248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1357 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  100 
 
 		 575 aa  1154    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  63.87 
 
 		 574 aa  771    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  61.81 
 
 		 580 aa  769    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  59.41 
 
 		 582 aa  715    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  31.16 
 
 		 634 aa  284  3.0000000000000004e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  32.33 
 
 		 588 aa  231  2e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  26.79 
 
 		 550 aa  150  5e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  26.24 
 
 		 619 aa  147  5e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  26.65 
 
 		 541 aa  134  5e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  24.31 
 
 		 774 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  27.32 
 
 		 617 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  22.83 
 
 		 791 aa  112  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0134  DEAD_2 domain-containing protein  24.48 
 
 		 537 aa  112  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00117441 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  24.5 
 
 		 781 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  24.79 
 
 		 785 aa  109  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  24.5 
 
 		 781 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1536  DEAD_2 domain protein  24.96 
 
 		 537 aa  108  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.849616  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  23.39 
 
 		 790 aa  107  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  25.12 
 
 		 798 aa  106  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  24.92 
 
 		 798 aa  103  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  24.38 
 
 		 669 aa  98.6  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  22.91 
 
 		 712 aa  97.8  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  23.95 
 
 		 753 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  24.55 
 
 		 753 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  23.78 
 
 		 762 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  22.84 
 
 		 797 aa  91.3  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  23.67 
 
 		 773 aa  90.5  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  24.2 
 
 		 775 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  23.95 
 
 		 753 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  24.5 
 
 		 750 aa  87.4  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  22.09 
 
 		 777 aa  87.4  7e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  23.42 
 
 		 761 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  23.75 
 
 		 754 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  23.86 
 
 		 852 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05090  CHL1 helicase, putative  21.01 
 
 		 849 aa  83.6  0.000000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  23.6 
 
 		 754 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  23.32 
 
 		 773 aa  83.2  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  22.24 
 
 		 676 aa  82.8  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  23.79 
 
 		 669 aa  82  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  24.54 
 
 		 758 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  24.37 
 
 		 785 aa  80.5  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  23.63 
 
 		 758 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  23.8 
 
 		 739 aa  79  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10414  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05590)  21.8 
 
 		 841 aa  78.6  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  23.03 
 
 		 654 aa  78.2  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  29.92 
 
 		 722 aa  77.8  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  23.31 
 
 		 779 aa  77.4  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  22.15 
 
 		 807 aa  77.4  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32894  predicted protein  22.13 
 
 		 1067 aa  76.3  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0780237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  28.69 
 
 		 739 aa  75.5  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  29.32 
 
 		 773 aa  75.5  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  23.53 
 
 		 772 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  21.9 
 
 		 670 aa  75.5  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  24.78 
 
 		 649 aa  74.7  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  23.28 
 
 		 723 aa  74.3  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  21.9 
 
 		 801 aa  73.9  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  23.32 
 
 		 798 aa  73.6  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  22.22 
 
 		 707 aa  71.2  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1453  helicase c2  30.24 
 
 		 669 aa  70.9  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  23.97 
 
 		 639 aa  70.9  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0534  helicase c2  30.24 
 
 		 669 aa  70.5  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  20.78 
 
 		 938 aa  69.7  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  23.08 
 
 		 745 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  23.35 
 
 		 766 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  23.35 
 
 		 766 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  23.01 
 
 		 766 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  23.58 
 
 		 639 aa  68.6  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  23.42 
 
 		 793 aa  68.9  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0371  DNA repair helicase RAD3  28.28 
 
 		 669 aa  68.6  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  24.5 
 
 		 647 aa  68.2  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  23.01 
 
 		 766 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  27.05 
 
 		 874 aa  68.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  22.57 
 
 		 636 aa  67.8  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  22.67 
 
 		 766 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  24.22 
 
 		 639 aa  67.4  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  22.63 
 
 		 636 aa  67  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  25.09 
 
 		 641 aa  66.6  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  22.1 
 
 		 788 aa  66.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  25.09 
 
 		 641 aa  66.6  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  18.76 
 
 		 835 aa  67  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  22.57 
 
 		 636 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  22.57 
 
 		 636 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0979  helicase domain-containing protein  24.83 
 
 		 706 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0544879  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  22.57 
 
 		 636 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  22.5 
 
 		 766 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  22.67 
 
 		 766 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  22.57 
 
 		 636 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  22.57 
 
 		 636 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  22.68 
 
 		 640 aa  65.9  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  22.44 
 
 		 756 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2228  helicase c2  24.67 
 
 		 639 aa  65.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.232993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  22.57 
 
 		 636 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  24.21 
 
 		 636 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  21.47 
 
 		 667 aa  65.9  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  24.21 
 
 		 636 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  24.21 
 
 		 636 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  24.21 
 
 		 636 aa  65.1  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  22.41 
 
 		 636 aa  65.1  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  25.28 
 
 		 799 aa  64.7  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  23.28 
 
 		 726 aa  63.9  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>