More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4732 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0653  ATP-dependent DNA ligase  49.14 
 
 
816 aa  657    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0201  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  49.48 
 
 
778 aa  715    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.173659  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  50.36 
 
 
831 aa  736    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  47.67 
 
 
797 aa  682    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4352  ATP-dependent DNA ligase  98.81 
 
 
758 aa  1524    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10956  ATP-dependent DNA ligase  69.88 
 
 
759 aa  1080    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4438  ATP-dependent DNA ligase  98.81 
 
 
758 aa  1524    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0862477 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  81.36 
 
 
763 aa  1257    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4732  ATP-dependent DNA ligase  100 
 
 
758 aa  1543    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333349  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1828  ATP-dependent DNA ligase  81.83 
 
 
766 aa  1255    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13060  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  44.88 
 
 
852 aa  610  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  43.18 
 
 
847 aa  604  1.0000000000000001e-171  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2233  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  44.12 
 
 
858 aa  598  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0520  ATP-dependent DNA ligase  44.14 
 
 
828 aa  593  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0294  ATP-dependent DNA ligase  42.5 
 
 
845 aa  580  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19790  ATP-dependent DNA ligase  43.2 
 
 
878 aa  568  1e-160  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.0111766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5248  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  44.93 
 
 
495 aa  378  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19885  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34920  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  45.34 
 
 
477 aa  351  3e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140848  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4716  DNA ligase D  42.38 
 
 
815 aa  336  1e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795355  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  34.91 
 
 
855 aa  283  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1237  ATP dependent DNA ligase  52.63 
 
 
304 aa  273  7e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  35.22 
 
 
877 aa  272  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0501  DNA ligase D  36.85 
 
 
863 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535245  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  34.03 
 
 
861 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3217  ATP-dependent DNA ligase  36.14 
 
 
837 aa  266  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.311781 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  35.8 
 
 
871 aa  261  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  36.47 
 
 
847 aa  258  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0109  DNA ligase D  35.66 
 
 
872 aa  257  6e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0363186 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2977  DNA ligase D  34.47 
 
 
845 aa  257  6e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.246159 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3464  DNA ligase, ATP-dependent, putative  35.65 
 
 
851 aa  257  7e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0488  DNA ligase D  36.21 
 
 
867 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160576  normal  0.373477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2120  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  38.01 
 
 
436 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0836628  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4339  ATP-dependent DNA ligase  36.21 
 
 
871 aa  255  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0275716 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36910  ATP-dependent DNA ligase  35.58 
 
 
840 aa  253  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0564843  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3173  ATP-dependent DNA ligase  35.39 
 
 
847 aa  251  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1951  DNA ligase D  35.74 
 
 
822 aa  250  8e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00524792  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  44.76 
 
 
321 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2097  ATP-dependent DNA ligase  33.89 
 
 
848 aa  243  7e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2135  DNA ligase D  34.42 
 
 
815 aa  243  1e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3452  ATP dependent DNA ligase  33.9 
 
 
534 aa  243  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1729  DNA ligase D  33 
 
 
813 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256122  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0568  DNA ligase D  33.92 
 
 
818 aa  240  8e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000109107  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34930  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  45.45 
 
 
303 aa  238  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564701  normal  0.292075 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3967  DNA primase, small subunit  45.76 
 
 
302 aa  237  5.0000000000000005e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.641256  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2802  DNA polymerase LigD, polymerase domain-containing protein  46.32 
 
 
302 aa  237  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918963  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4351  DNA polymerase LigD polymerase subunit  44.07 
 
 
303 aa  233  9e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4424  ATP-dependent DNA ligase  34.41 
 
 
825 aa  233  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0379748  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1207  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  43.45 
 
 
302 aa  228  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.560779  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3260  ATP-dependent DNA ligase  33.65 
 
 
833 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2635  ATP-dependent DNA ligase  34.36 
 
 
833 aa  226  9e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232561  normal  0.576376 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3330  DNA ligase D  34.7 
 
