203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2212 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2212  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 186 aa  365  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1005  2',5' RNA ligase  47.93 
 
 		 183 aa  141  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0968272  normal  0.0378462 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2125  2',5' RNA ligase  38.12 
 
 		 195 aa  123  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1975  2',5' RNA ligase  44 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0386  2'-5' RNA ligase, putative  42.14 
 
 		 190 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3240  2',5' RNA ligase  41.32 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0923  2',5' RNA ligase  38.1 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2563  2'-5' RNA ligase  42.69 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043811  hitchhiker  0.0000000000000955583 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0512  2'-5' RNA ligase  42.44 
 
 		 182 aa  98.2  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504657 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1034  2'-5' RNA ligase  37.36 
 
 		 177 aa  96.7  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.427005  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23030  2-5 RNA ligase protein  38.95 
 
 		 176 aa  95.5  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1286  2'-5' RNA ligase  39.64 
 
 		 188 aa  95.5  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.757621  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0158  2'-5' RNA ligase  36.57 
 
 		 176 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0758236  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00146  2'-5' RNA ligase  36 
 
 		 176 aa  91.7  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00154345  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00145  hypothetical protein  36 
 
 		 176 aa  91.7  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0847  2'-5' RNA ligase  36.97 
 
 		 173 aa  91.3  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0724174  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3455  2'-5' RNA ligase  36 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00917798  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0151  2'-5' RNA ligase  36 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000646366  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0138  2'-5' RNA ligase  36 
 
 		 176 aa  90.1  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0169609  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0150  2'-5' RNA ligase  36 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345552  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0156  2'-5' RNA ligase  36 
 
 		 176 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.177994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3512  2'-5' RNA ligase  35.43 
 
 		 176 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0807667  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2817  2'-5' RNA ligase  34.5 
 
 		 176 aa  87.8  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.433451  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  37.08 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0687  2'-5' RNA ligase  34.66 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00185494  normal  0.60336 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27110  2'-5' RNA ligase  41.95 
 
 		 182 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3466  2'-5' RNA ligase  34.71 
 
 		 191 aa  84.3  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3336  2'-5' RNA ligase  34.71 
 
 		 191 aa  84.3  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00058753  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1002  2'-5' RNA ligase  34.71 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.018778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1982  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6095  2',5' RNA ligase  33.33 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0652023  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3983  2'-5' RNA ligase  32.94 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000701591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0216  2'-5' RNA ligase  35.29 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0222  2'-5' RNA ligase  35.29 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.367161  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0220  2'-5' RNA ligase  35.29 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0204  2'-5' RNA ligase  35.29 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0205  2'-5' RNA ligase  35.29 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2006  2'-5' RNA ligase  32.4 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  35.71 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  36.67 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1166  2'-5' RNA ligase  32.56 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.280308  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02479  3'-5' RNA ligase  28.07 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  33.33 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3112  2'-5' RNA ligase  31.95 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2116  2',5' RNA ligase  33.52 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529013  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0487  2'-5' RNA ligase  30.29 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1161  2'-5' RNA ligase  39.64 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.274053  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  36.26 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3126  2'-5' RNA ligase  30.81 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1939  2'-5' RNA ligase  29.01 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.33767  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00469  2,5 RNA ligase  34.07 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  38.31 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1002  2'-5' RNA ligase  32.31 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000523375  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1635  2'-5' RNA ligase  34.13 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.44124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  30.73 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  34.76 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  32.95 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  35.96 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0746  2'-5' RNA ligase  30.68 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.836735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2064  2'-5' RNA ligase  33.89 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  26.46 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  31.79 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  32.95 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2424  2'-5' RNA ligase  33.71 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3075  2'-5' RNA ligase  33.15 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  32.22 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2842  2',5' RNA ligase  38.82 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  32.58 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3271  2'-5' RNA ligase  33.71 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1290  2'-5' RNA ligase  33.85 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1443  putative ligase protein  33.51 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  30.05 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2482  2'-5' RNA ligase  33.88 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.097083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  30.72 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2974  putative 2'-5' RNA ligase  28.37 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01767  2'-5' RNA ligase  34.25 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.680529  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1760  2'-5' RNA ligase  26.09 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.907021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1946  2',5' RNA ligase  28.92 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3712  2'-5' RNA ligase  33.71 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  32.95 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0370  hypothetical protein  32.87 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2732  hypothetical protein  33.15 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1384  2'-5' RNA ligase  30.22 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.605515  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  36.36 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3219  hypothetical protein  33.15 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1770  hypothetical protein  33.15 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3686  2'-5' RNA ligase  33.15 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2784  2'-5' RNA ligase  33.15 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1426  2',5' RNA ligase  31.28 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0723245  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  35.29 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  31.08 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3743  2'-5' RNA ligase  32.58 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  36.49 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  36.49 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3011  2'-5' RNA ligase  32.45 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2421  2',5' RNA ligase  31.28 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0368864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  32.68 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  31.15 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>