More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6073 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1660  ATP-dependent DNA ligase  47.95 
 
 		 847 aa  771    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.600549  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3260  ATP-dependent DNA ligase  48.38 
 
 		 833 aa  808    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3464  DNA ligase, ATP-dependent, putative  50 
 
 		 851 aa  823    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3245  ATP-dependent DNA ligase  49.51 
 
 		 866 aa  812    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.833216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4424  ATP-dependent DNA ligase  46.44 
 
 		 825 aa  714    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0379748  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5079  ATP-dependent DNA ligase  50.97 
 
 		 901 aa  813    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.795218  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2651  ATP-dependent DNA ligase  48.65 
 
 		 832 aa  798    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.819142  normal  0.570676 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2247  ATP-dependent DNA ligase  47.89 
 
 		 846 aa  758    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2097  ATP-dependent DNA ligase  49.46 
 
 		 848 aa  821    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1177  ATP-dependent DNA ligase  47.23 
 
 		 853 aa  795    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3003  ATP-dependent DNA ligase  49.03 
 
 		 882 aa  780    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0636525  normal  0.554248 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2328  putative ATP-dependent DNA ligase  54.55 
 
 		 1001 aa  1021    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455665  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0488  DNA ligase D  53.67 
 
 		 867 aa  886    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160576  normal  0.373477 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1346  ATP dependent DNA ligase  95.72 
 
 		 936 aa  1724    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.893044  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2635  ATP-dependent DNA ligase  48.27 
 
 		 833 aa  787    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232561  normal  0.576376 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5610  ATP dependent DNA ligase  83.56 
 
 		 932 aa  1532    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36910  ATP-dependent DNA ligase  50.65 
 
 		 840 aa  809    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0564843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6483  ATP dependent DNA ligase  95.61 
 
 		 936 aa  1723    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3217  ATP-dependent DNA ligase  52.43 
 
 		 837 aa  865    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.311781 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3173  ATP-dependent DNA ligase  50.33 
 
 		 847 aa  811    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0501  DNA ligase D  54.03 
 
 		 863 aa  887    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535245  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1858  DNA ligase D  57.59 
 
 		 940 aa  1046    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.170046  normal  0.216644 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6340  DNA ligase D  82.08 
 
 		 949 aa  1509    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.15116 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2501  ATP-dependent DNA ligase  48.28 
 
 		 833 aa  811    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2519  ATP-dependent DNA ligase  47.32 
 
 		 939 aa  709    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2523  ATP-dependent DNA ligase  51.04 
 
 		 837 aa  800    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000543878 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0011  ATP-dependent DNA ligase  44.86 
 
 		 864 aa  743    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0339968 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0981  DNA ligase D  58.65 
 
 		 954 aa  1054    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4339  ATP-dependent DNA ligase  47.35 
 
 		 871 aa  758    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0275716 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5476  DNA ligase D  79.08 
 
 		 927 aa  1460    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388357 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6073  DNA ligase D  100 
 
 		 927 aa  1857    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2977  DNA ligase D  41.46 
 
 		 845 aa  634  1e-180  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246159 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2239  DNA ligase D  43.61 
 
 		 856 aa  624  1e-177  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.839838 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2135  DNA ligase D  37.95 
 
 		 815 aa  625  1e-177  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4315  DNA ligase D  40.37 
 
 		 834 aa  616  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2631  DNA ligase D  40.39 
 
 		 865 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7582  DNA ligase D  48.6 
 
 		 651 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1150  ATP dependent DNA ligase  41.3 
 
 		 845 aa  600  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5705  ATP-dependent DNA ligase  40.24 
 
 		 883 aa  590  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5638  ATP-dependent DNA ligase  40.55 
 
 		 882 aa  590  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4365  ATP-dependent DNA ligase  40.53 
 
 		 886 aa  588  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4772  DNA ligase D  49.05 
 
 		 651 aa  587  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5341  ATP-dependent DNA ligase  39.89 
 
 		 881 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0581605 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3685  ATP-dependent DNA ligase  39.36 
 
 		 911 aa  581  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.865038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6329  ATP-dependent DNA ligase  40.06 
 
 		 895 aa  580  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0632091 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8017  ATP-dependent DNA ligase  38.48 
 