 
896 aa  226  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.580871  normal  0.138663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2651  ATP-dependent DNA ligase  34.29 
 
 
832 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.819142  normal  0.570676 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2815  DNA polymerase LigD, polymerase domain-containing protein  42.86 
 
 
305 aa  223  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2991  DNA polymerase LigD polymerase domain-containing subunit  45 
 
 
293 aa  220  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2501  ATP-dependent DNA ligase  32.45 
 
 
833 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1337  ATP dependent DNA ligase  35.15 
 
 
868 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.402102 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1218  ATP dependent DNA ligase  35.02 
 
 
846 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.257773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2679  ATP-dependent DNA ligase  34.76 
 
 
868 aa  214  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4308  DNA polymerase LigD polymerase subunit  40.14 
 
 
306 aa  212  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5705  ATP-dependent DNA ligase  31.24 
 
 
883 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5249  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  43.86 
 
 
292 aa  207  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398866  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2863  DNA primase-like  39.81 
 
 
352 aa  207  8e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.355668  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4303  DNA ligase D  31.56 
 
 
817 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  32.65 
 
 
825 aa  190  7e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20210  DNA polymerase LigD-like ligase domain-containing protein  38.73 
 
 
376 aa  188  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0459497  normal  0.30843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0779  ATP dependent DNA ligase  37.69 
 
 
608 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.991922  normal  0.120219 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3453  DNA primase, small subunit  39.86 
 
 
301 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2121  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  42.66 
 
 
306 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  40.07 
 
 
656 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3982  DNA ligase D  29.53 
 
 
837 aa  184  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.242041 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2837  ATP-dependent DNA ligase  35.94 
 
 
896 aa  181  4.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1208  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  42.09 
 
 
316 aa  181  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.433755  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1020  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  41.55 
 
 
313 aa  179  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00719502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0962  hypothetical protein  41.9 
 
 
313 aa  178  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.612546  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1007  DNA polymerase LigD polymerase subunit  41.34 
 
 
305 aa  177  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.104732  hitchhiker  0.00609843 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1023  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  41.9 
 
 
313 aa  177  7e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  35.42 
 
 
902 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0832  DNA ligase D  39.24 
 
 
684 aa  173  9e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4352  DNA polymerase LigD ligase region  40.32 
 
 
313 aa  172  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6329  ATP-dependent DNA ligase  35.56 
 
 
895 aa  171  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0632091 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4315  DNA ligase D  37.05 
 
 
834 aa  170  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1235  ATP dependent DNA ligase  36.91 
 
 
311 aa  169  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.898519  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2002  ATP dependent DNA ligase  35.16 
 
 
316 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0784  ATP dependent DNA ligase  38.19 
 
 
658 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1903  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  40.32 
 
 
311 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0382  DNA ligase D  36.48 
 
 
644 aa  168  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4309  DNA polymerase LigD ligase subunit  35.47 
 
 
603 aa  167  5.9999999999999996e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3968  ATP dependent DNA ligase  40.97 
 
 
312 aa  167  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.697199  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3003  ATP-dependent DNA ligase  36.89 
 
 
882 aa  167  9e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0636525  normal  0.554248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7782  putative ATP-dependent DNA ligase  36.54 
 
 
351 aa  167  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.089551  normal  0.119022 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2067  hypothetical protein  33.69 
 
 
312 aa  166  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0552463 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5528  DNA ligase (ATP)  38.76 
 
 
329 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.418116  normal  0.413759 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5930  DNA ligase (ATP)  38.76 
 
 
329 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.030161  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2523  ATP-dependent DNA ligase  38.41 
 
 
837 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000543878 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2631  DNA ligase D  36.43 
 
 
865 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0836  DNA ligase D  39.24 
 
 
683 aa  164  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1124  hypothetical protein  33.09 
 
 
303 aa  162  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2239  DNA ligase D  37.41 
 
 
856 aa  160  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.839838 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0932  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  32.03 
 
 
737 aa  160  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.819515  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0935  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  32.52 
 
 
789 aa  160  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0727399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>