165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2555 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  100 
 
 		 524 aa  987    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  40.86 
 
 		 509 aa  256  6e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  32.02 
 
 		 534 aa  167  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  32.89 
 
 		 575 aa  161  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  34.47 
 
 		 557 aa  160  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  32.64 
 
 		 536 aa  150  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  32.84 
 
 		 532 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.22 
 
 		 596 aa  146  9e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 547 aa  144  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  32.71 
 
 		 566 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 586 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 546 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 535 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.71 
 
 		 523 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  43.59 
 
 		 549 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  22.99 
 
 		 542 aa  114  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 537 aa  111  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  32.04 
 
 		 536 aa  110  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  21.24 
 
 		 537 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 553 aa  107  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  31.11 
 
 		 520 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4079  transcriptional regulator, PucR family  35.29 
 
 		 523 aa  102  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  36.7 
 
 		 582 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  35 
 
 		 542 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  35 
 
 		 542 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  35 
 
 		 542 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  30.04 
 
 		 505 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  28.54 
 
 		 538 aa  96.7  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 543 aa  94.7  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  23.77 
 
 		 555 aa  94.4  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 235 aa  92.4  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  36.56 
 
 		 500 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0356  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.38 
 
 		 533 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  19.72 
 
 		 562 aa  90.1  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  36.17 
 
 		 518 aa  90.1  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  42.75 
 
 		 236 aa  88.6  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  35.47 
 
 		 539 aa  87.4  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  30 
 
 		 525 aa  83.6  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  28.86 
 
 		 486 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  37.25 
 
 		 558 aa  82.8  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.81 
 
 		 480 aa  82.4  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.09 
 
 		 459 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  26.3 
 
 		 478 aa  80.9  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  31.03 
 
 		 525 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  24.58 
 
 		 558 aa  77.4  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  35.76 
 
 		 614 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.62 
 
 		 501 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 563 aa  73.9  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4239  transcriptional regulator, PucR family  45.24 
 
 		 530 aa  73.6  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  37.74 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  37.74 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  37.74 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  37.74 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  37.74 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1107  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.34 
 
 		 565 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.166611  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  28.57 
 
 		 515 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  37.74 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  40.16 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  40.32 
 
 		 705 aa  70.5  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 403 aa  70.1  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  37.91 
 
 		 598 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.31 
 
 		 492 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  25.31 
 
 		 502 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.31 
 
 		 492 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.44 
 
 		 445 aa  67  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  32.74 
 
 		 535 aa  65.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 516 aa  65.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  32.82 
 
 		 609 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  37.04 
 
 		 485 aa  64.7  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  26.92 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  33.61 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.61 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1641  transcriptional regulator, CdaR  35.53 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  30.58 
 
 		 483 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  42.55 
 
 		 504 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  27.73 
 
 		 512 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  39.81 
 
 		 665 aa  61.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  34.65 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  39.17 
 
 		 520 aa  60.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  26.54 
 
 		 602 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  35.59 
 
 		 531 aa  60.1  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  21 
 
 		 412 aa  60.1  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  36.72 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  30 
 
 		 740 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  30.98 
 
 		 619 aa  58.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1184  transcriptional regulator, CdaR  30.51 
 
 		 555 aa  58.5  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000481254 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  30.13 
 
 		 627 aa  58.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  28.16 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 477 aa  57.4  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0789  putative transcriptional regulator, PucR family  26.42 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.691092  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  36.6 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0012  polyketide synthase expression regulator  31.12 
 
 		 500 aa  57  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  30 
 
 		 564 aa  56.2  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 502 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  40.16 
 
 		 637 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  26.37 
 
 		 406 aa  56.6  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1806  GAF domain-containing protein  47.83 
 
 		 639 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>