220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0243 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  100 
 
 		 182 aa  357  6e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  46.15 
 
 		 196 aa  145  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  40.74 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3287  2'-5' RNA ligase  43.33 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  39.56 
 
 		 190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0111  2'-5' RNA ligase  41.27 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0826  2'-5' RNA ligase  40.86 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0821  2'-5' RNA ligase  41.21 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  29.03 
 
 		 189 aa  95.9  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8791  2'-5' RNA ligase  36.87 
 
 		 215 aa  95.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1628  2'-5' RNA ligase  42.86 
 
 		 222 aa  90.5  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.709746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2113  2'-5' RNA ligase  39.44 
 
 		 168 aa  89  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0440288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  29.1 
 
 		 193 aa  84.3  8e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1659  2'-5' RNA ligase  31.58 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000321406  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  35.83 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  29.57 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  35.52 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  34.41 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  37.21 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  36.57 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  31.33 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  34.71 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  35.33 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  26.59 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  34.3 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  37.78 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  30 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  32.41 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  27.53 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  29.63 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0679  2'-5' RNA ligase  35.1 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5825  2'-5' RNA ligase  36.09 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  29.63 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  27.07 
 
 		 181 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0421  putative 2'-5' RNA ligase family protein  29.51 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17160  2'-5' RNA ligase  34.48 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0177806  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  37.5 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  30.83 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  30.77 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2724  2'-5' RNA ligase  34.36 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  25.95 
 
 		 174 aa  72  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0420  2'-5' RNA ligase  33.51 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  26.52 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  32.26 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0508  2'-5' RNA ligase  34.17 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.170013  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  28.09 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  38.16 
 
 		 194 aa  70.9  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4598  2'-5' RNA ligase family protein  27.87 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4435  2'-5' RNA ligase  27.87 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4955  2'-5' RNA ligase family protein  27.87 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  27.51 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  38.57 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5848  2'-5' RNA ligase  31.82 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  38.16 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4820  putative 2'-5' RNA ligase family protein  27.87 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4453  2'-5' RNA ligase  28.18 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  32.42 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0081  2'-5' RNA ligase  33.16 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  25.41 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  31.43 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  35.06 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  23.78 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  24.46 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5904  2'-5' RNA ligase  38.53 
 
 		 298 aa  68.6  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.230551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  24.46 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0084  hypothetical protein  33.16 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.514694  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1166  2'-5' RNA ligase  31.11 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0869  2'-5' RNA ligase  31.11 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  30.15 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  30.54 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0096  2'-5' RNA ligase  32.8 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14670  2'-5' RNA ligase  35.29 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.346276  normal  0.71286 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  34.05 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  35.68 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  28.8 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  40.19 
 
 		 186 aa  67.4  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  32.84 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  37.59 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  21.64 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  25 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5914  2,5 RNA ligase  37.96 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.720477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4995  2'-5' RNA ligase  38.64 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  34.91 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7219  2'-5' RNA ligase  37.18 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.179856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1238  2'-5' RNA ligase  31.75 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  36.96 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1320  2'-5' RNA ligase  37.41 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.167347  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  35.11 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  29.24 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  27.32 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  33.08 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  33.33 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  36.09 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1484  2'-5' RNA ligase  23.81 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  34.81 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0528  2',5' RNA ligase  37.31 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19240  2'-5' RNA ligase  35.34 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0390929 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  33.55 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  30.57 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>