93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1302 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1302  type IV pilus biogenesis protein, putative  100 
 
 		 169 aa  349  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.391633 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1205  type IV pilus biogenesis protein, putative  59.17 
 
 		 169 aa  226  8e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  57.99 
 
 		 170 aa  223  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  57.14 
 
 		 170 aa  210  7e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  56.71 
 
 		 170 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1167  type IV pilus biogenesis protein, putative  54.22 
 
 		 170 aa  202  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.350797 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3520  type IV pilus biogenesis protein, putative  54.55 
 
 		 170 aa  202  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3224  type IV pilus biogenesis protein, putative  54.22 
 
 		 170 aa  202  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1132  type IV pilus biogenesis protein, putative  54.22 
 
 		 170 aa  201  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  55.76 
 
 		 170 aa  200  9e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2712  type IV pilus biogenesis protein, putative  56.71 
 
 		 170 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000750453  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3028  methylation site containing protein  52.66 
 
 		 170 aa  191  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2946  methylation site containing protein  52.66 
 
 		 170 aa  191  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.105075  normal  0.412318 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3125  methylation site containing protein  52.07 
 
 		 170 aa  190  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2880  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  52.15 
 
 		 173 aa  180  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1068  type IV pilus biogenesis protein, putative  53.08 
 
 		 151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.537139  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  47.53 
 
 		 178 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  43.27 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2713  type IV pilus biogenesis protein, putative  40 
 
 		 172 aa  121  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000625919  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  35.22 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3919  putative type IV pilus biogenesis protein  36.81 
 
 		 208 aa  104  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.159309  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  39.87 
 
 		 164 aa  104  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  39.87 
 
 		 164 aa  104  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  39.87 
 
 		 164 aa  104  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  35.67 
 
 		 164 aa  101  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1166  type IV pilus biogenesis protein, putative  38.61 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  36.9 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  34.64 
 
 		 163 aa  92.4  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1108  methylation site containing protein  34.84 
 
 		 163 aa  88.6  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3029  methylation site containing protein  32.48 
 
 		 155 aa  85.9  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2947  methylation site containing protein  29.3 
 
 		 160 aa  85.1  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0992621  normal  0.405183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3126  methylation site containing protein  28.66 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1204  methylation site containing protein  38.41 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1219  putative type IV pilus biogenesis protein  29.22 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  30.86 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  30.18 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0873  Tfp pilus assembly protein FimT  26.38 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160532  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11820  type IV pilus biogenesis protein, FimT  31.58 
 
 		 171 aa  67  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03016  putative type IV pilus biogenesis protein  25.31 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.155595  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0021  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  24.71 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  29.14 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1895  type 4 fimbrial biogenesis protein  27.71 
 
 		 195 aa  62  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  27.88 
 
 		 181 aa  62  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1834  fimbrial biogenesis protein  27.71 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.723988  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  26.28 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  30.18 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  27.75 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  30.81 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  26.35 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  30.23 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  30.23 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1378  putative type IV pilus assembly protein FimT  27.88 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  41.67 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2965  Tfp pilus assembly protein FimT  27.33 
 
 		 181 aa  53.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.108298 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  35.16 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  28.68 
 
 		 214 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  25.71 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0188  pilus assembly protein  25.56 
 
 		 222 aa  52  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.323266 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  29.09 
 
 		 166 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5189  type 4 fimbrial biogenesis protein FimT  24.29 
 
 		 169 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0023  pre-pilin like leader sequence  30.06 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0562  putative fimT protein  24.32 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000705405  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  22.67 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1821  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  26.47 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.071899  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  30.85 
 
 		 214 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1621  type 4 pili biogenesis protein (prepilin-like protein)  25.68 
 
 		 186 aa  48.5  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000506995  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0378  hypothetical protein  24.54 
 
 		 217 aa  48.9  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913387  hitchhiker  0.000267093 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  38.81 
 
 		 168 aa  48.1  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  32.1 
 
 		 162 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  25 
 
 		 182 aa  47.8  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0811  pillin, putative  33.33 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4847  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  23.43 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  33.33 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  24.75 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  25.38 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1384  fimbrial biogenesis protein  25.87 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.168846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1381  hypothetical protein  23.6 
 
 		 186 aa  45.1  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722593  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  27.27 
 
 		 192 aa  45.1  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  27.43 
 
 		 192 aa  45.1  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  28.42 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2447  hypothetical protein  30.11 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0685  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  27.27 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  24.84 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  35.59 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  25.43 
 
 		 182 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  29.49 
 
 		 172 aa  42  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2535  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  22.54 
 
 		 193 aa  41.6  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0702  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  27.62 
 
 		 186 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.686484  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  25.77 
 
 		 203 aa  40.8  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4848  general secretion pathway protein H  26.95 
 
 		 184 aa  40.8  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2579  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  35.48 
 
 		 187 aa  40.8  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2664  fimbrial biogenesis protein  35.53 
 
 		 178 aa  40.8  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>