More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1337 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 
334 aa  675    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  71.94 
 
 
335 aa  498  1e-140  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.35 
 
 
333 aa  429  1e-119  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.84 
 
 
331 aa  334  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  51.5 
 
 
330 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  51.2 
 
 
330 aa  325  5e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1775  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  48.24 
 
 
339 aa  319  3e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  48.53 
 
 
339 aa  318  7.999999999999999e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0813409 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  49.7 
 
 
330 aa  318  1e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  49.55 
 
 
331 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3471  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.57 
 
 
360 aa  313  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1057  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.71 
 
 
362 aa  312  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0688  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  47.65 
 
 
339 aa  312  4.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.705253  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  52.42 
 
 
335 aa  312  5.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  49.85 
 
 
330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  47.92 
 
 
337 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.07 
 
 
326 aa  302  5.000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3600  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.64 
 
 
332 aa  300  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.177438 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  49.4 
 
 
348 aa  292  6e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  48.35 
 
 
336 aa  290  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05206  LysBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6DTN1]  47.13 
 
 
360 aa  290  3e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  48.65 
 
 
335 aa  290  3e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  47.75 
 
 
335 aa  289  5.0000000000000004e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  47.75 
 
 
335 aa  288  7e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  48.35 
 
 
334 aa  288  9e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  48.8 
 
 
334 aa  280  3e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  45.73 
 
 
336 aa  280  4e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  45.73 
 
 
336 aa  280  4e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  45.73 
 
 
336 aa  279  6e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  45.73 
 
 
336 aa  278  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0248  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.83 
 
 
338 aa  278  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  46.87 
 
 
340 aa  277  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  47.71 
 
 
336 aa  276  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  45.73 
 
 
336 aa  277  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  45.73 
 
 
335 aa  276  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  45.65 
 
 
333 aa  276  3e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  45.73 
 
 
335 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  45.73 
 
 
335 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  45.73 
 
 
335 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  45.73 
 
 
335 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  45.43 
 
 
335 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  45.73 
 
 
336 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1484  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  44.54 
 
 
343 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50442  homo- isocitrate dehydrogenase  45.69 
 
 
377 aa  273  4.0000000000000004e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0465536 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  45.9 
 
 
335 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03850  isocitrate dehydrogenase, putative  44.1 
 
 
370 aa  272  7e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  45.43 
 
 
335 aa  271  9e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  45.12 
 
 
336 aa  270  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  45.43 
 
 
335 aa  270  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  42.32 
 
 
337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1172  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  46.33 
 
 
335 aa  270  4e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  45.59 
 
 
335 aa  269  4e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  45.05 
 
 
334 aa  269  5e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  46.04 
 
 
331 aa  269  5.9999999999999995e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0855  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenases  46.46 
 
 
323 aa  268  1e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  45.76 
 
 
336 aa  268  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  44.51 
 
 
335 aa  264  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  46.06 
 
 
348 aa  261  8e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0166  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.44 
 
 
370 aa  261  1e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.294157  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  42.46 
 
 
361 aa  259  4e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0637  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.31 
 
 
322 aa  258  1e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253022  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2659  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  49.7 
 
 
326 aa  258  1e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122672  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2762  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.56 
 
 
326 aa  257  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.95 
 
 
331 aa  255  6e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0602  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.95 
 
 
325 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.785398 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1815  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.01 
 
 
325 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000286516 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  45.43 
 
 
336 aa  253  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0664  isocitrate dehydrogenase  46.2 
 
 
335 aa  253  3e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.430122 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2146  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.12 
 
 
321 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1605  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.01 
 
 
325 aa  251  1e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2064  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.92 
 
 
325 aa  250  2e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.189691 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01003  hypothetical protein similar to isocitrate dehydrogenase (Broad)  42.57 
 
 
385 aa  248  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0870  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  47.9 
 
 
332 aa  248  1e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1434  isocitrate dehydrogenase  46.57 
 
 
338 aa  246  4e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0214  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  44.91 
 
 
342 aa  245  6.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.6389  normal  0.0659244 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0235  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.64 
 
 
336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02380  isocitrate dehydrogenase (NADP)  43.92 
 
 
364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.713853  normal  0.672997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2804  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.11 
 
 
359 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0833  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.51 
 
 
325 aa  242  6e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1797  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.55 
 
 
329 aa  242  6e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3616  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.94 
 
 
360 aa  242  6e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.79276  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0898  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.27 
 
 
327 aa  239  5e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0288  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.29 
 
 
356 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.13 
 
 
358 aa  237  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0450  isocitrate dehydrogenase, putative  38.55 
 
 
359 aa  236  4e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1183  tartrate dehydrogenase  42.4 
 
 
349 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04610  isocitrate dehydrogenase, putative  42.73 
 
 
379 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.673993  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6098  tartrate dehydrogenase  40.67 
 
 
360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609209  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  40.95 
 
 
360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2488  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.22 
 
 
377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4079  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  44.91 
 
 
343 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1270  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.69 
 
 
353 aa  233  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_392  isocitrate dehydrogenase  37.99 
 
 
359 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.952399  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0427  isocitrate dehydrogenase (NADP)  37.99 
 
 
359 aa  230  3e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42313  mitochondrial isocitrate dehydrogenase (NAD+) subunit 2  40.95 
 
 
367 aa  229  4e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00286555  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1031  Tartrate decarboxylase  39.76 
 
 
370 aa  229  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2611  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.79 
 
 
360 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0404939  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0088  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.08 
 
 
336 aa  229  7e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00287551  hitchhiker  0.00000627763 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  40 
 
 
363 aa  228  8e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2334  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  42.78 
 
 
361 aa  228  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>