More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0734 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 736 aa  1489    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  42.07 
 
 		 729 aa  550  1e-155  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1198  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 754 aa  228  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211844 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1483  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 754 aa  228  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  28.61 
 
 		 760 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  28.46 
 
 		 760 aa  221  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 790 aa  211  6e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 747 aa  206  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0160  outer membrane receptor protein  24.9 
 
 		 740 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 786 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 746 aa  197  5.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0676  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 756 aa  197  5.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.102109  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0440  TonB-dependent receptor, putative  26.03 
 
 		 734 aa  190  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 828 aa  185  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 815 aa  183  9.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1253  TonB-dependent receptor, putative  24.61 
 
 		 740 aa  182  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0080071  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1997  TonB-dependent receptor, putative  25.53 
 
 		 741 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1540  TonB-dependent receptor, putative  24.89 
 
 		 730 aa  169  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2061  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 742 aa  167  9e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.302386  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 786 aa  155  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 798 aa  153  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0369  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 782 aa  139  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2519  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 782 aa  137  9e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131105 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 738 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 738 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 780 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.45 
 
 		 766 aa  131  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 768 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 792 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 766 aa  121  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 772 aa  118  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 		 841 aa  117  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 753 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2134  TonB-dependent receptor plug  24.16 
 
 		 781 aa  110  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.682313 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 777 aa  92.8  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  26.54 
 
 		 760 aa  87.4  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 796 aa  86.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2846  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.84 
 
 		 728 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0306235  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 835 aa  84.3  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  26.05 
 
 		 768 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 765 aa  82  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2298  TonB-dependent receptor  21.66 
 
 		 735 aa  82  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.951085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1941  TonB-dependent receptor  21.66 
 
 		 735 aa  82  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.299321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  27.16 
 
 		 715 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 777 aa  80.9  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1484  hypothetical protein  27.78 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1199  hypothetical protein  27.78 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052926 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 768 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 791 aa  79.3  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  24.51 
 
 		 768 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  27.11 
 
 		 814 aa  77  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  25.57 
 
 		 753 aa  76.6  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3410  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 781 aa  76.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  24.73 
 
 		 711 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3229  TonB-dependent receptor  21.89 
 
 		 768 aa  75.1  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2832  TonB-dependent receptor  21.89 
 
 		 768 aa  75.1  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  24.44 
 
 		 710 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  23.01 
 
 		 705 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  26.83 
 
 		 809 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  23.75 
 
 		 708 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2585  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 790 aa  73.9  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0776775  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 747 aa  73.9  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0798  TonB-dependent siderophore receptor  23.67 
 
 		 773 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  27.23 
 
 		 742 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.44 
 
 		 711 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  22.47 
 
 		 711 aa  71.6  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  23.96 
 
 		 780 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  26.07 
 
 		 881 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  26.07 
 
 		 881 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  26.07 
 
 		 882 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1927  TonB dependent receptor  22.87 
 
 		 725 aa  70.9  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0622578  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 796 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 790 aa  70.5  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  23.17 
 
 		 763 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.31218 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 758 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  23.79 
 
 		 743 aa  68.9  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0485  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 702 aa  68.2  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517963  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1180  TonB-dependent siderophore receptor  25.64 
 
 		 679 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14569  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  23.69 
 
 		 726 aa  68.2  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  26.28 
 
 		 703 aa  68.2  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  25.64 
 
 		 881 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  25.64 
 
 		 921 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  25.64 
 
 		 921 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3467  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4420  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 762 aa  67.4  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 733 aa  67.4  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  21.97 
 
 		 710 aa  67  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2634  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 814 aa  67.4  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 796 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  24.5 
 
 		 810 aa  66.6  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  23.91 
 
 		 858 aa  67  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  23.62 
 
 		 708 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 634 aa  66.6  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  24.16 
 
 		 728 aa  67  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  22.58 
 
 		 726 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  24.01 
 
 		 709 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  23.91 
 
 		 855 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  23.91 
 
 		 855 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 758 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  26.46 
 
 		 718 aa  66.2  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>