201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1551 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1551  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  453  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209171  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19490  transcriptional regulator, tetR family  46.03 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4132  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  43.42 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 278 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 183 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3070  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  26.06 
 
 		 315 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4679  regulatory protein TetR  41.07 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 267 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  43.82 
 
 		 266 aa  52.4  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 304 aa  52  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 212 aa  52  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 192 aa  51.6  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  27.92 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 253 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3625  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  28.26 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  39.78 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 		 218 aa  48.9  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 255 aa  48.5  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 271 aa  48.5  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2453  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 223 aa  48.5  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106386  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 330 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 285 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2177  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 193 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.191251  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 191 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 263 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1793  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 311 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 218 aa  47  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.504351 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  37.29 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  26.43 
 
 		 213 aa  47  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 197 aa  47  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3840  nucleoid occlusion protein  36.99 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00664895  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 193 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 232 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3484  nucleoid occlusion protein  36.99 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000984177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4198  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 191 aa  46.2  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 218 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  30.34 
 
 		 193 aa  45.8  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 315 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4564  nucleoid occlusion protein  36.99 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000269162  unclonable  0.0000000294752 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  26.47 
 
 		 342 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 239 aa  45.8  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 204 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2195  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 189 aa  45.8  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0399  nucleoid occlusion protein  35.62 
 
 		 197 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0627309  hitchhiker  0.000000000130483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0374  nucleoid occlusion protein  35.62 
 
 		 197 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 406 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0373  nucleoid occlusion protein  35.62 
 
 		 197 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0485263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0385  nucleoid occlusion protein  35.62 
 
 		 197 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000224895  hitchhiker  0.00861349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 229 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  38 
 
 		 200 aa  45.1  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2869  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 192 aa  45.1  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 239 aa  45.1  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0382  nucleoid occlusion protein  35.62 
 
 		 197 aa  45.1  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000135011  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 216 aa  45.1  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 249 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1602  transcriptional regulator  23.48 
 
 		 208 aa  45.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 391 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5353  putative transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.565749  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4158  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 445 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0056  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 289 aa  44.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 193 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4372  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  0.0486392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>