115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5189 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5189  type 4 fimbrial biogenesis protein FimT  100 
 
 		 169 aa  333  9e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0963  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  39.44 
 
 		 169 aa  105  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347082  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  29.41 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  29.52 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1895  type 4 fimbrial biogenesis protein  28.74 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  32.33 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.01 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0562  putative fimT protein  32.12 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000705405  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1834  fimbrial biogenesis protein  28.57 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.723988  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  29.67 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.05 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1378  putative type IV pilus assembly protein FimT  41.86 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1621  type 4 pili biogenesis protein (prepilin-like protein)  31.39 
 
 		 186 aa  67.4  0.00000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000506995  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1132  type IV pilus biogenesis protein, putative  25 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  37.97 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1167  type IV pilus biogenesis protein, putative  25 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.350797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1302  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.54 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.391633 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3520  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.88 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3224  type IV pilus biogenesis protein, putative  25 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  28.37 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  30.69 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  27.66 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03016  putative type IV pilus biogenesis protein  26.32 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.155595  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  31.11 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.29 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  28.24 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  40.48 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  28.23 
 
 		 181 aa  60.8  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  27.38 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0873  Tfp pilus assembly protein FimT  28.4 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160532  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  37.76 
 
 		 168 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11820  type IV pilus biogenesis protein, FimT  30.06 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  24.22 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  34.88 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3169  prepilin-type cleavage/methylation  25.15 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  28.4 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1205  type IV pilus biogenesis protein, putative  25.81 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1166  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.84 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2712  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.09 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000750453  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  36 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.18 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.18 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.18 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2713  type IV pilus biogenesis protein, putative  31.25 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000625919  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3125  methylation site containing protein  24.05 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0500  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  37.5 
 
 		 218 aa  54.3  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  25.35 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4848  general secretion pathway protein H  29.94 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  34.67 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3126  methylation site containing protein  26.45 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  34.67 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2947  methylation site containing protein  26.45 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0992621  normal  0.405183 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  29.38 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0023  pre-pilin like leader sequence  40.54 
 
 		 167 aa  53.9  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  30.63 
 
 		 214 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2946  methylation site containing protein  24.05 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.105075  normal  0.412318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3028  methylation site containing protein  24.05 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  29.36 
 
 		 157 aa  52  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  29.55 
 
 		 182 aa  51.6  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  30.43 
 
 		 214 aa  51.6  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  23.97 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  25.86 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0485  methylation  35.23 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1769  fimbrial protein FimT  35.44 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1707  putative type IV pilus assembly protein FimT  36.71 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2679  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  36.25 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1068  type IV pilus biogenesis protein, putative  23.48 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.537139  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  25.79 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  37.31 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  25.43 
 
 		 166 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  33.77 
 
 		 172 aa  48.5  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01320  pre-pilin like leader sequence  31.94 
 
 		 157 aa  48.5  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.401301  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0021  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  33.75 
 
 		 194 aa  47.4  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  29.13 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0188  pilus assembly protein  33.33 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.323266 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1821  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  28.9 
 
 		 195 aa  47  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.071899  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3919  putative type IV pilus biogenesis protein  22.81 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.159309  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0856  pilus assembly protein  25.69 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  31.58 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  23.9 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  27.56 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  30.12 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  34.15 
 
 		 199 aa  45.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1108  methylation site containing protein  28.42 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  30.12 
 
 		 145 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0811  pillin, putative  29 
 
 		 157 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3829  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  31.58 
 
 		 222 aa  44.7  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.198337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  28.57 
 
 		 188 aa  44.3  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2664  fimbrial biogenesis protein  27.71 
 
 		 178 aa  44.3  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470161  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  27.59 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  28 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0233  type IV pilin protein  31.25 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  31.25 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2834  protein involved in methylation  30.77 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0378  hypothetical protein  23.49 
 
 		 217 aa  43.9  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913387  hitchhiker  0.000267093 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2447  hypothetical protein  28.12 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3229  Tfp pilus assembly protein  30.14 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  27.41 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  28.92 
 
 		 145 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  31.65 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>