More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0216 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  56.63 
 
 		 1199 aa  1084    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  56.22 
 
 		 1191 aa  1105    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  57.12 
 
 		 1186 aa  966    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  53.73 
 
 		 1195 aa  997    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  59.61 
 
 		 1224 aa  1224    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  57.32 
 
 		 1198 aa  1106    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  69.76 
 
 		 1183 aa  1314    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  50.41 
 
 		 1205 aa  931    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  57.31 
 
 		 1194 aa  1149    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  51.64 
 
 		 1263 aa  915    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  51.28 
 
 		 1194 aa  971    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  52.07 
 
 		 1194 aa  969    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  41.55 
 
 		 1225 aa  745    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  52.5 
 
 		 1222 aa  929    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  55.33 
 
 		 1191 aa  981    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  52.46 
 
 		 1214 aa  972    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  55.22 
 
 		 1203 aa  961    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  51.88 
 
 		 1217 aa  967    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  55.1 
 
 		 1191 aa  994    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  52.25 
 
 		 1195 aa  951    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  57.58 
 
 		 1198 aa  1095    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  52.25 
 
 		 1195 aa  951    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  51.45 
 
 		 1194 aa  968    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  57.12 
 
 		 1188 aa  984    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  50.86 
 
 		 1217 aa  873    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  53.4 
 
 		 1213 aa  941    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  53.41 
 
 		 1222 aa  1028    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  52 
 
 		 1195 aa  944    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  56.47 
 
 		 1188 aa  978    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  58.93 
 
 		 1218 aa  1050    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1181 aa  2269    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  56.28 
 
 		 1188 aa  1108    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  58.02 
 
 		 1227 aa  576  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  75.84 
 
 		 1234 aa  482  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  34.56 
 
 		 1179 aa  473  1e-132  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  28.66 
 
 		 1190 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  29.33 
 
 		 1190 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  28.8 
 
 		 1185 aa  469  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  32.31 
 
 		 1176 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  30.33 
 
 		 1186 aa  450  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  30.79 
 
 		 1187 aa  446  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  28.39 
 
 		 1191 aa  440  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  32.48 
 
 		 1175 aa  436  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  27.95 
 
 		 1188 aa  436  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  27.95 
 
 		 1188 aa  436  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  29.14 
 
 		 1148 aa  415  1e-114  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  29 
 
 		 1186 aa  414  1e-114  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  30.1 
 
 		 1177 aa  413  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  29.81 
 
 		 1204 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  29.1 
 
 		 1174 aa  403  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  32.03 
 
 		 1177 aa  393  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  31.71 
 
 		 1199 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  31.78 
 
 		 1199 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  26.7 
 
 		 1178 aa  390  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  28.32 
 
 		 1185 aa  372  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  65.11 
 
 		 1172 aa  372  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  31.4 
 
 		 1163 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  28.23 
 
 		 1191 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  31.3 
 
 		 1162 aa  360  9e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  31.09 
 
 		 1168 aa  352  3e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  31.39 
 
 		 1164 aa  351  5e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  29.5 
 
 		 1168 aa  341  5.9999999999999996e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  30.63 
 
 		 1162 aa  337  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  29.43 
 
 		 1162 aa  335  4e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  29.82 
 
 		 1182 aa  334  5e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  28.19 
 
 		 1142 aa  329  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  30.07 
 
 		 1198 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  28.19 
 
 		 1142 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  29.27 
 
 		 1268 aa  320  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  29.53 
 
 		 1172 aa  320  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  26.99 
 
 		 1170 aa  319  2e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  28.38 
 
 		 1142 aa  319  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  29.71 
 
 		 1198 aa  318  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  26.94 
 
 		 1170 aa  316  9.999999999999999e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  34.18 
 
 		 1187 aa  311  4e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  30.97 
 
 		 1154 aa  305  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  25.62 
 
 		 1164 aa  301  4e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  33.33 
 
 		 1189 aa  295  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  36.19 
 
 		 1174 aa  291  4e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  41.6 
 
 		 1184 aa  291  5.0000000000000004e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  33.15 
 
 		 1189 aa  291  6e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  32.15 
 
 		 1189 aa  290  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  31.29 
 
 		 1196 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  28.71 
 
 		 1134 aa  284  7.000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  32.88 
 
 		 1189 aa  283  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  33.02 
 
 		 1189 aa  283  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  32.88 
 
 		 1189 aa  283  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  32.36 
 
 		 1189 aa  283  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  33.02 
 
 		 1189 aa  283  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  32.36 
 
 		 1189 aa  282  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  31.2 
 
 		 1403 aa  282  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  32.36 
 
 		 1189 aa  282  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  56.54 
 
 		 1186 aa  281  4e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  25.46 
 
 		 1184 aa  280  1e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  23.37 
 
 		 1153 aa  269  2e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  27.37 
 
 		 1308 aa  269  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  28.21 
 
 		 1189 aa  265  3e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  24.03 
 
 		 1191 aa  266  3e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  46.88 
 
 		 1185 aa  260  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  21.34 
 
 		 1174 aa  259  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>