195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2724 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2724  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 190 aa  377  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  58.42 
 
 		 185 aa  204  6e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  56.32 
 
 		 187 aa  200  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1238  2'-5' RNA ligase  54.21 
 
 		 186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  51.85 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  32.63 
 
 		 171 aa  105  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  36.36 
 
 		 183 aa  104  8e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  32.8 
 
 		 182 aa  101  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  28.8 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  26.98 
 
 		 171 aa  99  4e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  29.02 
 
 		 174 aa  98.2  6e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  33.68 
 
 		 184 aa  98.2  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1484  2'-5' RNA ligase  29.53 
 
 		 173 aa  97.8  9e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  31.35 
 
 		 187 aa  96.3  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  34.41 
 
 		 181 aa  96.3  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1580  2'-5' RNA ligase  32.98 
 
 		 181 aa  95.5  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  27.84 
 
 		 174 aa  95.5  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  33.51 
 
 		 186 aa  94  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  34.39 
 
 		 179 aa  93.2  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  28.72 
 
 		 194 aa  92.8  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  36.46 
 
 		 177 aa  92.4  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  31.96 
 
 		 189 aa  92  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  31.09 
 
 		 194 aa  91.7  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  33.51 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  31.52 
 
 		 180 aa  90.9  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  33.51 
 
 		 179 aa  90.9  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  31.44 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  32.62 
 
 		 190 aa  89.4  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  30.26 
 
 		 186 aa  88.2  6e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  31.46 
 
 		 184 aa  88.6  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  32.65 
 
 		 187 aa  88.2  7e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  35.94 
 
 		 179 aa  87.8  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  32.62 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  28.72 
 
 		 193 aa  86.3  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  36.36 
 
 		 180 aa  86.3  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  24.61 
 
 		 189 aa  85.5  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  32.67 
 
 		 190 aa  85.5  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  32.47 
 
 		 200 aa  85.5  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  29.1 
 
 		 184 aa  85.5  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  27.18 
 
 		 193 aa  84.7  8e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  30.57 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  28.34 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  31.44 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  36.3 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  27 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  29.78 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  30.77 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  30.53 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  30.89 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  30.41 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  28.21 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  34.9 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  30.53 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  30.73 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  32.11 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1741  2'-5' RNA ligase  31.89 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000285675 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  32.43 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  33.16 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  29.59 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  32.65 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  26.67 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  31.43 
 
 		 189 aa  72  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0390  putative 2'-5' RNA ligase  34.23 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117956  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  31.41 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  32.21 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  30.1 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  29.67 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  30 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  30 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  31.29 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  27.03 
 
 		 194 aa  67.8  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1636  2'-5' RNA ligase  26.4 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0533  2',5' RNA ligase  28.8 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.883714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3995  2'-5' RNA ligase  35.12 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173651  normal  0.591095 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0746  2'-5' RNA ligase  30.61 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.836735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0857  2'-5' RNA ligase  30.21 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.358243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1922  2'-5' RNA ligase  30.69 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4476  2'-5' RNA ligase  33.75 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1939  2'-5' RNA ligase  25.67 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.33767  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4364  2'-5' RNA ligase  34.52 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  26.26 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0283  2',5' RNA ligase  29.32 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277228 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2137  2',5' RNA ligase  29.53 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  26.88 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  26.18 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0189  2'-5' RNA ligase  31.91 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0810981  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3240  2',5' RNA ligase  32.09 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  26.88 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1707  2'-5' RNA ligase  31.44 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.553995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  32.32 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  27.51 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  29.63 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  26.2 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4995  2'-5' RNA ligase  31.61 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  29.47 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  32.26 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  31.61 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0904  2'-5' RNA ligase  36.52 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0022796 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>