More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0802 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3779  MATE efflux family protein  89.6 
 
 		 453 aa  766    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0802  MATE efflux family protein  100 
 
 		 453 aa  903    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3656  MATE efflux family protein  88.94 
 
 		 453 aa  760    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3187  MATE efflux family protein  88.52 
 
 		 486 aa  756    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3315  MATE efflux family protein  94.24 
 
 		 456 aa  801    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0638  MATE efflux family protein  94.24 
 
 		 456 aa  801    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3485  MATE efflux family protein  94.24 
 
 		 453 aa  797    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0649  MATE efflux family protein  89.16 
 
 		 453 aa  762    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3589  MATE efflux family protein  88.72 
 
 		 476 aa  758    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  51.13 
 
 		 446 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06935  Na+-driven multidrug efflux pump  50.45 
 
 		 446 aa  462  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  38.98 
 
 		 450 aa  328  9e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  40.64 
 
 		 456 aa  313  4.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  38.99 
 
 		 450 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  35.03 
 
 		 463 aa  272  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  34.84 
 
 		 464 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  35.07 
 
 		 464 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  34.84 
 
 		 464 aa  265  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  34.84 
 
 		 464 aa  264  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  34.84 
 
 		 464 aa  264  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  34.84 
 
 		 464 aa  264  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  34.84 
 
 		 464 aa  264  3e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  34.99 
 
 		 463 aa  264  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  34.84 
 
 		 464 aa  262  8e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  34.76 
 
 		 464 aa  260  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  34.39 
 
 		 442 aa  249  7e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  34.3 
 
 		 464 aa  242  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  34.87 
 
 		 446 aa  233  5e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0078  mate efflux family protein  32.71 
 
 		 439 aa  229  1e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.129262  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  30.12 
 
 		 439 aa  209  9e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  28.38 
 
 		 440 aa  193  5e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  26.33 
 
 		 440 aa  176  9e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  27.33 
 
 		 469 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0009  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.31 
 
 		 555 aa  164  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.64807  hitchhiker  0.000313529 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  25.61 
 
 		 475 aa  141  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1050  MATE efflux family protein  27.44 
 
 		 438 aa  137  5e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0807602  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0648  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 438 aa  134  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0722  MATE efflux family protein  26.26 
 
 		 438 aa  133  6e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0500546  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0795  conserved hypothetical integral membrane protein, MATE family efflux protein  26.38 
 
 		 438 aa  132  9e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.472325  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.37 
 
 		 464 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.37 
 
 		 464 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 467 aa  127  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  23.97 
 
 		 464 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  25.38 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  27.03 
 
 		 469 aa  123  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  26.33 
 
 		 461 aa  123  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0446  multi anti extrusion protein MatE  26.83 
 
 		 455 aa  120  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  26.19 
 
 		 451 aa  116  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  26.15 
 
 		 452 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  23.45 
 
 		 453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  24.88 
 
 		 450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  24.83 
 
 		 461 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 445 aa  111  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  22.35 
 
 		 475 aa  110  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7312  hypothetical protein  26.19 
 
 		 458 aa  110  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  24.61 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  23.6 
 
 		 446 aa  107  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  23.52 
 
 		 474 aa  105  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  23.93 
 
 		 474 aa  104  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  25.67 
 
 		 502 aa  104  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  23.52 
 
 		 474 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  29.24 
 
 		 462 aa  104  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  25.11 
 
 		 478 aa  103  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  23.52 
 
 		 476 aa  103  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  27.34 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  27.34 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  23.93 
 
 		 476 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  24.56 
 
 		 445 aa  100  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  23.02 
 
 		 495 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  23.02 
 
 		 484 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  24.16 
 
 		 468 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  23.02 
 
 		 495 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  21.95 
 
 		 460 aa  97.8  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  23.36 
 
 		 484 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  23.49 
 
 		 547 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  23.49 
 
 		 547 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  23.49 
 
 		 546 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  25.33 
 
 		 485 aa  97.1  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  23.49 
 
 		 546 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  23.7 
 
 		 458 aa  96.3  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  22.27 
 
 		 445 aa  95.9  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  23.36 
 
 		 499 aa  96.3  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1856  multidrug efflux protein  21.91 
 
 		 455 aa  95.5  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.30191  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  23.99 
 
 		 459 aa  95.1  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  25.79 
 
 		 486 aa  94.4  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  24.21 
 
 		 461 aa  94.4  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0056  MATE efflux family protein  23.66 
 
 		 412 aa  94  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  25.5 
 
 		 480 aa  92.4  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  22.95 
 
 		 461 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1313  Na+-driven multidrug efflux pump  22.84 
 
 		 449 aa  92  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0190769  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  23.53 
 
 		 518 aa  92  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0522  MATE efflux family protein  22.05 
 
 		 461 aa  92  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  22.65 
 
 		 453 aa  91.7  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 469 aa  90.9  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2333  MATE efflux family protein  24.02 
 
 		 456 aa  90.5  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  24.32 
 
 		 468 aa  89.7  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  24.01 
 
 		 478 aa  89.4  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2494  MATE efflux family protein  23.27 
 
 		 458 aa  88.6  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121522  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  24.36 
 
 		 483 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>