 		 893 aa  580  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1769  ATP-dependent DNA ligase  39.39 
 
 		 918 aa  579  1.0000000000000001e-163  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1736  ATP-dependent DNA ligase  39.4 
 
 		 888 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.946456 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0353  ATP-dependent DNA ligase  39.67 
 
 		 913 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.344654 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3907  ATP-dependent DNA ligase  38.25 
 
 		 900 aa  560  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.989644  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3982  DNA ligase D  40 
 
 		 837 aa  553  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.242041 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1729  DNA ligase D  36.6 
 
 		 813 aa  555  1e-156  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256122  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0448  ATP-dependent DNA ligase  39.25 
 
 		 866 aa  546  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4171  ATP-dependent DNA ligase  39.85 
 
 		 914 aa  549  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.497319  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0568  DNA ligase D  36.72 
 
 		 818 aa  542  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000109107  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1337  ATP dependent DNA ligase  40.24 
 
 		 868 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402102 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2679  ATP-dependent DNA ligase  40 
 
 		 868 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1951  DNA ligase D  38.16 
 
 		 822 aa  538  1e-151  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00524792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  38.94 
 
 		 825 aa  538  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2837  ATP-dependent DNA ligase  35.41 
 
 		 896 aa  512  1e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1695  ATP dependent DNA ligase  38.28 
 
 		 843 aa  505  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616199  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  33.65 
 
 		 902 aa  503  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1218  ATP dependent DNA ligase  38.49 
 
 		 846 aa  499  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.257773 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  38.24 
 
 		 847 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  36.53 
 
 		 871 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  34.69 
 
 		 861 aa  486  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  34.2 
 
 		 877 aa  483  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4303  DNA ligase D  37.34 
 
 		 817 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  32.79 
 
 		 855 aa  479  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1335  ATP-dependent DNA ligase  71.66 
 
 		 980 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3112  DNA ligase D  71.66 
 
 		 1157 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0919454  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2988  DNA ligase, ATP-dependent  71.34 
 
 		 1163 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0109  DNA ligase D  35.96 
 
 		 872 aa  465  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0363186 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0382  DNA ligase D  41.43 
 
 		 644 aa  466  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0784  ATP dependent DNA ligase  43.14 
 
 		 658 aa  445  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3330  DNA ligase D  36.82 
 
 		 896 aa  445  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.580871  normal  0.138663 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0832  DNA ligase D  41.45 
 
 		 684 aa  435  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0836  DNA ligase D  41.89 
 
 		 683 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  40.33 
 
 		 656 aa  422  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5282  DNA ligase D  39.55 
 
 		 658 aa  419  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.889453 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4309  DNA polymerase LigD ligase subunit  41.71 
 
 		 603 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3452  ATP dependent DNA ligase  38.55 
 
 		 534 aa  336  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0779  ATP dependent DNA ligase  36.41 
 
 		 608 aa  334  5e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.991922  normal  0.120219 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6404  DNA ligase D  33.07 
 
 		 646 aa  327  7e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0822092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0498  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  57.39 
 
 		 298 aa  322  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4716  DNA ligase D  33.86 
 
 		 815 aa  280  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0653  ATP-dependent DNA ligase  37.43 
 
 		 816 aa  261  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6253  DNA polymerase LigD ligase subunit  44.85 
 
 		 343 aa  261  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0234052  normal  0.998306 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6876  ATP dependent DNA ligase  45.85 
 
 		 343 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747253  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  34.79 
 
 		 797 aa  236  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3242  DNA ligase D  30.35 
 
 		 657 aa  235  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.99209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0294  ATP-dependent DNA ligase  34.52 
 
 		 845 aa  228  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8275  ATP-dependent DNA ligase  37.93 
 
 		 383 aa  227  6e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0118926  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  32.37 
 
 		 831 aa  225  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2233  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  36.16 
 
 		 858 aa  221  6e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6783  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  43.12 
 
 		 292 aa  219  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0520  ATP-dependent DNA ligase  34.09 
 
 		 828 aa  218  4e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5875  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  41.61 
 
 		 297 aa  213  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0935  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  37.44 
 
 		 789 aa  213  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0727399  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19790  ATP-dependent DNA ligase  35.3 
 
 		 878 aa  213  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.0111766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>