206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1939 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1939  2'-5' RNA ligase  100 
 
 
181 aa  372  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.33767  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02479  3'-5' RNA ligase  39.05 
 
 
173 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1002  2'-5' RNA ligase  36.05 
 
 
176 aa  99.8  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000523375  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  32.58 
 
 
182 aa  96.3  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  30.81 
 
 
183 aa  91.7  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  32.28 
 
 
183 aa  89.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  35.66 
 
 
184 aa  84.3  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  34.88 
 
 
184 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  30.56 
 
 
194 aa  82  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  33.08 
 
 
184 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  31.82 
 
 
193 aa  77  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2125  2',5' RNA ligase  29.94 
 
 
195 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  30.06 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  30.06 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  28.9 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  32.33 
 
 
190 aa  74.7  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  27.43 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  29.89 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  31.06 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  29.09 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  28.79 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  27.13 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  25.14 
 
 
186 aa  72  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  28.36 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  31.06 
 
 
200 aa  72  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  30.53 
 
 
201 aa  72  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  25 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  29.85 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2212  2'-5' RNA ligase  29.01 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1290  2'-5' RNA ligase  30.49 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189928  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  29.55 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  30.61 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  31.16 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5914  2,5 RNA ligase  33.08 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.720477 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1286  2'-5' RNA ligase  27.61 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.757621  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1005  2',5' RNA ligase  28.47 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0968272  normal  0.0378462 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  26.09 
 
 
181 aa  67.4  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  26.54 
 
 
181 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0923  2',5' RNA ligase  27.81 
 
 
177 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  25.3 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0205  2'-5' RNA ligase  29.51 
 
 
176 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  27.16 
 
 
181 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0158  2'-5' RNA ligase  27.87 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0758236  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3240  2',5' RNA ligase  30.3 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  32.31 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  26.52 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0216  2'-5' RNA ligase  29.51 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00146  2'-5' RNA ligase  27.32 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00154345  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  26.4 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  28.24 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0869  2'-5' RNA ligase  27.27 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00145  hypothetical protein  27.32 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  32.12 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  24.34 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1166  2'-5' RNA ligase  27.27 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3455  2'-5' RNA ligase  27.27 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00917798  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  30.47 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  28.65 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0151  2'-5' RNA ligase  27.27 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000646366  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0220  2'-5' RNA ligase  28.65 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0222  2'-5' RNA ligase  28.65 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.367161  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0150  2'-5' RNA ligase  27.27 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345552  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  24.81 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  24.81 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  27.65 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5153  2'-5' RNA ligase  25 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198908  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0687  2'-5' RNA ligase  29.51 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00185494  normal  0.60336 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2817  2'-5' RNA ligase  27.17 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.433451  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  29.23 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0204  2'-5' RNA ligase  28.65 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0421  putative 2'-5' RNA ligase family protein  25.95 
 
 
181 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0156  2'-5' RNA ligase  27.27 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.177994  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0528  2',5' RNA ligase  28.68 
 
 
178 aa  64.3  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0080  2'-5' RNA ligase  26.67 
 
 
202 aa  64.3  0.0000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.91428  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  26.97 
 
 
186 aa  63.9  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3512  2'-5' RNA ligase  26.74 
 
 
176 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0807667  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  27.48 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  27.91 
 
 
183 aa  63.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0138  2'-5' RNA ligase  26.88 
 
 
176 aa  63.5  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0169609  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1975  2',5' RNA ligase  28.68 
 
 
193 aa  63.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  28.46 
 
 
189 aa  63.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0184  2',5' RNA ligase  28.25 
 
 
185 aa  62.8  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2724  2'-5' RNA ligase  25.41 
 
 
190 aa  63.2  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  26.52 
 
 
186 aa  62.8  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4435  2'-5' RNA ligase  25.32 
 
 
181 aa  62.4  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4453  2'-5' RNA ligase  25.32 
 
 
181 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4598  2'-5' RNA ligase family protein  27.71 
 
 
181 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4955  2'-5' RNA ligase family protein  27.71 
 
 
181 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2842  2',5' RNA ligase  32.58 
 
 
180 aa  62  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4820  putative 2'-5' RNA ligase family protein  27.71 
 
 
181 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  36.96 
 
 
177 aa  62  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4995  2'-5' RNA ligase  26.44 
 
 
178 aa  62  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  25.14 
 
 
204 aa  62  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1580  2'-5' RNA ligase  30 
 
 
181 aa  61.6  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5904  2'-5' RNA ligase  25 
 
 
298 aa  61.6  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.230551  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  24.4 
 
 
196 aa  60.8  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0746  2'-5' RNA ligase  25.77 
 
 
170 aa  60.5  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.836735  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  23.24 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  27.17 
 
 
178 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>