More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4694 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4983  chromosome segregation protein SMC  43.99 
 
 		 1154 aa  744    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127534  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0497  SMC family protein  43.4 
 
 		 1152 aa  729    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0745  chromosome segregation protein SMC  41.57 
 
 		 1150 aa  645    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.525394  normal  0.893736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0699  chromosome segregation protein SMC  45.18 
 
 		 1153 aa  716    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2608  chromosome segregation protein SMC  42.21 
 
 		 1168 aa  717    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198178  normal  0.335966 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4694  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1140 aa  2178    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0500  chromosome segregation protein SMC  43.57 
 
 		 1152 aa  734    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.169399  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1981  chromosome segregation protein SMC  44.23 
 
 		 1150 aa  671    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0547  chromosome segregation protein SMC  43.16 
 
 		 1153 aa  698    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.725203 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  43.44 
 
 		 1154 aa  734    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0955  chromosome segregation protein SMC  54.61 
 
 		 1147 aa  874    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  41.31 
 
 		 1151 aa  663    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1095  chromosome segregation protein  43.18 
 
 		 1153 aa  716    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4374  chromosome segregation protein SMC  44.18 
 
 		 1154 aa  737    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95695  normal  0.0465691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1194  chromosome segregation protein SMC  43.71 
 
 		 1154 aa  739    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3230  chromosome segregation protein SMC  44 
 
 		 1170 aa  718    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0657  chromosome segregation protein SMC  43.8 
 
 		 1153 aa  725    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.915586  normal  0.754344 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  43.25 
 
 		 1148 aa  662    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0716  chromosome segregation protein SMC  43.11 
 
 		 1153 aa  721    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0613  chromosome segregation protein SMC  42.35 
 
 		 1152 aa  730    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2318  condensin subunit Smc  43.7 
 
 		 1154 aa  724    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2270  chromosome segregation protein SMC  67.2 
 
 		 1147 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2587  chromosome segregation protein SMC  43.4 
 
 		 1151 aa  410  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000427179 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  29.15 
 
 		 1169 aa  389  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2738  chromosome segregation protein SMC  43.91 
 
 		 1167 aa  388  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  31.72 
 
 		 1176 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  29.47 
 
 		 1169 aa  384  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  29.37 
 
 		 1177 aa  378  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  31.35 
 
 		 1167 aa  378  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  29.1 
 
 		 1164 aa  379  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  29.7 
 
 		 1168 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  29.82 
 
 		 1173 aa  366  1e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  33.28 
 
 		 1164 aa  365  2e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  32.14 
 
 		 1171 aa  364  5.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  30.5 
 
 		 1162 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  31.78 
 
 		 1162 aa  357  8.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0163  chromosome segregation protein SMC  44.21 
 
 		 1150 aa  353  1e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  29.97 
 
 		 1190 aa  351  4e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  27.46 
 
 		 1187 aa  346  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3248  condensin subunit Smc  51.52 
 
 		 1167 aa  335  4e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0399  chromosome segregation protein SMC  39.76 
 
 		 1165 aa  323  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489923  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7655  chromosome segregation protein SMC  62.82 
 
 		 1148 aa  320  7e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00190533  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3824  chromosome segregation protein SMC  60.71 
 
 		 1151 aa  315  2.9999999999999996e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0542546 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6942  chromosome segregation protein SMC  68.22 
 
 		 1144 aa  307  7e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0702595 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0768  condensin subunit Smc  65.04 
 
 		 1152 aa  307  8.000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0144  chromosome segregation protein SMC  67.76 
 
 		 1170 aa  302  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  28.65 
 
 		 1179 aa  300  1e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  67.29 
 
 		 1151 aa  298  3e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2536  chromosome segregation protein SMC  67.29 
 
 		 1170 aa  298  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0064  SMC domain protein  60.52 
 
 		 1511 aa  295  5e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434137 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  64.89 
 
 		 1153 aa  290  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  29.1 
 
 		 1403 aa  278  5e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  24.55 
 
 		 1164 aa  269  2e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  20.68 
 
 		 1174 aa  258  6e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  47.76 
 
 		 1168 aa  216  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  38.71 
 
 		 1176 aa  214  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  43.18 
 
 		 1173 aa  212  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  51.18 
 
 		 1165 aa  211  8e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  42.35 
 
 		 1138 aa  210  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  42.35 
 
 		 1138 aa  210  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  42.35 
 
 		 1138 aa  210  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  33.08 
 
 		 1174 aa  210  1e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  42.35 
 
 		 1138 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  37.88 
 
 		 1150 aa  209  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  37.88 
 
 		 1150 aa  210  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  50.25 
 
 		 1176 aa  209  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  50.25 
 
 		 1176 aa  208  5e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  49.77 
 
 		 1138 aa  208  5e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  46.9 
 
 		 1195 aa  207  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  43.67 
 
 		 1190 aa  205  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  42.68 
 
 		 1162 aa  205  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  47.76 
 
 		 1171 aa  204  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  49.75 
 
 		 1145 aa  204  9e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  45.11 
 
 		 1199 aa  204  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  45.11 
 
 		 1199 aa  203  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  42.26 
 
 		 1162 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  38.62 
 
 		 1190 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  29.95 
 
 		 1162 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  35.26 
 
 		 1167 aa  203  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  47.2 
 
 		 1199 aa  203  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  35.26 
 
 		 1167 aa  203  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  42.26 
 
 		 1162 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  49.75 
 
 		 1175 aa  202  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  49.75 
 
 		 1170 aa  202  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  49.75 
 
 		 1170 aa  202  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  49.75 
 
 		 1268 aa  202  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  49.75 
 
 		 1200 aa  202  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  49.75 
 
 		 1170 aa  202  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  47.93 
 
 		 1144 aa  202  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  49.75 
 
 		 1202 aa  202  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  49.75 
 
 		 1170 aa  202  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  31.68 
 
 		 1168 aa  202  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  49.05 
 
 		 1139 aa  201  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  47.76 
 
 		 1171 aa  201  7e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  47.76 
 
 		 1171 aa  201  7e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  49.26 
 
 		 1175 aa  201  7e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  48.26 
 
 		 1170 aa  201  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  46.98 
 
 		 1168 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  32.79 
 
 		 1177 aa  200  1.0000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  48.26 
 
 		 1170 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>