85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2097 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2097  type IV secretion system protein VirB4  100 
 
 		 156 aa  317  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7744  conjugal transfer ATPase TrbE  67.16 
 
 		 812 aa  192  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110925 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2321  conjugal transfer ATPase TrbE  67.91 
 
 		 811 aa  192  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3854  conjugal transfer ATPase TrbE  66.21 
 
 		 830 aa  192  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0508748  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2827  conjugal transfer ATPase TrbE  66.67 
 
 		 812 aa  191  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.595122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1481  conjugal transfer ATPase TrbE  66.42 
 
 		 836 aa  189  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0386388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3830  conjugal transfer ATPase TrbE  63.89 
 
 		 818 aa  187  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0506  conjugal transfer ATPase TrbE  65.67 
 
 		 812 aa  187  5.999999999999999e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496331  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3215  conjugal transfer ATPase TrbE  63.77 
 
 		 836 aa  186  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3538  conjugal transfer ATPase TrbE  64.93 
 
 		 813 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0252817  normal  0.696341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1503  conjugal transfer ATPase TrbE  64.93 
 
 		 813 aa  184  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373275  normal  0.784639 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2881  conjugal transfer ATPase TrbE  64.93 
 
 		 812 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244722  normal  0.034415 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0746  conjugal transfer ATPase TrbE  64.18 
 
 		 812 aa  181  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.369643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3089  conjugal transfer ATPase TrbE  64.18 
 
 		 812 aa  180  7e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0696  conjugal transfer ATPase TrbE  62.96 
 
 		 847 aa  180  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3001  conjugal transfer ATPase TrbE  64.18 
 
 		 812 aa  179  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0153  conjugal transfer ATPase TrbE  63.43 
 
 		 872 aa  177  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0963  conjugal transfer ATPase TrbE  66.41 
 
 		 813 aa  174  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3367  conjugal transfer ATPase TrbE  61.65 
 
 		 814 aa  173  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3544  conjugal transfer ATPase TrbE  61.94 
 
 		 816 aa  172  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1191  conjugal transfer ATPase TrbE  61.94 
 
 		 816 aa  172  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3997  conjugal transfer ATPase TrbE  62.6 
 
 		 812 aa  173  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.678924 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2483  conjugal transfer ATPase TrbE  62.6 
 
 		 814 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.260305 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0598  conjugal transfer ATPase TrbE  60.45 
 
 		 809 aa  171  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0315  conjugal transfer ATPase TrbE  65.89 
 
 		 821 aa  171  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3197  conjugal transfer ATPase TrbE  60.45 
 
 		 877 aa  171  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.468072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7443  conjugal transfer ATPase TrbE  62.31 
 
 		 809 aa  170  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2611  conjugal transfer ATPase TrbE  64.34 
 
 		 829 aa  167  7e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3694  conjugal transfer ATPase TrbE  62.5 
 
 		 820 aa  166  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1010  conjugal transfer ATPase TrbE  60.94 
 
 		 808 aa  163  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.611754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3898  conjugal transfer ATPase TrbE  65.41 
 
 		 813 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0164  conjugal transfer ATPase TrbE  55.56 
 
 		 822 aa  161  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.627498  normal  0.339359 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2271  conjugal transfer ATPase TrbE  59.85 
 
 		 812 aa  160  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1838  conjugal transfer ATPase TrbE  58.59 
 
 		 808 aa  151  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2353  conjugal transfer ATPase TrbE  51.01 
 
 		 816 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.344124 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0435  conjugal transfer ATPase TrbE  52.41 
 
 		 817 aa  145  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1898  conjugal transfer ATPase TrbE  53.47 
 
 		 817 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1553  conjugal transfer ATPase TrbE  54.14 
 
 		 809 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1319  conjugal transfer ATPase TrbE  51.33 
 
 		 819 aa  143  8.000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2696  conjugal transfer ATPase TrbE  51.01 
 
