203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1647 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 183 aa  372  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  48.09 
 
 		 183 aa  177  8e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  38.98 
 
 		 188 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  41.21 
 
 		 182 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  31.35 
 
 		 190 aa  99.4  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  30.89 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  30.16 
 
 		 193 aa  95.9  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1939  2'-5' RNA ligase  30.81 
 
 		 181 aa  91.7  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.33767  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  31.15 
 
 		 189 aa  91.3  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 188 aa  85.5  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  29.83 
 
 		 189 aa  84.7  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  29.19 
 
 		 194 aa  84.3  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  31.35 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  30.3 
 
 		 195 aa  80.9  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  30.11 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  30.43 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  30.6 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  35.82 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  27.38 
 
 		 193 aa  77.8  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  30.15 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0869  2'-5' RNA ligase  30.22 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  30.29 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  30.29 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1166  2'-5' RNA ligase  30.22 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  30.3 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  31.32 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  29.38 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  28.41 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1636  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5904  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 298 aa  74.3  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.230551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1157  2'-5' RNA ligase  29.73 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  30.9 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  28.19 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  29.32 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1002  2'-5' RNA ligase  27.93 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000523375  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  28.68 
 
 		 187 aa  70.9  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  31.85 
 
 		 179 aa  70.9  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02479  3'-5' RNA ligase  26.67 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  30.08 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  29.19 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  25.13 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  29.55 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  33.08 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1290  2'-5' RNA ligase  30.88 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189928  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  24.55 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  31.43 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  28.42 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  23.66 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  21.64 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  30.6 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  25.84 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  25.27 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  26.09 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  22.99 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  23.33 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  23.81 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  26.52 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2116  2',5' RNA ligase  29.71 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529013  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  27.81 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  28.03 
 
 		 184 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  29.85 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  29.77 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  27.72 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3512  2'-5' RNA ligase  30.97 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0807667  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  28.15 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0832  2'-5' RNA ligase  29.14 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.658836  normal  0.059604 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  30.6 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  29.1 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  26.79 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1238  2'-5' RNA ligase  28.79 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  27.32 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1580  2'-5' RNA ligase  29.85 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0158  2'-5' RNA ligase  29.68 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0758236  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3455  2'-5' RNA ligase  29.68 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00917798  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0151  2'-5' RNA ligase  29.68 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000646366  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0417  2',5' RNA ligase  29.52 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0156  2'-5' RNA ligase  29.68 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.177994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0138  2'-5' RNA ligase  29.68 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0169609  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0080  2'-5' RNA ligase  24.19 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.91428  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1922  2'-5' RNA ligase  28.03 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0679  2'-5' RNA ligase  29.2 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0150  2'-5' RNA ligase  29.68 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  22.37 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00146  2'-5' RNA ligase  29.68 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00154345  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  34.65 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00145  hypothetical protein  29.68 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  28.26 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  30.37 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  34.65 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2137  2',5' RNA ligase  25.37 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1013  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.184793 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  25.95 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  26.06 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  27.96 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  33.66 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  27.71 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>