174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3694 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2581  conjugal transfer ATPase TrbE  62.39 
 
 		 816 aa  1006    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1319  conjugal transfer ATPase TrbE  62.09 
 
 		 819 aa  1009    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2648  conjugal transfer ATPase TrbE  61.27 
 
 		 825 aa  994    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.947837  normal  0.965174 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2353  conjugal transfer ATPase TrbE  61.53 
 
 		 816 aa  1001    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.344124 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3001  conjugal transfer ATPase TrbE  76.58 
 
 		 812 aa  1264    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0315  conjugal transfer ATPase TrbE  81.6 
 
 		 821 aa  1334    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2348  conjugal transfer ATPase TrbE  52.1 
 
 		 810 aa  854    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3538  conjugal transfer ATPase TrbE  73.39 
 
 		 813 aa  1207    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0252817  normal  0.696341 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3898  conjugal transfer ATPase TrbE  74.48 
 
 		 813 aa  1207    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35690  conjugal transfer ATPase TrbE  61.9 
 
 		 816 aa  1001    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0963  conjugal transfer ATPase TrbE  72.56 
 
 		 813 aa  1189    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1344  conjugal transfer ATPase TrbE  61.84 
 
 		 819 aa  1007    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1553  conjugal transfer ATPase TrbE  61.46 
 
 		 809 aa  982    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2483  conjugal transfer ATPase TrbE  82.13 
 
 		 814 aa  1313    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.260305 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2611  conjugal transfer ATPase TrbE  84.22 
 
 		 829 aa  1356    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1717  conjugal transfer ATPase TrbE  47.85 
 
 		 819 aa  685    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.137188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0506  conjugal transfer ATPase TrbE  75.46 
 
 		 812 aa  1185    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496331  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2321  conjugal transfer ATPase TrbE  76.05 
 
 		 811 aa  1212    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3854  conjugal transfer ATPase TrbE  76.7 
 
 		 830 aa  1280    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0508748  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2007  conjugal transfer ATPase TrbE  61.78 
 
 		 816 aa  998    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581672  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30910  conjugal transfer ATPase TrbE  61.67 
 
 		 817 aa  988    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000414209  unclonable  1.71741e-21 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2349  conjugal transfer ATPase TrbE  48 
 
 		 820 aa  736    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2271  conjugal transfer ATPase TrbE  66.54 
 
 		 812 aa  1081    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1285  conjugal transfer ATPase TrbE  61.53 
 
 		 816 aa  1001    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0153  conjugal transfer ATPase TrbE  75.71 
 
 		 872 aa  1215    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1481  conjugal transfer ATPase TrbE  73.98 
 
 		 836 aa  1187    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0386388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3197  conjugal transfer ATPase TrbE  75.03 
 
 		 877 aa  1200    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.468072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0729  conjugal transfer ATPase TrbE  60.91 
 
 		 816 aa  937    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4198  conjugal transfer ATPase TrbE  61.1 
 
 		 813 aa  993    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330213  normal  0.981224 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5221  conjugal transfer ATPase TrbE  50.43 
 
 		 819 aa  734    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2827  conjugal transfer ATPase TrbE  77.82 
 
 		 812 aa  1264    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.595122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3503  conjugal transfer ATPase TrbE  61.9 
 
 		 823 aa  984    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2908  conjugal transfer ATPase TrbE  61.42 
 
 		 811 aa  1008    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1010  conjugal transfer ATPase TrbE  75.87 
 
 		 808 aa  1202    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.611754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3830  conjugal transfer ATPase TrbE  73.93 
 
 		 818 aa  1206    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2696  conjugal transfer ATPase TrbE  61.1 
 
 		 823 aa  979    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0851108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0435  conjugal transfer ATPase TrbE  62.33 
 
 		 817 aa  1004    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3089  conjugal transfer ATPase TrbE  75.84 
 
 		 812 aa  1235    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2030  conjugal transfer ATPase TrbE  58.17 
 
 		 813 aa  899    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3997  conjugal transfer ATPase TrbE  75.34 
 
 		 812 aa  1243    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.678924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1503  conjugal transfer ATPase TrbE  72.15 
 
 		 813 aa  1182    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373275  normal  0.784639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3367  conjugal transfer ATPase TrbE  73.05 
 
 		 814 aa  1212    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7443  conjugal transfer ATPase TrbE  76.4 
 
 		 809 aa  1251    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7744  conjugal transfer ATPase TrbE  75.34 
 
 		 812 aa  1214    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110925 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5372  conjugal transfer ATPase TrbE  51.84 
 
 		 824 aa  804    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.259729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0164  conjugal transfer ATPase TrbE  65.25 
 