 		 823 aa  143  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0851108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3703  conjugal transfer ATPase TrbE  52.41 
 
 		 817 aa  143  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165131  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2007  conjugal transfer ATPase TrbE  54.62 
 
 		 816 aa  143  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581672  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2348  conjugal transfer ATPase TrbE  53.12 
 
 		 810 aa  142  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1285  conjugal transfer ATPase TrbE  54.62 
 
 		 816 aa  141  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2030  conjugal transfer ATPase TrbE  56.82 
 
 		 813 aa  141  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0729  conjugal transfer ATPase TrbE  54.62 
 
 		 816 aa  141  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30910  conjugal transfer ATPase TrbE  51.03 
 
 		 817 aa  140  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000414209  unclonable  1.71741e-21 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35690  conjugal transfer ATPase TrbE  49.66 
 
 		 816 aa  140  9e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1344  conjugal transfer ATPase TrbE  50.69 
 
 		 819 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4198  conjugal transfer ATPase TrbE  51.8 
 
 		 813 aa  138  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330213  normal  0.981224 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3503  conjugal transfer ATPase TrbE  48.7 
 
 		 823 aa  138  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2581  conjugal transfer ATPase TrbE  48.32 
 
 		 816 aa  136  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2908  conjugal transfer ATPase TrbE  52.27 
 
 		 811 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2648  conjugal transfer ATPase TrbE  51.49 
 
 		 825 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.947837  normal  0.965174 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5372  conjugal transfer ATPase TrbE  52.46 
 
 		 824 aa  121  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.259729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5221  conjugal transfer ATPase TrbE  52 
 
 		 819 aa  116  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4692  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  46.9 
 
 		 808 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1339  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  46.74 
 
 		 840 aa  94.4  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.18708 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0247  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  46.74 
 
 		 840 aa  94.4  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2349  conjugal transfer ATPase TrbE  34.38 
 
 		 820 aa  94  8e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1638  conjugal transfer protein trbE, putative  46.74 
 
 		 840 aa  93.6  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2228  conjugal transfer protein TrbE  47.06 
 
 		 854 aa  93.6  9e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0444639  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0050  conjugal transfer protein TrbE  49.02 
 
 		 845 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8331  conjugal transfer protein TrbE  43.31 
 
 		 820 aa  92  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359626  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6505  conjugal transfer protein TrbE  49.02 
 
 		 852 aa  91.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158384  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6632  conjugal transfer protein TrbE  49.02 
 
 		 852 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4271  conjugal transfer protein TrbE  49.02 
 
 		 852 aa  92  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000528773  normal  0.467859 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4566  conjugal transfer protein TrbE  50.54 
 
 		 817 aa  91.7  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9265  conjugal transfer protein TrbE  43.08 
 
 		 822 aa  90.9  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.502143  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1617  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system, conserved region  47.57 
 
 		 819 aa  89.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9656  conjugal transfer protein TrbE  48.04 
 
 		 687 aa  90.1  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5379  conjugal transfer protein TrbE  43.97 
 
 		 817 aa  90.1  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325542 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5485  conjugal transfer protein TrbE  39.23 
 
 		 815 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00798845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1717  conjugal transfer ATPase TrbE  33.59 
 
 		 819 aa  82.8  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.137188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2503  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  41.18 
 
 		 814 aa  81.6  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0884  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  37.25 
 
 		 843 aa  77.8  0.00000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1177  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  36 
 
 		 850 aa  73.9  0.0000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4346  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  30.83 
 
 		 793 aa  50.8  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677673  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4376  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  34.25 
 
 		 785 aa  48.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851787 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0677  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  29.25 
 
 		 796 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5086  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  29.25 
 
 		 790 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2821  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  34.38 
 
 		 827 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.901669 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0255  Type IV secretory pathway AvhB4 protein  31.58 
 
 		 788 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.849698 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4747  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  31.68 
 
 		 844 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290977 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5609  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  28.45 
 
 		 825 aa  41.6  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.931017  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>