125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03946 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03946  transcriptional regulator MarR family  100 
 
 		 143 aa  278  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.828616  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 184 aa  117  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  31.75 
 
 		 157 aa  76.6  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  40.34 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0986  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  39.17 
 
 		 163 aa  73.6  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  32.84 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1381  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421757  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  31.36 
 
 		 177 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  22.48 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3825  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 		 169 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 183 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 193 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0789  MarR family transcriptional regulator  21.8 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.232655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0773  MarR family transcriptional regulator  21.8 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 171 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 159 aa  47.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 172 aa  47  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2611  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 170 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000285169  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 		 162 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 157 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  27.18 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 172 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 167 aa  45.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  32.81 
 
 		 176 aa  45.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  27.12 
 
 		 178 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 178 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  30.51 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  28.68 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  25.41 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 190 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  27 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  24.59 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  24.59 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2093  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0119  MarR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.855711 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0962  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.632942  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  27.42 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>