More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2051 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2051  SMC domain protein  100 
 
 
1080 aa  2067    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.380302  normal  0.930097 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1551  SMC domain-containing protein  54.42 
 
 
1074 aa  962    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00625316 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  27.16 
 
 
1189 aa  327  6e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  25.8 
 
 
1189 aa  327  1e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  28.25 
 
 
1189 aa  326  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  27.33 
 
 
1189 aa  323  7e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  26.57 
 
 
1185 aa  322  3e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  26.06 
 
 
1188 aa  320  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  26.06 
 
 
1188 aa  320  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  27.63 
 
 
1189 aa  319  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  27.55 
 
 
1189 aa  318  3e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  27.55 
 
 
1189 aa  318  3e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  27.55 
 
 
1189 aa  317  6e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  27.18 
 
 
1170 aa  310  1.0000000000000001e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  25.59 
 
 
1191 aa  308  3e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  26.75 
 
 
1170 aa  305  3.0000000000000004e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  25.81 
 
 
1190 aa  298  5e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  25.04 
 
 
1190 aa  283  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  24.8 
 
 
1164 aa  282  2e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  28.43 
 
 
1198 aa  281  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  25.83 
 
 
1174 aa  271  4e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  25.04 
 
 
1177 aa  266  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  26.84 
 
 
1184 aa  263  1e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  26.09 
 
 
1177 aa  256  1.0000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0495  structural maintenance of chromosomes (SMC) superfamily protein  22.92 
 
 
988 aa  250  1e-64  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.210313  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  22.44 
 
 
1172 aa  247  8e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  29.9 
 
 
1134 aa  243  1e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf735  chromosome segregation ATPase Smc  25.2 
 
 
978 aa  238  5.0000000000000005e-61  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  27.29 
 
 
1185 aa  237  9e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  26.65 
 
 
1177 aa  233  2e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  29.99 
 
 
1186 aa  231  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  24.3 
 
 
1185 aa  227  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  28.49 
 
 
1187 aa  224  7e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  27.35 
 
 
1167 aa  219  2e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  28.71 
 
 
1189 aa  219  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  27.27 
 
 
1167 aa  218  4e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  26 
 
 
1179 aa  218  5.9999999999999996e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  31.19 
 
 
1187 aa  217  9e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  28.29 
 
 
1189 aa  216  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  28.29 
 
 
1189 aa  216  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  28.35 
 
 
1189 aa  213  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  27.73 
 
 
1167 aa  211  4e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  25.8 
 
 
1174 aa  209  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  24.27 
 
 
1175 aa  209  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  27.45 
 
 
1403 aa  206  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  27.19 
 
 
1146 aa  206  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  28.32 
 
 
1191 aa  199  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  31.51 
 
 
1198 aa  199  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  26.13 
 
 
1146 aa  194  8e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  27.66 
 
 
1187 aa  193  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  24.74 
 
 
1226 aa  191  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  24.63 
 
 
1185 aa  188  6e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  25.79 
 
 
1217 aa  187  7e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  24.53 
 
 
1185 aa  187  8e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  24.42 
 
 
1226 aa  184  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  32.35 
 
 
1185 aa  184  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  32.91 
 
 
1187 aa  183  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  25.93 
 
 
1208 aa  180  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  28.42 
 
 
1181 aa  179  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  27.95 
 
 
1179 aa  176  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl232  structural maintenance of chromosomes smc superfamily protein  26.98 
 
 
995 aa  174  5.999999999999999e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  25.69 
 
 
1207 aa  174  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0822  SMC protein-like protein  44.72 
 
 
1100 aa  172  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.866363  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  27.26 
 
 
1185 aa  172  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  26.1 
 
 
1204 aa  167  8e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  22.94 
 
 
1174 aa  164  8.000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  24.34 
 
 
1201 aa  162  3e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0855  chromosome segregation protein SMC  30.65 
 
 
1200 aa  159  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00379552  normal  0.0307887 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  25.08 
 
 
1082 aa  158  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  38.99 
 
 
1199 aa  157  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  38.99 
 
 
1199 aa  157  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  28.07 
 
 
1190 aa  156  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  23.64 
 
 
1172 aa  155  4e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  37.91 
 
 
1199 aa  154  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  24.38 
 
 
1183 aa  153  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  35.15 
 
 
1204 aa  148  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  22.98 
 
 
1180 aa  147  1e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  41.32 
 
 
1186 aa  145  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  35.2 
 
 
1176 aa  145  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  23.11 
 
 
1153 aa  144  6e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  38.39 
 
 
1177 aa  144  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  25.4 
 
 
1189 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  30.05 
 
 
1194 aa  144  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  28.4 
 
 
1194 aa  142  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  34.71 
 
 
1194 aa  142  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  34.52 
 
 
1255 aa  141  6e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  34.75 
 
 
1199 aa  140  8.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  33.71 
 
 
1173 aa  140  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  33.56 
 
 
1174 aa  140  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  33.56 
 
 
1174 aa  139  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  27.63 
 
 
1193 aa  137  7.000000000000001e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  32.73 
 
 
1165 aa  138  7.000000000000001e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0156  p115 protein  24.11 
 
 
981 aa  137  8e-31  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  28.59 
 
 
1191 aa  137  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  25.41 
 
 
1186 aa  137  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  32.74 
 
 
1184 aa  137  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  27.16 
 
 
1171 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  35.11 
 
 
1227 aa  136  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  30.5 
 
 
1142 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  33.11 
 
 
1175 aa  135  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>