229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2139 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  100 
 
 		 190 aa  385  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  39.27 
 
 		 179 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  37.5 
 
 		 184 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  38.59 
 
 		 184 aa  109  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  34.92 
 
 		 184 aa  108  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  36.65 
 
 		 184 aa  106  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  32.99 
 
 		 187 aa  97.8  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  34.9 
 
 		 186 aa  96.3  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  33.68 
 
 		 182 aa  95.5  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  34.03 
 
 		 186 aa  95.1  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  33.84 
 
 		 187 aa  94.7  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  32.97 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  35.18 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  30.69 
 
 		 187 aa  94.4  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  31.47 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  29.84 
 
 		 171 aa  92.8  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  36.79 
 
 		 184 aa  92.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  32.65 
 
 		 185 aa  91.3  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  33.51 
 
 		 179 aa  90.1  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  36.27 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  32.64 
 
 		 178 aa  89.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  32.64 
 
 		 194 aa  90.5  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  32.82 
 
 		 182 aa  88.2  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  30.54 
 
 		 193 aa  87.8  9e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  29.32 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0158  2'-5' RNA ligase  34.2 
 
 		 176 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0758236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0156  2'-5' RNA ligase  33.68 
 
 		 176 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.177994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  32.81 
 
 		 183 aa  85.9  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  34.72 
 
 		 183 aa  85.5  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  30.96 
 
 		 193 aa  85.1  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  37.88 
 
 		 194 aa  84.7  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3455  2'-5' RNA ligase  33.68 
 
 		 176 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00917798  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0151  2'-5' RNA ligase  33.68 
 
 		 176 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000646366  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  29.69 
 
 		 184 aa  84.3  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0150  2'-5' RNA ligase  33.68 
 
 		 176 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345552  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00146  2'-5' RNA ligase  33.68 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00154345  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  33.16 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00145  hypothetical protein  33.68 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  29.24 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  32.31 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5904  2'-5' RNA ligase  39.71 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.230551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0138  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0169609  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  34.39 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  32.98 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  35.16 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  37 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  30.96 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1034  2'-5' RNA ligase  33.51 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.427005  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  37 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  33.73 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  31.63 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  30.52 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  34.74 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  31.79 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  34.36 
 
 		 180 aa  80.9  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  26.32 
 
 		 174 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3512  2'-5' RNA ligase  32.64 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0807667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  31.63 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  29.87 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  35.29 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1741  2'-5' RNA ligase  33.67 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000285675 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2817  2'-5' RNA ligase  31.25 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.433451  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  26.46 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  30.52 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0746  2'-5' RNA ligase  33.5 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.836735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  32.63 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  28.27 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0189  2'-5' RNA ligase  33.16 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0810981  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0533  2',5' RNA ligase  32.81 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.883714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2724  2'-5' RNA ligase  32.67 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  36.84 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  30.05 
 
 		 181 aa  77  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  33.84 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  25 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0390  putative 2'-5' RNA ligase  32.79 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117956  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  29.63 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1484  2'-5' RNA ligase  24.87 
 
 		 173 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  29.23 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0821  2'-5' RNA ligase  32.99 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  38.24 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  31.44 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  29.1 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4453  2'-5' RNA ligase  31.85 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0417  2',5' RNA ligase  32.79 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1238  2'-5' RNA ligase  34.32 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  29.77 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0370  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0687  2'-5' RNA ligase  32.64 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00185494  normal  0.60336 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  28.65 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2212  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4435  2'-5' RNA ligase  31.11 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  31.31 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  38.81 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0421  putative 2'-5' RNA ligase family protein  30.37 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1939  2'-5' RNA ligase  32.33 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.33767  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4820  putative 2'-5' RNA ligase family protein  30.37 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1013  2'-5' RNA ligase  32.81 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.184793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>