 		 822 aa  1049    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.627498  normal  0.339359 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3694  conjugal transfer ATPase TrbE  100 
 
 		 820 aa  1654    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1898  conjugal transfer ATPase TrbE  61.31 
 
 		 817 aa  981    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3703  conjugal transfer ATPase TrbE  61.6 
 
 		 817 aa  966    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165131  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3215  conjugal transfer ATPase TrbE  74.6 
 
 		 836 aa  1200    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1191  conjugal transfer ATPase TrbE  73.28 
 
 		 816 aa  1204    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1838  conjugal transfer ATPase TrbE  60.27 
 
 		 808 aa  954    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3544  conjugal transfer ATPase TrbE  73.28 
 
 		 816 aa  1204    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0598  conjugal transfer ATPase TrbE  74.07 
 
 		 809 aa  1222    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0696  conjugal transfer ATPase TrbE  74.85 
 
 		 847 aa  1234    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0746  conjugal transfer ATPase TrbE  76.08 
 
 		 812 aa  1229    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.369643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2881  conjugal transfer ATPase TrbE  76.08 
 
 		 812 aa  1228    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244722  normal  0.034415 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1617  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system, conserved region  40.29 
 
 		 819 aa  584  1.0000000000000001e-165  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4566  conjugal transfer protein TrbE  41.33 
 
 		 817 aa  578  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9265  conjugal transfer protein TrbE  39.62 
 
 		 822 aa  564  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.502143  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5379  conjugal transfer protein TrbE  40.38 
 
 		 817 aa  561  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325542 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1339  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  39.42 
 
 		 840 aa  553  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.18708 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5485  conjugal transfer protein TrbE  39.23 
 
 		 815 aa  555  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00798845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0247  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  39.42 
 
 		 840 aa  553  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2098  conjugal transfer protein trbE  75.66 
 
 		 401 aa  546  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8331  conjugal transfer protein TrbE  39.71 
 
 		 820 aa  543  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359626  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1638  conjugal transfer protein trbE, putative  38.82 
 
 		 840 aa  544  1e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2503  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  39.98 
 
 		 814 aa  534  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0050  conjugal transfer protein TrbE  36.45 
 
 		 845 aa  518  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6505  conjugal transfer protein TrbE  37.46 
 
 		 852 aa  510  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158384  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6632  conjugal transfer protein TrbE  37.46 
 
 		 852 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4271  conjugal transfer protein TrbE  37.34 
 
 		 852 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000528773  normal  0.467859 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2228  conjugal transfer protein TrbE  36.53 
 
 		 854 aa  499  1e-140  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0444639  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9656  conjugal transfer protein TrbE  40.1 
 
 		 687 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0884  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  31.54 
 
 		 843 aa  436  1e-121  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1177  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  31.03 
 
 		 850 aa  430  1e-119  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4692  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  32.2 
 
 		 808 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0805  conjugal transfer protein  74.5 
 
 		 258 aa  397  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2821  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  27.55 
 
 		 827 aa  277  7e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.901669 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5229  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  27.63 
 
 		 846 aa  255  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.738503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6305  Type IV secretory pathway VirB4-like protein  25.44 
 
 		 818 aa  216  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5086  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  26.97 
 
 		 790 aa  216  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4747  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.66 
 
 		 844 aa  205  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290977 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5465  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  25.12 
 
 		 850 aa  202  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257739  decreased coverage  0.00704778 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0677  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  25.75 
 
 		 796 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4346  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  26.36 
 
 		 793 aa  201  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677673  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0255  Type IV secretory pathway AvhB4 protein  26.65 
 
 		 788 aa  197  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.849698 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1522  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  26.11 
 
 		 815 aa  196  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4260  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  24.75 
 
 		 831 aa  193  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0533  type IV secretion system ATPase VirB4  24.42 
 
 		 800 aa  188  4e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0495  type IV secretion system ATPase VirB4  23.36 
 
 		 800 aa  185  3e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.97813  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  31.84 
 
 		 803 aa  182  2e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0858  type IV secretion system ATPase VirB4  23.33 
 
 		 801 aa  179  1e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5609  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  26.13 
 
 		 825 aa  179  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.931017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4227  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  27.31 
 
 		 821 aa  177  9e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.267872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4177  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  25.16 
 
 		 804 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6506  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  26.03 
 
 		 825 aa  174  9e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2097  type IV secretion system protein VirB4  62.79 
 
 		 156 aa  169  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6206  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  27.57 
 
 		 839 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.623322  normal  0.0559252 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5007  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  25.25 
 
 		 805 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0207382  normal  0.0996879 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>