More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1150 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6329  ATP-dependent DNA ligase  45.11 
 
 		 895 aa  672    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0632091 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3260  ATP-dependent DNA ligase  41.77 
 
 		 833 aa  636    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3464  DNA ligase, ATP-dependent, putative  43.38 
 
 		 851 aa  669    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3245  ATP-dependent DNA ligase  42.77 
 
 		 866 aa  666    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.833216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2501  ATP-dependent DNA ligase  42.26 
 
 		 833 aa  642    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2247  ATP-dependent DNA ligase  45.1 
 
 		 846 aa  649    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0353  ATP-dependent DNA ligase  42.84 
 
 		 913 aa  642    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.344654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1769  ATP-dependent DNA ligase  42.35 
 
 		 918 aa  646    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2097  ATP-dependent DNA ligase  44.31 
 
 		 848 aa  662    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1177  ATP-dependent DNA ligase  43.26 
 
 		 853 aa  663    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0488  DNA ligase D  44.66 
 
 		 867 aa  669    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160576  normal  0.373477 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1876  ATP-dependent DNA ligase  43.08 
 
 		 914 aa  650    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.907588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1695  ATP dependent DNA ligase  43.58 
 
 		 843 aa  656    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616199  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3685  ATP-dependent DNA ligase  43.03 
 
 		 911 aa  658    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.865038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3490  ATP-dependent DNA ligase  43.38 
 
 		 930 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3907  ATP-dependent DNA ligase  44.7 
 
 		 900 aa  687    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.989644  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0382  DNA ligase D  61.87 
 
 		 644 aa  758    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2635  ATP-dependent DNA ligase  42.61 
 
 		 833 aa  642    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232561  normal  0.576376 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1150  ATP dependent DNA ligase  100 
 
 		 845 aa  1709    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2239  DNA ligase D  57.71 
 
 		 856 aa  974    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.839838 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36910  ATP-dependent DNA ligase  44.2 
 
 		 840 aa  640    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0564843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5638  ATP-dependent DNA ligase  43.89 
 
 		 882 aa  667    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0981  DNA ligase D  41.7 
 
 		 954 aa  657    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4315  DNA ligase D  60.93 
 
 		 834 aa  1025    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8017  ATP-dependent DNA ligase  44.37 
 
 		 893 aa  678    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5341  ATP-dependent DNA ligase  44.73 
 
 		 881 aa  676    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0581605 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4365  ATP-dependent DNA ligase  45.71 
 
 		 886 aa  687    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1858  DNA ligase D  42.02 
 
 		 940 aa  648    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.170046  normal  0.216644 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0501  DNA ligase D  43.66 
 
 		 863 aa  657    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535245  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2651  ATP-dependent DNA ligase  42.76 
 
 		 832 aa  644    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.819142  normal  0.570676 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4171  ATP-dependent DNA ligase  43.43 
 
 		 914 aa  640    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.497319  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2977  DNA ligase D  45.65 
 
 		 845 aa  694    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246159 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3982  DNA ligase D  43.96 
 
 		 837 aa  636    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.242041 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5705  ATP-dependent DNA ligase  45.26 
 
 		 883 aa  680    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2135  DNA ligase D  43.25 
 
 		 815 aa  688    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3217  ATP-dependent DNA ligase  42.81 
 
 		 837 aa  649    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.311781 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3173  ATP-dependent DNA ligase  44.2 
 
 		 847 aa  640    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2631  DNA ligase D  47 
 
 		 865 aa  711    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3003  ATP-dependent DNA ligase  42.59 
 
 		 882 aa  632  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0636525  normal  0.554248 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5079  ATP-dependent DNA ligase  42.7 
 
 		 901 aa  630  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.795218  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5476  DNA ligase D  41.59 
 
 		 927 aa  629  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388357 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1951  DNA ligase D  42 
 
 		 822 aa  626  1e-178  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00524792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4424  ATP-dependent DNA ligase  42.47 
 
 		 825 aa  625  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0379748  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1736  ATP-dependent DNA ligase  43.02 
 
 		 888 aa  623  1e-177  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.946456 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2679  ATP-dependent DNA ligase  42.91 
 
 		 868 aa  620  1e-176  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1729  DNA ligase D  39.93 
 
