More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1335 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1335  ATP-dependent DNA ligase  100 
 
 		 980 aa  1935    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5610  ATP dependent DNA ligase  55.4 
 
 		 932 aa  815    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0981  DNA ligase D  52.96 
 
 		 954 aa  796    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3112  DNA ligase D  96.35 
 
 		 1157 aa  1704    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0919454  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2988  DNA ligase, ATP-dependent  96.17 
 
 		 1163 aa  1704    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2328  putative ATP-dependent DNA ligase  58.99 
 
 		 1001 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455665  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1346  ATP dependent DNA ligase  74.24 
 
 		 936 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.893044  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6483  ATP dependent DNA ligase  74.24 
 
 		 936 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6073  DNA ligase D  74.58 
 
 		 927 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5476  DNA ligase D  66.18 
 
 		 927 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388357 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1858  DNA ligase D  73.72 
 
 		 940 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.170046  normal  0.216644 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6340  DNA ligase D  72.79 
 
 		 949 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.15116 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3217  ATP-dependent DNA ligase  62.38 
 
 		 837 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.311781 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3464  DNA ligase, ATP-dependent, putative  60 
 
 		 851 aa  366  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0501  DNA ligase D  61.2 
 
 		 863 aa  360  6e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535245  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0488  DNA ligase D  60.87 
 
 		 867 aa  360  8e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160576  normal  0.373477 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3245  ATP-dependent DNA ligase  59.32 
 
 		 866 aa  360  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.833216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36910  ATP-dependent DNA ligase  59.66 
 
 		 840 aa  353  8e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0564843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3173  ATP-dependent DNA ligase  59.66 
 
 		 847 aa  352  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4772  DNA ligase D  53.58 
 
 		 651 aa  332  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2501  ATP-dependent DNA ligase  56.45 
 
 		 833 aa  330  6e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1177  ATP-dependent DNA ligase  54.55 
 
 		 853 aa  330  7e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3260  ATP-dependent DNA ligase  56.1 
 
 		 833 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5079  ATP-dependent DNA ligase  56.61 
 
 		 901 aa  328  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.795218  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2097  ATP-dependent DNA ligase  53.66 
 
 		 848 aa  327  6e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0498  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  57.39 
 
 		 298 aa  326  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3003  ATP-dependent DNA ligase  55.22 
 
 		 882 aa  325  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0636525  normal  0.554248 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7582  DNA ligase D  52.56 
 
 		 651 aa  325  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1660  ATP-dependent DNA ligase  55.4 
 
 		 847 aa  323  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.600549  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2247  ATP-dependent DNA ligase  55.75 
 
 		 846 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2523  ATP-dependent DNA ligase  56.99 
 
 		 837 aa  317  6e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000543878 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2635  ATP-dependent DNA ligase  54.01 
 
 		 833 aa  317  9e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232561  normal  0.576376 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4424  ATP-dependent DNA ligase  53.5 
 
 		 825 aa  314  5.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0379748  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4339  ATP-dependent DNA ligase  55.27 
 
 		 871 aa  311  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0275716 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2651  ATP-dependent DNA ligase  52.61 
 
 		 832 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.819142  normal  0.570676 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0011  ATP-dependent DNA ligase  51.37 
 
 		 864 aa  310  6.999999999999999e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0339968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2519  ATP-dependent DNA ligase  53.68 
 
 		 939 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6253  DNA polymerase LigD ligase subunit  39.22 
 
 		 343 aa  251  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0234052  normal  0.998306 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2679  ATP-dependent DNA ligase  43.65 
 
 		 868 aa  244  7e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4315  DNA ligase D  43.36 
 
 		 834 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1337  ATP dependent DNA ligase  43.65 
 
 		 868 aa  242  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402102 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1150  ATP dependent DNA ligase  44.67 
 
 		 845 aa  240  9e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2135  DNA ligase D  39.45 
 
 		 815 aa  239  3e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2977  DNA ligase D  40.24 
 
 		 845 aa  238  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246159 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1218  ATP dependent DNA ligase  46.27 
 
 		 846 aa  235  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.257773 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  43.16 
 
 		 825 aa  234  6e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2631  DNA ligase D  44.26 
 
 		 865 aa  233  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6876  ATP dependent DNA ligase  38.85 
 
