More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1496 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1496  chromosome partition protein SmC, putative  100 
 
 		 980 aa  1967    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1485  SMC domain protein  30.63 
 
 		 952 aa  433  1e-120  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0495  structural maintenance of chromosomes (SMC) superfamily protein  26.59 
 
 		 988 aa  325  4e-87  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.210313  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  37.26 
 
 		 1190 aa  290  8e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0156  p115 protein  26.52 
 
 		 981 aa  278  2e-73  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  40.96 
 
 		 1187 aa  276  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  31.63 
 
 		 1191 aa  275  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 		 1187 aa  274  6e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  40.34 
 
 		 1185 aa  267  7e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  36.08 
 
 		 1190 aa  264  6.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  36.98 
 
 		 1176 aa  261  5.0000000000000005e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  51.91 
 
 		 1176 aa  258  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  52.02 
 
 		 1173 aa  255  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  41.03 
 
 		 1255 aa  253  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  51.54 
 
 		 1177 aa  253  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  33.26 
 
 		 1177 aa  252  3e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  49.19 
 
 		 1185 aa  250  8e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  51.97 
 
 		 1176 aa  249  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  51.09 
 
 		 1175 aa  249  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  37.23 
 
 		 1186 aa  249  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  45.33 
 
 		 1190 aa  248  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  48.78 
 
 		 1185 aa  248  4e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  34.45 
 
 		 1189 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  45.15 
 
 		 1186 aa  244  7.999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  50.45 
 
 		 1176 aa  243  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  37.63 
 
 		 1196 aa  243  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  50.45 
 
 		 1176 aa  243  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  47.92 
 
 		 1185 aa  242  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  49.08 
 
 		 1301 aa  242  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  43.69 
 
 		 1178 aa  243  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  37.36 
 
 		 1148 aa  242  2e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  34.2 
 
 		 1189 aa  240  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  47.83 
 
 		 1198 aa  239  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  40.13 
 
 		 1185 aa  239  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  49.76 
 
 		 1189 aa  238  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  48.18 
 
 		 1189 aa  238  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  49.76 
 
 		 1189 aa  238  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  48.18 
 
 		 1189 aa  238  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  49.28 
 
 		 1189 aa  238  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  49.28 
 
 		 1189 aa  238  4e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  48.21 
 
 		 1179 aa  238  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  49.28 
 
 		 1189 aa  238  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  49.28 
 
 		 1189 aa  238  5.0000000000000005e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  49.28 
 
 		 1189 aa  238  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  37.61 
 
 		 1199 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  47.39 
 
 		 1199 aa  236  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  47.39 
 
 		 1199 aa  236  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  34.41 
 
 		 1185 aa  235  2.0000000000000002e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  43.91 
 
 		 1178 aa  235  3e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  31.88 
 
 		 1185 aa  234  6e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  36.83 
 
 		 1177 aa  234  7.000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  49.1 
 
 		 1190 aa  233  1e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  54.69 
 
 		 1172 aa  230  9e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  46.33 
 
 		 1188 aa  229  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  46.33 
 
 		 1188 aa  229  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  48.64 
 
 		 1174 aa  228  3e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  36.31 
 
 		 1204 aa  228  5.0000000000000005e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  32.29 
 
 		 1198 aa  226  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  33.25 
 
 		 1177 aa  226  2e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  45.41 
 
 		 1189 aa  225  3e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  48.44 
 
 		 1183 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  46.23 
 
 		 1187 aa  224  8e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  48.57 
 
 		 1234 aa  221  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  48.57 
 
 		 1188 aa  216  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  42.4 
 
 		 1188 aa  216  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  33.91 
 
 		 1198 aa  216  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  33.09 
 
 		 1198 aa  216  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  45.78 
 
 		 1218 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  35.54 
 
 		 1175 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  47.11 
 
 		 1203 aa  215  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  47.14 
 
 		 1227 aa  215  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  44.64 
 
 		 1139 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  41.87 
 
 		 1138 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  41.46 
 
 		 1145 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  41.87 
 
 		 1138 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  41.87 
 
 		 1138 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  44.2 
 
 		 1133 aa  214  7e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  47.62 
 
 		 1181 aa  214  7.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  46.79 
 
 		 1179 aa  213  1e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  45.09 
 
 		 1140 aa  213  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  39.38 
 
 		 1194 aa  213  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  40.65 
 
 		 1145 aa  213  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  41.04 
 
 		 1217 aa  212  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  41.46 
 
 		 1138 aa  213  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  45.41 
 
 		 1184 aa  212  3e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  47.85 
 
 		 1187 aa  212  3e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  39.19 
 
 		 1172 aa  212  4e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  40.43 
 
 		 1141 aa  211  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  34.78 
 
 		 1194 aa  211  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  42.86 
 
 		 1144 aa  211  5e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  48.28 
 
 		 1186 aa  211  5e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  33.08 
 
 		 1191 aa  211  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  30.95 
 
 		 1176 aa  209  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  42.69 
 
 		 1194 aa  210  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  33.15 
 
 		 1142 aa  209  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  37.75 
 
 		 1205 aa  209  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  45 
 
 		 1186 aa  209  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  44.69 
 
 		 1222 aa  209  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  39.03 
 
 		 1188 aa  209  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  35.18 
 
 		 1194 aa  209  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>