171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0512 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0512  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 182 aa  354  5e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504657 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0847  2'-5' RNA ligase  49.4 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0724174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2212  2'-5' RNA ligase  43.02 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0923  2',5' RNA ligase  39.41 
 
 		 177 aa  99  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0386  2'-5' RNA ligase, putative  45.88 
 
 		 190 aa  97.8  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2116  2',5' RNA ligase  40.94 
 
 		 179 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529013  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1005  2',5' RNA ligase  39.01 
 
 		 183 aa  89.4  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0968272  normal  0.0378462 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1286  2'-5' RNA ligase  44.2 
 
 		 188 aa  89.4  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.757621  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  39.05 
 
 		 184 aa  84.7  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2424  2'-5' RNA ligase  38.1 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2064  2'-5' RNA ligase  38.69 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3271  2'-5' RNA ligase  38.82 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23030  2-5 RNA ligase protein  38.55 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3075  2'-5' RNA ligase  38.6 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1975  2',5' RNA ligase  38.42 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2125  2',5' RNA ligase  34.62 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3240  2',5' RNA ligase  38.95 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  39.75 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3126  2'-5' RNA ligase  33.53 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2563  2'-5' RNA ligase  39.08 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043811  hitchhiker  0.0000000000000955583 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0156  2'-5' RNA ligase  35.2 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.177994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1161  2'-5' RNA ligase  42.11 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.274053  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3983  2'-5' RNA ligase  32.57 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000701591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  37.88 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00146  2'-5' RNA ligase  35.75 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00154345  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0158  2'-5' RNA ligase  37.75 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0758236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0138  2'-5' RNA ligase  37.75 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0169609  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00145  hypothetical protein  35.75 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3455  2'-5' RNA ligase  37.75 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00917798  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0150  2'-5' RNA ligase  37.75 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345552  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0151  2'-5' RNA ligase  37.75 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000646366  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5914  2,5 RNA ligase  34.38 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.720477 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1034  2'-5' RNA ligase  33.71 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.427005  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  36.81 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3512  2'-5' RNA ligase  37.09 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0807667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  34.84 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0687  2'-5' RNA ligase  33.54 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00185494  normal  0.60336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0528  2',5' RNA ligase  37.31 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  35.37 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2817  2'-5' RNA ligase  34.81 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.433451  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0220  2'-5' RNA ligase  34.29 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0205  2'-5' RNA ligase  34.29 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0222  2'-5' RNA ligase  34.29 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.367161  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0216  2'-5' RNA ligase  34.29 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0204  2'-5' RNA ligase  34.29 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3112  2'-5' RNA ligase  33.73 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4995  2'-5' RNA ligase  31.79 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1982  2'-5' RNA ligase  34.29 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6095  2',5' RNA ligase  33.71 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0652023  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2006  2'-5' RNA ligase  33.91 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  33.86 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1166  2'-5' RNA ligase  31.95 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.280308  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  34.59 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  32.02 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3466  2'-5' RNA ligase  32 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3336  2'-5' RNA ligase  32 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00058753  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1002  2'-5' RNA ligase  31.76 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.018778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  36.17 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  28.81 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1013  2'-5' RNA ligase  31.28 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.184793 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2732  hypothetical protein  38.41 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3712  2'-5' RNA ligase  38.41 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3219  hypothetical protein  38.41 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1770  hypothetical protein  38.41 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3686  2'-5' RNA ligase  38.41 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3743  2'-5' RNA ligase  38.41 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2784  2'-5' RNA ligase  38.41 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  27.13 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  33.59 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0096  2'-5' RNA ligase  33.13 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  35.43 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0326  2'-5' RNA ligase  40.6 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02479  3'-5' RNA ligase  26.86 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0084  hypothetical protein  32.72 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.514694  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3503  2',5' RNA ligase  40 
 
 		 192 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.968383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  30.88 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  33.78 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1384  2'-5' RNA ligase  30.99 
 
 		 222 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.605515  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3410  2'-5' RNA ligase  33.01 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0816673  normal  0.509514 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27110  2'-5' RNA ligase  37.57 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2842  2',5' RNA ligase  34.81 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1946  2',5' RNA ligase  29.82 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19240  2'-5' RNA ligase  34.18 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0390929 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2974  putative 2'-5' RNA ligase  27.03 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1760  2'-5' RNA ligase  27.34 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.907021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1635  2'-5' RNA ligase  35.12 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.44124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00469  2,5 RNA ligase  29.37 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  29.41 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1290  2'-5' RNA ligase  32.07 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0619  2'-5' RNA ligase  32.04 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000149987  normal  0.458394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  29.38 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  28.83 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0184  2',5' RNA ligase  31.01 
 
 		 185 aa  52  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0487  2'-5' RNA ligase  25.7 
 
 		 176 aa  52  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0620  2'-5' RNA ligase  26.92 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.5382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0081  2'-5' RNA ligase  32.1 
 
 		 196 aa  52  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  35.44 
 
 		 182 aa  51.6  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2442  2',5' RNA ligase  32.5 
 
 		 196 aa  51.6  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1002  2'-5' RNA ligase  26.87 
 
 		 176 aa  51.6  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000523375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>