207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4995 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4995  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 178 aa  359  9e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  47.73 
 
 		 183 aa  161  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  43.5 
 
 		 179 aa  138  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  40.11 
 
 		 182 aa  134  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  44.63 
 
 		 199 aa  128  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  39.55 
 
 		 197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  39.55 
 
 		 197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1013  2'-5' RNA ligase  41.34 
 
 		 179 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.184793 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  39.55 
 
 		 195 aa  121  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1922  2'-5' RNA ligase  39.89 
 
 		 177 aa  121  7e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0832  2'-5' RNA ligase  38.76 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.658836  normal  0.059604 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  37.29 
 
 		 199 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  36.72 
 
 		 184 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4476  2'-5' RNA ligase  41.34 
 
 		 191 aa  117  9e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0283  2',5' RNA ligase  39.55 
 
 		 188 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277228 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  38.42 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  37.79 
 
 		 184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1775  2'-5' RNA ligase  41.67 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0096  2'-5' RNA ligase  38.98 
 
 		 196 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0533  2',5' RNA ligase  38.42 
 
 		 178 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.883714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5472  2'-5' RNA ligase  43.33 
 
 		 180 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  37.85 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0408  2'-5' RNA ligase  42.37 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  37.21 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  41.14 
 
 		 204 aa  108  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0081  2'-5' RNA ligase  38.98 
 
 		 196 aa  108  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0084  hypothetical protein  38.98 
 
 		 196 aa  108  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.514694  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0390  putative 2'-5' RNA ligase  38.98 
 
 		 179 aa  107  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117956  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0189  2'-5' RNA ligase  38.2 
 
 		 179 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0810981  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3995  2'-5' RNA ligase  37.57 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173651  normal  0.591095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4364  2'-5' RNA ligase  37.57 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  37.29 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  32.58 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  36.52 
 
 		 179 aa  104  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0261  2'-5' RNA ligase  34.64 
 
 		 179 aa  101  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00684061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  39.44 
 
 		 184 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0417  2',5' RNA ligase  36.52 
 
 		 178 aa  100  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  36.87 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  38.89 
 
 		 184 aa  98.6  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5914  2,5 RNA ligase  38.59 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.720477 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  34.12 
 
 		 184 aa  95.9  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  34.64 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  36.11 
 
 		 183 aa  93.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  32.58 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  31.07 
 
 		 189 aa  87.8  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  32.09 
 
 		 188 aa  85.1  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  31.07 
 
 		 179 aa  84.3  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  29.38 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  31.03 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  32.33 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  31.43 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  32.54 
 
 		 188 aa  74.3  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  31.22 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  34.88 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  27.17 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  28.42 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  30.43 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  29.35 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  28.18 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  25.43 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1636  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0528  2',5' RNA ligase  29.28 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  31.88 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  29.94 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  28.65 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  28.68 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0421  putative 2'-5' RNA ligase family protein  27.53 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  27.72 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  27.17 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8791  2'-5' RNA ligase  40.78 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  31.32 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  28.18 
 
 		 181 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1939  2'-5' RNA ligase  26.44 
 
 		 181 aa  62  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.33767  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  25.29 
 
 		 174 aa  62  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  38.64 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  31.58 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  30.9 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4598  2'-5' RNA ligase family protein  29.21 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4453  2'-5' RNA ligase  29.21 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4955  2'-5' RNA ligase family protein  29.21 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1760  2'-5' RNA ligase  26.9 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.907021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4820  putative 2'-5' RNA ligase family protein  29.21 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  30.08 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1484  2'-5' RNA ligase  24.16 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4435  2'-5' RNA ligase  29.21 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2724  2'-5' RNA ligase  33.55 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0857  2'-5' RNA ligase  31.35 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.358243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  27.07 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  30.71 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  22.53 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3126  2'-5' RNA ligase  28.8 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  26.85 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  28.26 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  29.79 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00469  2,5 RNA ligase  31.54 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  25 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  25.95 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5904  2'-5' RNA ligase  30.1 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.230551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0111  2'-5' RNA ligase  35.25 
 
 		 190 aa  57  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  24.57 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>