254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1219 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  62.13 
 
 		 913 aa  1034    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  59.41 
 
 		 925 aa  1003    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  56.08 
 
 		 935 aa  911    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  56.85 
 
 		 906 aa  915    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1219  cellulose-binding family II  100 
 
 		 911 aa  1819    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  65.98 
 
 		 1298 aa  1033    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  57.05 
 
 		 842 aa  825    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  73.5 
 
 		 978 aa  1129    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  48.33 
 
 		 873 aa  692    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  52.22 
 
 		 934 aa  865    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  49.95 
 
 		 942 aa  877    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  56.11 
 
 		 1904 aa  841    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05061  xyloglucanase (Eurofung)  45.48 
 
 		 836 aa  593  1e-168  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.341133  hitchhiker  0.000000000000191913 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0626  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.5 
 
 		 707 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  37.84 
 
 		 1288 aa  419  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01542  oligo-xyloglucan specific cellobiohydrolase (Eurofung)  34.71 
 
 		 810 aa  380  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4813  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.84 
 
 		 778 aa  260  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  47.66 
 
 		 474 aa  94.7  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  46.73 
 
 		 456 aa  91.7  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  49 
 
 		 353 aa  90.5  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1029  cellulose-binding family II  39.38 
 
 		 792 aa  90.1  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.746729 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  47.17 
 
 		 422 aa  89.7  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  44.86 
 
 		 448 aa  81.6  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  43.86 
 
 		 459 aa  79  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  39.52 
 
 		 847 aa  77.4  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  43.14 
 
 		 360 aa  77.4  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  42.06 
 
 		 403 aa  76.6  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  41.67 
 
 		 773 aa  76.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  39.5 
 
 		 486 aa  75.5  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  45.79 
 
 		 460 aa  75.1  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  44.19 
 
 		 494 aa  74.3  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  36.56 
 
 		 455 aa  72.8  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  36.79 
 
 		 491 aa  72.4  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  35.03 
 
 		 493 aa  72.4  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  48.86 
 
 		 593 aa  72.4  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  39.47 
 
 		 875 aa  72.4  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  42.57 
 
 		 658 aa  71.6  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  36.79 
 
 		 364 aa  71.2  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  40.43 
 
 		 851 aa  71.2  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  41.57 
 
 		 688 aa  71.6  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  39.2 
 
 		 681 aa  70.5  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  43.81 
 
 		 453 aa  69.3  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  41.44 
 
 		 447 aa  69.7  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  37 
 
 		 778 aa  68.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  39.56 
 
 		 518 aa  68.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  39 
 
 		 460 aa  68.6  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.62 
 
 		 652 aa  68.2  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  31.12 
 
 		 468 aa  67.8  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  39.09 
 
 		 775 aa  67.4  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  30.13 
 
 		 389 aa  67.8  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  38.1 
 
 		 446 aa  66.6  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  37.78 
 
 		 468 aa  66.6  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  24.87 
 
 		 846 aa  66.6  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35.51 
 
 		 984 aa  66.2  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  37.74 
 
 		 495 aa  65.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  38.6 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  39.25 
 
 		 673 aa  65.5  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  37.19 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  37.5 
 
 		 743 aa  65.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3169  cellulose-binding family II  38.1 
 
 		 545 aa  65.1  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.111807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  35.58 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  44.74 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  32.37 
 
 		 609 aa  64.7  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  37.62 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  38.46 
 
 		 449 aa  63.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.82 
 
 		 345 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.82 
 
 		 345 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  36.78 
 
 		 462 aa  63.9  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  38.74 
 
 		 727 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  37.5 
 
 		 938 aa  63.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  39.78 
 
 		 393 aa  63.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  37.65 
 
 		 467 aa  63.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  38.37 
 
 		 374 aa  62.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  37.86 
 
 		 477 aa  62.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  37.74 
 
 		 767 aa  62.4  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.62 
 
 		 998 aa  62.4  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  34.26 
 
 		 580 aa  62  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  33.71 
 
 		 864 aa  61.6  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  34.26 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  36.78 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  38.46 
 
 		 349 aa  60.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  36.96 
 
 		 543 aa  60.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  28.11 
 
 		 1147 aa  60.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  43.16 
 
 		 649 aa  60.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  36.27 
 
 		 490 aa  59.7  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  36.08 
 
 		 772 aa  60.1  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  32.94 
 
 		 372 aa  60.1  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  39.62 
 
 		 1121 aa  59.7  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  35.85 
 
 		 743 aa  59.7  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  36.79 
 
 		 979 aa  59.3  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  33.68 
 
 		 623 aa  59.7  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 459 aa  59.3  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  33.7 
 
 		 613 aa  59.7  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  43.3 
 
 		 543 aa  59.3  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  40 
 
 		 820 aa  58.9  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  32.11 
 
 		 842 aa  58.9  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  34.91 
 
 		 488 aa  58.9  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.95 
 
 		 694 aa  58.5  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  40.94 
 
 		 702 aa  58.5  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>