More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0783 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  40.44 
 
 		 1075 aa  800    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  49.45 
 
 		 1081 aa  1024    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  62.69 
 
 		 1069 aa  1367    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  63.68 
 
 		 1064 aa  1400    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  39.82 
 
 		 1077 aa  735    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  41.79 
 
 		 1074 aa  803    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  41.69 
 
 		 1075 aa  851    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  53.49 
 
 		 1067 aa  1165    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  37.63 
 
 		 1053 aa  678    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  39.64 
 
 		 1112 aa  760    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  65.03 
 
 		 1071 aa  1415    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  42.79 
 
 		 1090 aa  844    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  40.51 
 
 		 1082 aa  808    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  46.93 
 
 		 1085 aa  992    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 1077 aa  2207    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  66.17 
 
 		 1072 aa  1475    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  41.01 
 
 		 1078 aa  745    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  64.74 
 
 		 1065 aa  1429    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  51.38 
 
 		 1083 aa  1138    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  63.16 
 
 		 1077 aa  1374    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  39.09 
 
 		 1075 aa  766    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  39.91 
 
 		 1087 aa  807    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  61.87 
 
 		 1078 aa  1353    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  37.58 
 
 		 1065 aa  665    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  49.45 
 
 		 1089 aa  1046    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3488  type III restriction enzyme, res subunit  39.36 
 
 		 696 aa  480  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325873  normal  0.223098 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  28.74 
 
 		 1016 aa  248  4e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  28.59 
 
 		 1124 aa  246  9.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  28.15 
 
 		 1131 aa  244  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  27.89 
 
 		 1143 aa  231  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  28.36 
 
 		 1153 aa  217  9e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  28.74 
 
 		 1128 aa  195  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  26.4 
 
 		 1051 aa  179  3e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  26.1 
 
 		 1052 aa  174  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  25.21 
 
 		 1086 aa  173  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  26.63 
 
 		 853 aa  172  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  27.34 
 
 		 1153 aa  172  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  26.19 
 
 		 1086 aa  171  9e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  27.47 
 
 		 1100 aa  170  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  25.6 
 
 		 1086 aa  164  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  26.03 
 
 		 1109 aa  162  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  24.7 
 
 		 1099 aa  149  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  25.34 
 
 		 1080 aa  145  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  23.79 
 
 		 1127 aa  142  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  26.16 
 
 		 1060 aa  139  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  22.72 
 
 		 1117 aa  130  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  24.73 
 
 		 1125 aa  124  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  24.27 
 
 		 1109 aa  108  6e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  40.4 
 
 		 1140 aa  105  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  26.66 
 
 		 932 aa  100  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  25.74 
 
 		 966 aa  94.7  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  26.15 
 
 		 1172 aa  89.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  26.33 
 
 		 1122 aa  88.6  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  23.64 
 
 		 1160 aa  87.8  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  24.83 
 
 		 949 aa  86.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  28.8 
 
 		 1147 aa  85.5  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  36.15 
 
 		 1065 aa  85.5  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  36.15 
 
 		 1065 aa  85.5  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  31.84 
 
 		 933 aa  84.3  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  25.17 
 
 		 950 aa  83.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  37.87 
 
 		 1170 aa  82.8  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  24.29 
 
 		 952 aa  82.8  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  36.41 
 
 		 906 aa  82.8  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  28.93 
 
 		 1065 aa  82.4  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  35.16 
 
 		 1170 aa  82  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  23.17 
 
 		 900 aa  81.3  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  33.12 
 
 		 948 aa  81.3  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  33.22 
 
 		 1137 aa  80.9  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  31.2 
 
 		 988 aa  81.3  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  36.7 
 
 		 1172 aa  80.9  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  27.68 
 
 		 1057 aa  80.9  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  37.5 
 
 		 1037 aa  79  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  35.03 
 
 		 760 aa  78.6  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  22.89 
 
 		 1177 aa  78.6  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  26.37 
 
 		 1187 aa  78.6  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  37.06 
 
 		 946 aa  78.2  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  24.83 
 
 		 962 aa  78.2  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0985  helicase domain-containing protein  27.55 
 
 		 813 aa  77.8  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.033377  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  27.86 
 
 		 919 aa  76.3  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  29.05 
 
 		 945 aa  75.9  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  28.76 
 
 		 966 aa  75.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0716  helicase domain-containing protein  32.92 
 
 		 819 aa  75.1  0.000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000339602 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  36.46 
 
 		 1168 aa  74.7  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  34.29 
 
 		 1043 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0725  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  31.06 
 
 		 949 aa  73.9  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  30.29 
 
 		 940 aa  74.3  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  33.14 
 
 		 969 aa  74.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  27.94 
 
 		 1116 aa  73.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  30.8 
 
 		 829 aa  73.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  30.61 
 
 		 1144 aa  72.8  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  29.92 
 
 		 835 aa  72.4  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  25.29 
 
 		 1082 aa  72  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  33.33 
 
 		 1131 aa  72  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 1167 aa  71.6  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  34.39 
 
 		 1160 aa  71.2  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  36.05 
 
 		 1136 aa  70.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0278  helicase domain protein  31.54 
 
 		 915 aa  71.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  32.69 
 
 		 1167 aa  70.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  30.94 
 
 		 1046 aa  70.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  30.81 
 
 		 560 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>