203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1301 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1301  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  618  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2631  DNA ligase D  60.2 
 
 		 865 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2977  DNA ligase D  52.98 
 
 		 845 aa  306  3e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246159 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1337  ATP dependent DNA ligase  49.13 
 
 		 868 aa  295  8e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402102 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1218  ATP dependent DNA ligase  51.27 
 
 		 846 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.257773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2679  ATP-dependent DNA ligase  48.78 
 
 		 868 aa  291  7e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3982  DNA ligase D  52.29 
 
 		 837 aa  288  6e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.242041 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5282  DNA ligase D  51.15 
 
 		 658 aa  288  8e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.889453 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4186  hypothetical protein  49.33 
 
 		 330 aa  282  6.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0264097  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1951  DNA ligase D  46.59 
 
 		 822 aa  268  7e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00524792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1729  DNA ligase D  45.26 
 
 		 813 aa  267  1e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256122  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1695  ATP dependent DNA ligase  50 
 
 		 843 aa  264  1e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616199  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0568  DNA ligase D  46.69 
 
 		 818 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000109107  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  47.23 
 
 		 825 aa  259  5.0000000000000005e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7647  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  46.92 
 
 		 544 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1150  ATP dependent DNA ligase  45.91 
 
 		 845 aa  250  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0488  DNA ligase D  43.65 
 
 		 867 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160576  normal  0.373477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0501  DNA ligase D  43.65 
 
 		 863 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535245  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2135  DNA ligase D  40.99 
 
 		 815 aa  233  3e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2328  putative ATP-dependent DNA ligase  41.26 
 
 		 1001 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455665  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4315  DNA ligase D  41.24 
 
 		 834 aa  228  8e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1858  DNA ligase D  40.21 
 
 		 940 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.170046  normal  0.216644 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3217  ATP-dependent DNA ligase  40.8 
 
 		 837 aa  226  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.311781 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2239  DNA ligase D  42.44 
 
 		 856 aa  223  4e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.839838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2501  ATP-dependent DNA ligase  40.86 
 
 		 833 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3260  ATP-dependent DNA ligase  40.2 
 
 		 833 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3464  DNA ligase, ATP-dependent, putative  38.13 
 
 		 851 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6783  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  42.49 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  42.24 
 
 		 656 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3245  ATP-dependent DNA ligase  37.67 
 
 		 866 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.833216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2635  ATP-dependent DNA ligase  41.47 
 
 		 833 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232561  normal  0.576376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3685  ATP-dependent DNA ligase  41.07 
 
 		 911 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.865038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0981  DNA ligase D  38.36 
 
 		 954 aa  218  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2988  DNA ligase, ATP-dependent  40.47 
 
 		 1163 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1335  ATP-dependent DNA ligase  40.47 
 
 		 980 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3112  DNA ligase D  40.47 
 
 		 1157 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0919454  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1876  ATP-dependent DNA ligase  40.49 
 
 		 914 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.907588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5875  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  41.39 
 
 		 297 aa  215  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0832  DNA ligase D  41.9 
 
 		 684 aa  215  8e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0784  ATP dependent DNA ligase  41.84 
 
 		 658 aa  215  9e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0836  DNA ligase D  41.9 
 
 		 683 aa  215  9e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3173  ATP-dependent DNA ligase  40.27 
 
 		 847 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2651  ATP-dependent DNA ligase  40.4 
 
 		 832 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.819142  normal  0.570676 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36910  ATP-dependent DNA ligase  39.93 
 
 		 840 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0564843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0382  DNA ligase D  41.54 
 
 		 644 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0448  ATP-dependent DNA ligase  41.29 
 
 		 866 aa  212  5.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0011  ATP-dependent DNA ligase  37.72 
 
 		 864 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0339968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6329  ATP-dependent DNA ligase  40.07 
 
 		 895 aa  211  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0632091 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2097  ATP-dependent DNA ligase  37.93 
 
