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.753371 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  45.71 
 
 		 2711 aa  60.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  36.61 
 
 		 730 aa  59.7  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  26.48 
 
 		 733 aa  59.3  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  32.45 
 
 		 882 aa  58.5  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  44.22 
 
 		 3629 aa  58.5  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1657  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.74 
 
 		 1039 aa  57.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.656845  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  26.92 
 
 		 769 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  38.85 
 
 		 2363 aa  57.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  51.32 
 
 		 2407 aa  57.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  46.15 
 
 		 2365 aa  57.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>