More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1390 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3131  RND family efflux transporter MFP subunit  97.28 
 
 		 368 aa  708    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.419387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2987  RND family efflux transporter MFP subunit  99.18 
 
 		 368 aa  743    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.331807  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1390  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 368 aa  747    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2973  RND family efflux transporter MFP subunit  95.65 
 
 		 368 aa  698    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.388324  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2635  RND family efflux transporter MFP subunit  75.48 
 
 		 370 aa  567  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0171634  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3278  hypothetical protein  75.47 
 
 		 374 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1296  RND family efflux transporter MFP subunit  74.66 
 
 		 373 aa  550  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00794293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1246  RND family efflux transporter MFP subunit  73.05 
 
 		 373 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1316  RND family efflux transporter MFP subunit  73.24 
 
 		 373 aa  537  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0457326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1570  RND family efflux transporter MFP subunit  61.69 
 
 		 375 aa  430  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.628485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3112  RND family efflux transporter MFP subunit  59.3 
 
 		 374 aa  418  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1148  RND family efflux transporter MFP subunit  60.98 
 
 		 373 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1325  RND family efflux transporter MFP subunit  56.3 
 
 		 370 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.784041  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1278  secretion protein HlyD  57.95 
 
 		 370 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0363804  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1312  RND family efflux transporter MFP subunit  55.08 
 
 		 371 aa  389  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2342  secretion protein HlyD  55.46 
 
 		 370 aa  377  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.87 
 
 		 379 aa  186  5e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0251  efflux transporter  33.13 
 
 		 383 aa  160  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1310  secretion protein HlyD  30.13 
 
 		 379 aa  158  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.673983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4736  secretion protein HlyD  32.74 
 
 		 510 aa  133  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325985  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1593  RND family efflux transporter MFP subunit  29.55 
 
 		 631 aa  107  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351482  normal  0.814117 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  27.15 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.76 
 
 		 360 aa  104  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  26.97 
 
 		 365 aa  99.8  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.97 
 
 		 379 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1727  HlyD family secretion protein  29.18 
 
 		 409 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  32.73 
 
 		 407 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4313  RND family efflux transporter MFP subunit  29.48 
 
 		 409 aa  94  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.583259 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.95 
 
 		 402 aa  94  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  0.253617 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3225  RND family efflux transporter MFP subunit  29.14 
 
 		 392 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376119  normal  0.122741 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.73 
 
 		 407 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.95 
 
 		 402 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.227434 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4292  RND family efflux transporter MFP subunit  28.88 
 
 		 392 aa  93.2  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2871  RND family efflux transporter MFP subunit  23.54 
 
 		 357 aa  93.2  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4074  secretion protein HlyD  28.88 
 
 		 392 aa  92.8  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119469  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4188  RND family efflux transporter MFP subunit  28.65 
 
 		 410 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0941549  normal  0.890181 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  25.63 
 
 		 523 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1715  acriflavin resistance periplasmic protein  25.41 
 
 		 357 aa  92  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000921401  normal  0.0591325 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1653  putative transport/efflux transmembrane protein  26.56 
 
 		 402 aa  91.3  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.75 
 
 		 351 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  26.3 
 
 		 367 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  26.3 
 
 		 367 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2778  RND family efflux transporter MFP subunit  26.75 
 
 		 359 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.223876 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  27.35 
 
 		 363 aa  90.1  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3710  RND family efflux transporter MFP subunit  33.62 
 
 		 410 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6002  RND family efflux transporter MFP subunit  28.65 
 
 		 363 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249457  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  32.42 
 
 		 410 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1206  RND family efflux transporter MFP subunit  28.03 
 
 		 385 aa  89  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.8 
 
 		 417 aa  89  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255605  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  35.29 
 
 		 409 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0288  RND family efflux transporter MFP subunit  28.75 
 
 		 355 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527133 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2103  RND family efflux transporter MFP subunit  26.3 
 
 		 403 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0796794  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  25.07 
 
 		 367 aa  87.4  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4143  RND family efflux transporter MFP subunit  26.37 
 
 		 343 aa  87.4  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.478516 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4897  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.79 
 
 		 437 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.51776 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0836  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.51 
 
 		 363 aa  87.4  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0935853  normal  0.864756 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3820  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.79 
 
 		 437 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.03 
 
 		 379 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  29.09 
 
 		 366 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0809  hypothetical protein  25.95 
 
 		 360 aa  86.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.244326 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4902  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.53 
 
 		 368 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  28 
 
 		 354 aa  86.7  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  25.82 
 
 		 418 aa  86.7  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2426  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.84 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.54628  hitchhiker  0.0000000883837 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0915  secretion protein, putative  24.93 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2027  secretion protein HlyD  24.16 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423658  normal  0.283543 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1555  secretion protein HlyD  27.86 
 
 		 394 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  27.96 
 
 		 367 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0954  RND family efflux transporter MFP subunit  26.82 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3130  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.71 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.645496  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1372  secretion protein HlyD  27.99 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203736  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2295  RND family efflux transporter MFP subunit  26.82 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2162  RND family efflux transporter MFP subunit  26.82 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  27.94 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3773  RND family efflux transporter MFP subunit  24.58 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265534  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6327  RND family efflux transporter MFP subunit  30.42 
 
 		 478 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0452278  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1502  secretion protein HlyD  30.42 
 
 		 478 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184777  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2289  RND family efflux transporter MFP subunit  26.79 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412391  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  26.88 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.51 
 
 		 386 aa  82.8  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.39 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3223  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.7 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  24.87 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  24.87 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1063  hypothetical protein  30.73 
 
 		 262 aa  82.4  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.93 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.631291  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4102  RND family efflux transporter MFP subunit  28.78 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2557  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.59 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000027885  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4857  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.85 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1967  RND family efflux transporter MFP subunit  28.8 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0310111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6991  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 		 472 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231557 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.17 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.331949  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6292  RND family efflux transporter MFP subunit  28.21 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.585328  hitchhiker  0.00894017 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2814  RND family efflux transporter MFP subunit  31.02 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02155  putative transport transmembrane protein  29.67 
 
 		 421 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2214  putative component of multidrug efflux system  25.47 
 
 		 368 aa  80.5  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.082194  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4616  secretion protein HlyD  28.46 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2818  secretion protein HlyD  24.04 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4363  RND efflux system membrane fusion protein  28.69 
 
 		 467 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234106  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>