163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1161 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1161  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 174 aa  338  2e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.274053  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0923  2',5' RNA ligase  43.02 
 
 		 177 aa  111  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3512  2'-5' RNA ligase  40.51 
 
 		 176 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0807667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0158  2'-5' RNA ligase  41.51 
 
 		 176 aa  95.1  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0758236  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00146  2'-5' RNA ligase  40.51 
 
 		 176 aa  95.1  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00154345  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00145  hypothetical protein  40.51 
 
 		 176 aa  95.1  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2212  2'-5' RNA ligase  41.86 
 
 		 186 aa  94.7  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3455  2'-5' RNA ligase  40.51 
 
 		 176 aa  94.4  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00917798  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0138  2'-5' RNA ligase  40.51 
 
 		 176 aa  94.4  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0169609  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0150  2'-5' RNA ligase  40.51 
 
 		 176 aa  94.4  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345552  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0151  2'-5' RNA ligase  40.51 
 
 		 176 aa  94.4  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000646366  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0156  2'-5' RNA ligase  40.88 
 
 		 176 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.177994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1034  2'-5' RNA ligase  38.64 
 
 		 177 aa  92.8  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.427005  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0687  2'-5' RNA ligase  37.34 
 
 		 184 aa  92  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00185494  normal  0.60336 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2817  2'-5' RNA ligase  37.36 
 
 		 176 aa  91.3  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.433451  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3983  2'-5' RNA ligase  35.63 
 
 		 180 aa  90.9  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000701591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0220  2'-5' RNA ligase  39.87 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0222  2'-5' RNA ligase  39.87 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.367161  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0216  2'-5' RNA ligase  39.24 
 
 		 176 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0204  2'-5' RNA ligase  39.24 
 
 		 176 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0205  2'-5' RNA ligase  39.87 
 
 		 176 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1286  2'-5' RNA ligase  46.46 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.757621  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0847  2'-5' RNA ligase  40 
 
 		 173 aa  86.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0724174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2563  2'-5' RNA ligase  36.53 
 
 		 181 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043811  hitchhiker  0.0000000000000955583 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0512  2'-5' RNA ligase  42.69 
 
 		 182 aa  84.7  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504657 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2125  2',5' RNA ligase  33.72 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3112  2'-5' RNA ligase  34.88 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3336  2'-5' RNA ligase  36.84 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00058753  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3466  2'-5' RNA ligase  36.84 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0386  2'-5' RNA ligase, putative  40.25 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1002  2'-5' RNA ligase  36.26 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.018778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3240  2',5' RNA ligase  36.75 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1166  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.280308  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1975  2',5' RNA ligase  34.52 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  35.64 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27110  2'-5' RNA ligase  39.88 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1005  2',5' RNA ligase  35.71 
 
 		 183 aa  70.9  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0968272  normal  0.0378462 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23030  2-5 RNA ligase protein  34.12 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1636  2'-5' RNA ligase  28.27 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  35.96 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2137  2',5' RNA ligase  32.75 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3126  2'-5' RNA ligase  31.76 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  31.3 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2116  2',5' RNA ligase  37.32 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529013  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02479  3'-5' RNA ligase  30.59 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1939  2'-5' RNA ligase  27.43 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.33767  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2974  putative 2'-5' RNA ligase  30.77 
 
 		 175 aa  62  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  39.57 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00469  2,5 RNA ligase  32.37 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0487  2'-5' RNA ligase  28.4 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  36.36 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0580  2'-5' RNA ligase  29.61 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2842  2',5' RNA ligase  33.85 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  28.49 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  39.26 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  29.21 
 
 		 184 aa  57  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  35.26 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3075  2'-5' RNA ligase  34.11 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  22.65 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  23.76 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3745  2'-5' RNA ligase  27.93 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.877647  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  28.32 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  30.71 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  32.22 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2424  2'-5' RNA ligase  34.62 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  28.49 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  30.95 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  22.65 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  27.35 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1635  2'-5' RNA ligase  32.32 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.44124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3271  2'-5' RNA ligase  34.62 
 
 		 181 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  27.84 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3688  2'-5' RNA ligase  26.82 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1290  2'-5' RNA ligase  33.54 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  30.85 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  25 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1157  2'-5' RNA ligase  26.59 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1484  2'-5' RNA ligase  21.79 
 
 		 173 aa  52.4  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  29.71 
 
 		 194 aa  52  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  31.49 
 
 		 180 aa  52  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0746  2'-5' RNA ligase  29.52 
 
 		 170 aa  51.2  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.836735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5848  2'-5' RNA ligase  35.65 
 
 		 176 aa  51.2  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3871  2'-5' RNA ligase  26.82 
 
 		 181 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0606151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1946  2',5' RNA ligase  26.45 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  31.76 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19240  2'-5' RNA ligase  31.95 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0390929 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  35.34 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0703  2'-5' RNA ligase  26.32 
 
 		 173 aa  49.3  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2064  2'-5' RNA ligase  32.81 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6095  2',5' RNA ligase  29.94 
 
 		 207 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0652023  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5904  2'-5' RNA ligase  30.77 
 
 		 298 aa  48.5  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.230551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5914  2,5 RNA ligase  34.68 
 
 		 188 aa  48.5  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.720477 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1443  putative ligase protein  29.63 
 
 		 198 aa  48.1  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  29.35 
 
 		 185 aa  47.8  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  27.48 
 
 		 193 aa  47.8  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  20.11 
 
 		 189 aa  48.1  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2482  2'-5' RNA ligase  30 
 
 		 189 aa  47.8  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.097083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  22.29 
 
 		 171 aa  47.8  0.00009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4995  2'-5' RNA ligase  31.18 
 
 		 178 aa  47.8  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>