118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4218 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 128 aa  253  6e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  37.29 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 139 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 148 aa  60.1  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  38.37 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4686  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000388035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3957  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432771  normal  0.0893513 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5196  transcriptional regulator, MarR family  37.08 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 169 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 156 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 157 aa  57  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3350  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0764351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4000  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.869888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  23.58 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0356  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 193 aa  53.9  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3949  transcriptional regulatory protein  31.91 
 
 		 179 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2388  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  34.13 
 
 		 287 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  26.89 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  32.18 
 
 		 146 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0875  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445474 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4307  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4639  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  29.07 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9049  Transcriptional regulator  35.8 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578092  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  24.53 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  24.47 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6002  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.431751  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  33.78 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 		 157 aa  47.8  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 143 aa  47.4  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 143 aa  47.4  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 153 aa  47  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  28.74 
 
 		 164 aa  47  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1316  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.061965 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4123  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 175 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00388815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7850  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172522  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8638  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.280895  normal  0.673509 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  29.79 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  27.35 
 
 		 159 aa  44.3  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2607  transcriptional regulator, MarR family  25.96 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3170  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  hitchhiker  0.0000000757485 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0346  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 171 aa  43.9  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.668512  normal  0.0212996 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 169 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 193 aa  43.5  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2084  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000746204  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0741  transcriptional regulator, MarR family  29.35 
 
 		 162 aa  42.7  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.476836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2118  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  33.01 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  32.41 
 
 		 147 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 161 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 158 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0170  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 142 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 161 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 190 aa  41.6  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5060  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 149 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.391119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 160 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 139 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 157 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 152 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  42.59 
 
 		 157 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  30.38 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  24.69 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 175 aa  40.4  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 340 aa  40.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 142 aa  40.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>