 		 848 aa  211  9e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1177  ATP-dependent DNA ligase  38.08 
 
 		 853 aa  210  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2247  ATP-dependent DNA ligase  38.46 
 
 		 846 aa  209  5e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0498  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  40.3 
 
 		 298 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5079  ATP-dependent DNA ligase  37.79 
 
 		 901 aa  208  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.795218  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4365  ATP-dependent DNA ligase  40.07 
 
 		 886 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6073  DNA ligase D  38.03 
 
 		 927 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6483  ATP dependent DNA ligase  38.03 
 
 		 936 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1346  ATP dependent DNA ligase  38.03 
 
 		 936 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.893044  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1769  ATP-dependent DNA ligase  42.58 
 
 		 918 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7582  DNA ligase D  37.04 
 
 		 651 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4339  ATP-dependent DNA ligase  38.6 
 
 		 871 aa  202  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0275716 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2523  ATP-dependent DNA ligase  38.32 
 
 		 837 aa  202  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000543878 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3490  ATP-dependent DNA ligase  38.38 
 
 		 930 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6340  DNA ligase D  37.83 
 
 		 949 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.15116 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1660  ATP-dependent DNA ligase  39.13 
 
 		 847 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.600549  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4424  ATP-dependent DNA ligase  36.15 
 
 		 825 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0379748  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5476  DNA ligase D  38.23 
 
 		 927 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388357 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4171  ATP-dependent DNA ligase  39.77 
 
 		 914 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.497319  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0353  ATP-dependent DNA ligase  39.77 
 
 		 913 aa  199  5e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.344654 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3907  ATP-dependent DNA ligase  40.23 
 
 		 900 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.989644  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4303  DNA ligase D  40.73 
 
 		 817 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5610  ATP dependent DNA ligase  37.17 
 
 		 932 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4772  DNA ligase D  36.36 
 
 		 651 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8017  ATP-dependent DNA ligase  39.03 
 
 		 893 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8275  ATP-dependent DNA ligase  39.03 
 
 		 383 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0118926  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1736  ATP-dependent DNA ligase  36.59 
 
 		 888 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.946456 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5638  ATP-dependent DNA ligase  37.59 
 
 		 882 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2519  ATP-dependent DNA ligase  38.03 
 
 		 939 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5705  ATP-dependent DNA ligase  36.52 
 
 		 883 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5341  ATP-dependent DNA ligase  35.29 
 
 		 881 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0581605 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3003  ATP-dependent DNA ligase  36.76 
 
 		 882 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0636525  normal  0.554248 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2226  DNA polymerase LigD polymerase subunit  37.01 
 
 		 299 aa  176  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7781  putative DNA ligase-like protein  36.08 
 
 		 317 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0711104  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2802  DNA polymerase LigD, polymerase domain-containing protein  34.59 
 
 		 302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3248  DNA polymerase LigD polymerase subunit  34.72 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0258  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  37.79 
 
 		 292 aa  159  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.863775  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2258  DNA polymerase LigD polymerase domain-containing subunit  34.85 
 
 		 332 aa  155  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1543  DNA primase, small subunit  35.47 
 
 		 341 aa  155  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  33.8 
 
 		 831 aa  155  7e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5821  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  33.21 
 
 		 352 aa  155  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.305654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1124  hypothetical protein  29.21 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2815  DNA polymerase LigD, polymerase domain-containing protein  33.59 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0520  ATP-dependent DNA ligase  35.38 
 
 		 828 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  33.2 
 
 		 763 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5867  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.51 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1486  DNA polymerase LigD polymerase subunit  36.33 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018157 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1828  ATP-dependent DNA ligase  32.82 
 
 		 766 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2082  hypothetical protein  32.96 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2837  ATP-dependent DNA ligase  29.55 
 
 		 896 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4732  ATP-dependent DNA ligase  33.73 
 
 		 758 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3085  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  29.66 
 
 		 299 aa  152  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>