 		 813 aa  619  1e-176  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256122  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4339  ATP-dependent DNA ligase  41.19 
 
 		 871 aa  619  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0275716 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0568  DNA ligase D  41.57 
 
 		 818 aa  617  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000109107  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0448  ATP-dependent DNA ligase  43.25 
 
 		 866 aa  617  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2523  ATP-dependent DNA ligase  43.28 
 
 		 837 aa  618  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000543878 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1337  ATP dependent DNA ligase  42.91 
 
 		 868 aa  618  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402102 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0011  ATP-dependent DNA ligase  39.26 
 
 		 864 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0339968 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1660  ATP-dependent DNA ligase  41.57 
 
 		 847 aa  611  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.600549  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1218  ATP dependent DNA ligase  43.82 
 
 		 846 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.257773 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6073  DNA ligase D  40.97 
 
 		 927 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1346  ATP dependent DNA ligase  40.81 
 
 		 936 aa  601  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.893044  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6483  ATP dependent DNA ligase  40.81 
 
 		 936 aa  601  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  42.87 
 
 		 825 aa  602  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5610  ATP dependent DNA ligase  40.74 
 
 		 932 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2519  ATP-dependent DNA ligase  39.76 
 
 		 939 aa  568  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4303  DNA ligase D  41.16 
 
 		 817 aa  557  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2837  ATP-dependent DNA ligase  36.07 
 
 		 896 aa  520  1e-146  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  38.18 
 
 		 871 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  35.95 
 
 		 902 aa  502  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0109  DNA ligase D  37.99 
 
 		 872 aa  500  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0363186 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  36.05 
 
 		 877 aa  493  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  37.66 
 
 		 847 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  34.44 
 
 		 855 aa  485  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  34.56 
 
 		 861 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0832  DNA ligase D  43.06 
 
 		 684 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  43.83 
 
 		 656 aa  479  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0784  ATP dependent DNA ligase  43.2 
 
 		 658 aa  475  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0836  DNA ligase D  41.7 
 
 		 683 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5282  DNA ligase D  44.97 
 
 		 658 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.889453 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7582  DNA ligase D  41.2 
 
 		 651 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2328  putative ATP-dependent DNA ligase  43.23 
 
 		 1001 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455665  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4772  DNA ligase D  39.94 
 
 		 651 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3330  DNA ligase D  33.55 
 
 		 896 aa  420  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.580871  normal  0.138663 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6340  DNA ligase D  43.49 
 
 		 949 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.15116 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4309  DNA polymerase LigD ligase subunit  39.67 
 
 		 603 aa  373  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0779  ATP dependent DNA ligase  38.69 
 
 		 608 aa  359  9.999999999999999e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.991922  normal  0.120219 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3452  ATP dependent DNA ligase  40.04 
 
 		 534 aa  347  6e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6783  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  57.93 
 
 		 292 aa  342  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5875  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  58.02 
 
 		 297 aa  338  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6404  DNA ligase D  31.85 
 
 		 646 aa  323  7e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0822092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3242  DNA ligase D  31.85 
 
 		 657 aa  265  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.99209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4716  DNA ligase D  34.62 
 
 		 815 aa  258  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  34.71 
 
 		 831 aa  250  6e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1301  hypothetical protein  45.91 
 
 		 301 aa  250  8e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3103  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  45.36 
 
 		 336 aa  243  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2316  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  48.03 
 
 		 313 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2161  ATP dependent DNA ligase  48.03 
 
 		 313 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379865  normal  0.199532 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1335  ATP-dependent DNA ligase  44.67 
 
 		 980 aa  239  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3112  DNA ligase D  44.98 
 
 		 1157 aa  239  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0919454  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3852  ATP dependent DNA ligase  45.42 
 
 		 315 aa  238  3e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8275  ATP-dependent DNA ligase  38.8 
 
 		 383 aa  238  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0118926  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2988  DNA ligase, ATP-dependent  44.33 
 
 		 1163 aa  236  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1305  DNA polymerase LigD ligase region  44.01 
 
 		 343 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0414241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0498  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  46.64 
 
 		 298 aa  233  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6253  DNA polymerase LigD ligase subunit  41.88 
 
 		 343 aa  231  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0234052  normal  0.998306 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>