More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1121 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1121  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 220 aa  443  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.2139 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37210  transcriptional regulator  44.55 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  31.22 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 246 aa  61.6  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1320  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  28.26 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0389  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.245239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2112  transcriptional regulator, TetR family  43.04 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935315  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1459  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3088  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 235 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  32.05 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3148  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 235 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3108  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 235 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 219 aa  52  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 221 aa  52  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 223 aa  51.6  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6735  TetR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1572  TetR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6259  TetR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  35.53 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  36.51 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4864  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3612  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000248131  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3621  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  46.38 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3703  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3280  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3389  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3352  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000543998  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04290  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 230 aa  49.7  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0356089  normal  0.115644 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3654  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.786622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3605  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.02462e-25 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1614  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 197 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0287431  hitchhiker  0.0000000422838 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1382  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 217 aa  48.9  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 254 aa  49.3  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 256 aa  49.3  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  27.31 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 257 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  45.31 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 201 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 185 aa  48.9  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 222 aa  48.5  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 186 aa  48.5  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 237 aa  48.5  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 248 aa  48.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 288 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 217 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 207 aa  48.1  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1000  regulatory protein, TetR  33.8 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1179  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 290 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 357 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  37.1 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  45.31 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  21.93 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>