 		 343 aa  233  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747253  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3982  DNA ligase D  45.39 
 
 		 837 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.242041 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5875  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  44.37 
 
 		 297 aa  227  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0382  DNA ligase D  43.33 
 
 		 644 aa  224  7e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  43.77 
 
 		 656 aa  223  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5638  ATP-dependent DNA ligase  40.97 
 
 		 882 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8275  ATP-dependent DNA ligase  36.22 
 
 		 383 aa  222  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0118926  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2239  DNA ligase D  39.79 
 
 		 856 aa  221  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.839838 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8017  ATP-dependent DNA ligase  36.22 
 
 		 893 aa  221  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6783  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  43.91 
 
 		 292 aa  220  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3685  ATP-dependent DNA ligase  41.18 
 
 		 911 aa  219  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.865038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4365  ATP-dependent DNA ligase  41.69 
 
 		 886 aa  219  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1876  ATP-dependent DNA ligase  33.51 
 
 		 914 aa  218  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.907588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1301  hypothetical protein  40.47 
 
 		 301 aa  217  9e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5341  ATP-dependent DNA ligase  38.83 
 
 		 881 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0581605 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0836  DNA ligase D  42.91 
 
 		 683 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0784  ATP dependent DNA ligase  43.21 
 
 		 658 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5705  ATP-dependent DNA ligase  36.24 
 
 		 883 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0448  ATP-dependent DNA ligase  39.86 
 
 		 866 aa  214  5.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1729  DNA ligase D  38.54 
 
 		 813 aa  214  9e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256122  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6329  ATP-dependent DNA ligase  39.55 
 
 		 895 aa  214  9e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0632091 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3490  ATP-dependent DNA ligase  40.68 
 
 		 930 aa  213  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5282  DNA ligase D  42.22 
 
 		 658 aa  213  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.889453 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0832  DNA ligase D  42.2 
 
 		 684 aa  211  6e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1736  ATP-dependent DNA ligase  41.18 
 
 		 888 aa  211  6e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.946456 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4171  ATP-dependent DNA ligase  41.85 
 
 		 914 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.497319  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1951  DNA ligase D  37 
 
 		 822 aa  207  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00524792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0353  ATP-dependent DNA ligase  38.07 
 
 		 913 aa  206  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.344654 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1695  ATP dependent DNA ligase  43.63 
 
 		 843 aa  206  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616199  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7647  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  39.85 
 
 		 544 aa  205  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1769  ATP-dependent DNA ligase  39.73 
 
 		 918 aa  201  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3907  ATP-dependent DNA ligase  40.34 
 
 		 900 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.989644  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2226  DNA polymerase LigD polymerase subunit  40.68 
 
 		 299 aa  196  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0568  DNA ligase D  37.28 
 
 		 818 aa  196  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000109107  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4186  hypothetical protein  40.54 
 
 		 330 aa  192  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0264097  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  35.02 
 
 		 902 aa  188  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  33.21 
 
 		 855 aa  185  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7782  putative ATP-dependent DNA ligase  33.59 
 
 		 351 aa  183  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.089551  normal  0.119022 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  32.33 
 
 		 861 aa  179  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2837  ATP-dependent DNA ligase  35.71 
 
 		 896 aa  179  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4303  DNA ligase D  40.51 
 
 		 817 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3085  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  32.95 
 
 		 299 aa  167  5.9999999999999996e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6404  DNA ligase D  32.74 
 
 		 646 aa  167  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0822092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  34.05 
 
 		 877 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4309  DNA polymerase LigD ligase subunit  46.64 
 
 		 603 aa  165  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0779  ATP dependent DNA ligase  40 
 
 		 608 aa  165  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.991922  normal  0.120219 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  35.47 
 
 		 847 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1124  hypothetical protein  35.23 
 
 		 303 aa  164  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03410  DNA polymerase LigD polymerase domain protein  31.71 
 
 		 313 aa  163  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6989  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  38.66 
 
 		 354 aa  159  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2815  DNA polymerase LigD, polymerase domain-containing protein  38.65 
 
 		 305 aa  159  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5730  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  43.3 
 
 		 350 aa  158  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3248  DNA polymerase LigD polymerase subunit  37.45 
 
 		 328 aa  158  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>