126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_3712 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_3712  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 186 aa  357  7e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2732  hypothetical protein  98.92 
 
 		 186 aa  353  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3219  hypothetical protein  98.92 
 
 		 186 aa  353  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1770  hypothetical protein  98.92 
 
 		 186 aa  353  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3686  2'-5' RNA ligase  98.92 
 
 		 186 aa  353  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3743  2'-5' RNA ligase  98.92 
 
 		 186 aa  353  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2784  2'-5' RNA ligase  98.92 
 
 		 186 aa  353  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3011  2'-5' RNA ligase  88.52 
 
 		 184 aa  304  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0326  2'-5' RNA ligase  56.25 
 
 		 182 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0308  2'-5' RNA ligase  56.04 
 
 		 191 aa  157  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0335  2'-5' RNA ligase  56.25 
 
 		 182 aa  148  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19642 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3503  2',5' RNA ligase  53.3 
 
 		 192 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.968383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0384  2'-5' RNA ligase  53.3 
 
 		 194 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.891424 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2702  2',5' RNA ligase  52.75 
 
 		 194 aa  134  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0405  2'-5' RNA ligase  52.75 
 
 		 194 aa  134  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2786  2'-5' RNA ligase  46.37 
 
 		 214 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  36.05 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  32.22 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  30 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  30.86 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  35.14 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  31.03 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  25.58 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  33.9 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  31.64 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  28.42 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2364  hypothetical protein  32.14 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  31.36 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  32.48 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  31.25 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0528  2',5' RNA ligase  31.94 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3240  2',5' RNA ligase  32.97 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3126  2'-5' RNA ligase  28.73 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2212  2'-5' RNA ligase  33.52 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  22.91 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  32.91 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  29.28 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0370  hypothetical protein  31.82 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  29.35 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0184  2',5' RNA ligase  25.79 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5848  2'-5' RNA ligase  36.62 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2064  2'-5' RNA ligase  32.52 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  33.52 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  23.67 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  22.35 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0512  2'-5' RNA ligase  38.24 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504657 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  31.5 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  21.79 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4995  2'-5' RNA ligase  28.48 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  21.48 
 
 		 182 aa  52  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  22.49 
 
 		 171 aa  51.6  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  31.72 
 
 		 189 aa  51.6  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3896  2'-5' RNA ligase  27.72 
 
 		 224 aa  51.2  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0415456  normal  0.638884 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5914  2,5 RNA ligase  31.21 
 
 		 188 aa  51.2  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.720477 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1005  2',5' RNA ligase  38.17 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0968272  normal  0.0378462 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5153  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198908  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5472  2'-5' RNA ligase  31.68 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1760  2'-5' RNA ligase  24.16 
 
 		 174 aa  50.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.907021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  29.25 
 
 		 183 aa  49.3  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  29.69 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1775  2'-5' RNA ligase  30.06 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  28.65 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  25.98 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1002  2'-5' RNA ligase  23.18 
 
 		 176 aa  48.9  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000523375  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  26.85 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2424  2'-5' RNA ligase  31.29 
 
 		 181 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  31.18 
 
 		 184 aa  48.5  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2724  2'-5' RNA ligase  32.66 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  23.36 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  30.65 
 
 		 184 aa  48.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  23.96 
 
 		 193 aa  48.1  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3271  2'-5' RNA ligase  30.67 
 
 		 181 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1238  2'-5' RNA ligase  28.65 
 
 		 186 aa  47.8  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2412  hypothetical protein  26.67 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  34.17 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  22.8 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  28.04 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1484  2'-5' RNA ligase  19.89 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  30.54 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  22.58 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2125  2',5' RNA ligase  26.61 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  23.13 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2842  2',5' RNA ligase  31.58 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1728  2'-5' RNA ligase  34.26 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.747406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0923  2',5' RNA ligase  28.86 
 
 		 177 aa  46.2  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0760  2'-5' RNA ligase  28.95 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  28.77 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02479  3'-5' RNA ligase  24.64 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0080  2'-5' RNA ligase  20.21 
 
 		 202 aa  45.8  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.91428  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19240  2'-5' RNA ligase  29.55 
 
 		 174 aa  46.2  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0390929 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1166  2'-5' RNA ligase  25.27 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0869  2'-5' RNA ligase  25.27 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2116  2',5' RNA ligase  29.63 
 
 		 179 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529013  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  24.82 
 
 		 190 aa  45.1  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0386  2'-5' RNA ligase, putative  29.28 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2556  hypothetical protein  25.19 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  27.46 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  32.85 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  27.54 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1002  2'-5' RNA ligase  28 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.018778  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>